Dernière mise à jour le 17 avril 2025
Avec le lancement il y a bientôt 4 ans de la Stratégie d’Accélération « Maladies Infectieuses Émergentes et Menaces Nucléaires, Radiologiques, Biologiques et Chimiques » (SA MIE MN) dans le cadre du plan France 2030, le gouvernement réaffirme son engagement en faveur de la prévention et du contrôle des maladies infectieuses émergentes et ré-émergentes. La stratégie a permis de financer plusieurs programmes de recherche à travers des appels à projets, de soutenir des plateformes de démonstration et de validation de contre-mesures, de renforcer la formation autour des MIE via des écoles universitaires de recherche, et de financer le développement d’innovations afin d’anticiper une future crise sanitaire.
Le Programme et Équipement Prioritaire de Recherche (PEPR) Maladies Infectieuses Émergentes (MIE) s’inscrit dans cette démarche et constitue, conjointement au PEPR PREZODE dédié aux maladies zoonotiques, l’outil de financement privilégié des projets de recherche scientifique sur ces thématiques.
Dans le cadre du PEPR MIE, l’ANRS MIE a lancé en 2023 son premier appel à projets permettant de financer 11 projets de recherche pour un montant total d’environ 22 millions d’euros.
Poursuivant cette dynamique, un second appel à projets a été lancé en 2024, sur les mêmes principes que celui de 2023. Les chercheurs ont été ainsi invités à soumettre des projets interdisciplinaires s’inscrivant dans l’un des trois volets fondateurs du PEPR MIE :
À l’issue de l’évaluation par un jury d’experts internationaux, 9 projets de recherche multidisciplinaires et collaboratifs ont été sélectionnés parmi les 27 projets éligibles. Ils vont bénéficier à ce titre d’un financement France 2030 d’un montant total de près de 16 millions. Ces projets de recherche contribueront à générer des connaissances permettant de mieux prévenir et contrôler les maladies infectieuses émergentes et ré-émergentes, tant au niveau individuel que collectif.
Chaque projet est mené par un consortium interdisciplinaire, constitué de 4 à 20 équipes possédant des expertises complémentaires et menées par un coordinateur. Les équipes complètes sont détaillées dans l’annexe 2.
VOLET 1 – Accélérer l’acquisition de connaissances sur les maladies infectieuses émergentes
ArboRetro – Coordinateur : SALEH Carla (Institut Pasteur)
Le projet Arboretro (Rendre les moustiques intolérants aux infections par les arbovirus en manipulant les rétrotransposons) vise à exploiter le mécanisme de tolérance virale des moustiques afin de rendre les moustiques intolérants aux arbovirus, entravant ainsi leur rôle de vecteurs. Le projet ouvrira la voie à une stratégie durable et efficace pour contrôler les arbovirus transmis par les moustiques, réduisant ainsi leur impact sur la santé mondiale.
Montant d’aide France 2030 : 2 138 954M€
VERTICAL – Coordinateur : MALNOU Cécile (Inserm Toulouse)
Le projet VERTICAL (Caractérisation mécanistique de nouveaux facteurs de l’hôtes et viraux pour des interventions thérapeutiques ciblant la transmission transplacentaire des Flavivirus), proposera de nouvelles pistes d’interventions pour anticiper le risque sanitaire des infections congénitales à Orthoflavivirus lors des futures potentielles épidémies. Le projet décryptera les mécanismes d’action des facteurs hôtes et viraux qui influencent les infections transplacentaires d’orthoflavivirus via les EV (vésicules extracellulaires) et appliquera ces connaissances pour développer de nouvelles interventions thérapeutiques ciblant la transmission verticale des orthoflavivirus. Le projet permettra de se préparer à d’éventuelles épidémies d’Orthoflavivirus et de proposer des interventions thérapeutiques ciblées pour limiter la transmission verticale.
Montant d’aide France 2030 : 1 105 126M€
SURVI3 – Coordinateur : DE PROST Nicolas (APHP DRCD)
Le projet SURVI3 (Infections Respiratoires Virales Sévères en Réanimation : Approche Intégrative et Translationnelle pour la Préparation des Futures Ré-émergences et Emergences), a pour objectif de caractériser les déterminants biologiques de différentes formes d’infections virales respiratoires sévères, en identifiant des sous-groupes de patients de soins critiques à partir de caractéristiques communes, comprenant des variables cliniques et des biomarqueurs biologiques. Le projet SURVI3 aura pour ambition de caractériser de façon extensive les mécanismes sous-jacents aux sous-classes d’infections respiratoires sévères en réanimation en utilisant des approches intégratives et translationnelles. La méthodologie utilisée permettra d’identifier des endotypes et/ou des phénotypes dérivés de biomarqueurs clinico biologiques chez des patients en état critique, associés à des pronostics différents, afin de dessiner des stratégies de médecine personnalisée.
Montant d’aide France 2030 : 2 242 779M€
ViroBrain – Coordinateur : GAUDIN Raphael (CNRS Languedoc)
Le projet ViroBrain (Impact des infections virales émergentes sur les fonctions cérébrales), vise à établir un workflow pour l’évaluation de l’impact des infections virales sur les fonctions cérébrales, en mettant l’accent sur les arbovirus émergents/réémergents et les virus respiratoires. Le projet développera des stratégies originales pour traiter les symptômes neurologiques (traitement symptomatique), plutôt que de cibler l’infection elle-même. Ce projet vise également à aider les autorités de santé publique et la société à faire face aux futurs événements épidémiques en fournissant des informations solides pour orienter les décisions politiques en termes de vaccination, de traitement et de contre-mesures sociales lorsque cela est nécessaire.
Montant d’aide France 2030 : 1 828 349M€
UNFIRE – Coordinateur : DALOD Marc (Inserm Marseille)
Le projet UNFIRE (Accélérer notre capacité à comprendre et à combattre l’immunopathologie causée par les infections respiratoires dues à des virus émergents : des modèles de souris aux patients en passant par les macaques), contribuera à mieux comprendre les mécanismes contrôlant le développement d’une immunopathologie pulmonaire sévère au cours d’infections virales respiratoires, ouvrant de nouvelles pistes pour manipuler l’inflammation au bénéfice de l’hôte. Le projet confirmera que la production tardive/prolongée d’IFN-I/III (interférons de type I/III), par les pDC (cellules dendritiques plasmacytoïdes), est délétère pour l’hôte lors d’infections respiratoires par des virus grippaux et des coronavirus émergents; déterminera les mécanismes cellulaires et moléculaires qui sous-tendent les effets délétères des pDC et des IFN-I; et identifiera des molécules cibles/voies biologiques et des médicaments pharmacologiques pouvant permettre une inhibition spécifique de la production d’IFN-I/III par les pDC ou des réponses IFN-I/III tardives, dans de nouveaux modèles précliniques murins d’infections virales respiratoires et dans des cocultures de cellules humaines, dans la perspective d’évaluer chez la souris puis le macaque l’innocuité et l’efficacité des traitements les plus prometteurs.
Montant d’aide France 2030 : 1 783 228M€
VOLET 2 – Organiser et développer de nouveaux traitements, vaccins et autres moyens de prévention, de prévention, de diagnostic et de surveillance pour les maladies infectieuses émergentes
NeuroFlaviNA – Coordinateur : PEYROTTES Suzanne (CNRS Languedoc)
Le projet NeuroFlaviNA (Cibler les infections neuro-invasives associées aux flavivirus avec des analogues de nucléosides), vise à fournir un pipeline complet pour concevoir de nouvelles familles innovantes de pronucléo(s)tides et d’analogues de nucléosides visant les Orthoflavivrius neurotropes pathogènes d’importance clinique importante. Le projet permettra aux médicaments antiviraux d’efficacité prouvée de traverser la barrière hémato-encéphalique sans la perturber et d’augmenter leur concentration au niveau du système nerveux central en limitant les efflux.
Montant d’aide France 2030 : 1 356 178M€
InHEALation – Coordinateur : EPARDAUD Mathieu (Université Tours)
Le projet InHEALation (Plateforme prophylactique et thérapeutique innovante contre les virus aéroportés : quelle voie d’inhalation pour une protection optimale à large spectre et durable ?), vise à établir un concept innovant dans la gestion des infections virales respiratoires avec une nouvelle stratégie thérapeutique portée par une plateforme globale, ciblant à la fois les personnes naïves et/ou infectées, déclinée avec des vaccins et des anticorps thérapeutiques, optimisés (effet à large spectre), formulés avec un nano-carrier muco-adhésif et administrés localement pour assurer une protection systémique et mucosale contre les virus aéroportés. Le projet attend comme résultats de déterminer la voie d’administration optimale à utiliser dans un contexte clinique et fournir des lignes directrices scientifiques et techniques pour le développement de vaccins et anticorps thérapeutiques antiviraux inhalés.
Montant d’aide France 2030 : 2 179 669M€
ANTIVIRESPIR – Coordinateur : MURIAUX Delphine (CNRS Languedoc)
Le projet ANTIVIRESPIR (Criblage, identification et caractérisation d’antiviraux contre les virus respiratoires), consiste à redimensionner de manière ambitieuse l’infrastructure nationale Virocrib pour compléter ses expertises, ses modèles et sa logistique afin de synthétiser, cribler, identifier et caractériser des antiviraux innovants contre les virus respiratoires infectieux, à risque d’émergence, et qui pourront être immédiatement utilisés en cas de nouvelle épidémie/pandémie liée à l’adaptation à l’homme d’une nouvelle souche virale.
Montant d’aide France 2030 : 1 837 790M€
VOLET 3 – Permettre aux politiques publiques et à la société de faire face aux crises épidémiques
PReViX – Coordinateur : SOFONEA Mircea T. (Inserm Montpellier)
Le projet PReViX (Préparation pandémique au virus respiratoire X : modélisation intégrative des premiers cas aux contre-mesures sanitaires précoces), développera un cadre scientifique et sanitaire opérationnel pour les virus respiratoires, qui répondra à l’incitation de l’OMS d’élargir la recherche aux pathogènes encore inconnus pour se préparer à la prochaine pandémie. Il utilisera des approches adaptées aux défis à venir, relevant de la diversité des sources de données, de l’analyse en temps réel de ces dernières, ainsi que de l’aide à la décision sanitaire de crise. Il permettra d’établir les contours microbiologiques, infectiologiques et épidémiologiques des futures menaces virologiques respiratoires, tout en développant des méthodes innovantes pour surveiller, caractériser, modéliser en temps réel et freiner la propagation précoce d’un virus respiratoire (ré-)émergent, à partir des premières données disponibles, hétérogènes tant en nature qu’en qualité. Le projet contribuera à consolider la communauté de recherche française en approches quantitatives des maladies infectieuses. Il en résultera des résultats scientifiques de niveau international ainsi que la production, en étroite collaboration avec les principaux acteurs de la santé publique en France, d’évaluations de risques décisives pour les futures épidémies de viroses respiratoires.
Montant d’aide France 2030 : 1 416 037M€
VOLET 1 – Accélérer l’acquisition de connaissances sur les maladies infectieuses émergentes
ArboRetro
Equipes : SALEH Carla (Institut Pasteur, Paris) ; CRISTOFARI Gael (Institut Pasteur, Paris) ; LAMBRECHTS Louis (Institut Pasteur, Paris)
VERTICAL
Equipes : MALNOU Cécile (Institut toulousains des maladies infectieuses et inflammatoires Inserm, Toulouse) ; CAVAILLE Jérôme (Center for Integrative Biology (CBI), Toulouse) ; POMPON Julien (Mivegec, Montpellier) ; SIMONIN Yannick (Pathogenesis & Control of Chronic & Emerging Infections (PCCEI), Montpellier) ; GALLARDO Franck (Néovirtech, Toulouse)
SURVI3
Equipes : DE PROST Nicolas (APHP- HOPITAL HENRI-MONDOR 1, Créteil) ; RODRIGUEZ Christophe (APHP- HOPITAL HENRI-MONDOR 1, Créteil) ; GUILLON Antoine (Plateforme de metabolomique et analyses chimiques, Tours) ; ZHANG Qian (Institut Imagine, Paris) ; MATHEVAS Matthieu (Institut Necker Enfants Malades, Paris) ; FOURATI Slim (APHP- HOPITAL HENRI-MONDOR 1, Créteil) ; RAMEIX-WELTI Marie-Anne (Institut Pasteur, Paris) ; NATELLA Pierre-Andre (APHP – Hôpital Henri Mondor, Créteil) ; GUEDJ Jeremie (Inserm, Paris)
ViroBrain
Equipes : GAUDIN Raphael (CNRS, Montpellier); GONZALEZ-DUNIA Daniel (Infinity Toulouse Institute for Inflammatory or Infectious diseases, Toulouse); DIAS DE MELO Guilherme (Institut Pasteur, Paris) ; DELEIDI Michela (Imagine Institut, Paris) ; CARAPITO Christine (Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien, Strasbourg) ; LAMBRESCQ Virginie (Pitié-Salpêtrière ICM, Paris)
UNFIRE
Equipes: DALOD Marc (Inserm CIML Centre d’Immunologie de Marseille-Luminy, Marseille) ; RUA Rejane (Inserm CIML, Marseille) ; GAYA Mauro (Inserm CIML Centre d’Immunologie de Marseille-Luminy, Marseille) ; MIONNET Cyrille (Inserm CIML Centre d’Immunologie de Marseille-Luminy, Marseille) ; GATTI Evelina (Inserm CIML Centre d’Immunologie de Marseille-Luminy, Marseille) ; ZARUBICA Ana (Inserm Centre d’Immunophénomique (CIPHE), Marseille) ; FAVIER Benoit (Université Paris Sud Paris 11, Fontenay-aux-Roses) ; TROUILLET-ASSANT Sophie (Institut des agents infectieux, Lyon)
VOLET 2 – Organiser et développer de nouveaux traitements, vaccins et autres moyens de prévention, de prévention, de diagnostic et de surveillance pour les maladies infectieuses émergentes
NeuroFlaviNA
Equipes : PEYROTTES Suzanne (CNRS Univ Montpellier ENSCM, Montpellier) ; ROY Vincent (Institut de Chimie Organique et Analytique, Orléans) ; TESSIER Arnaud (CEISAM, Nantes) ; TOURET Franck (IRD INSERM AMU, Marseille) ; ALVAREZ Karine (CNRS Luminy, Marseille) ; SIMONIN Yannick (PCCEI PATHOGENESIS AND CONTROL OF CHRONIC AND EMERGING INFECTIONS, Montpellier) ; GOSSELET Fabien (LBHE Laboratoire de la Barrière Hémato-Encéphalique, Lens)
InHEALation
Equipes : EPARDAUD Mathieu (ISP Infectiologie et Santé Publique, Nouzilly) ; SECHER Thomas (CEPR Centre d’Etude des Pathologies Respiratoires, Tours) ; PIQUEMAL Jean-Philip (LCT Laboratoire de Chimie Théorique, Paris) ; SIRARD Jean-Claude (CIIL Le Centre d’Infection et d’Immunité de Lille (CIIL), Lille) ; PAUL Stéphane (Université Jean Monnet, Saint-Etienne)
ANTIVIRESPIR
Equipes : MURIAUX Delphine (CNRS, Montpellier) ; BELOUZARD Sandrine (CIIL, Lille); GALZI Jean-Luc (CNRS, Montpellier) ; LEBRETON Jacques (Chimie Et Interdisciplinarité : Synthèse, Analyse, Modélisation (CEISAM), Nantes) ; ROSA-CALATRAVA Manuel (Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), Lyon) ; DE VOS John (IRMB, Montpellier) ; ZARUBICA Ana (Centre d’immunophénomique (CIPHE), Marseille)
VOLET 3 – Permettre aux politiques publiques et à la société de faire face aux crises épidémiques
PReViX
Equipes : SOFONEA Mircea T. (PCCEI Pathogenesis and control of Chronic and Emerging Infections, Montpellier); CREPEY Pascal (Arènes, Rennes); PRAGUE Mélanie (BPH Bordeaux Population Health Research Center, Bordeaux); GUEDJ Jérémie (Université Paris Diderot – Paris 7); ALIZON Samuel (CIRB Centre interdisciplinaire de recherche en biologie, Paris) ; COLIZZA Vittoria (iPLESP Institut Pierre Louis d’Epidémiologie et de Santé Publique, Paris) ; BURREL Sonia (MFP Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité, Bordeaux) ; CAUCHEMEZ Simon (Institut Pasteur, Paris) ; CHEVENET Frédéric (MIVEGEC Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle, Montpellier)