Mise à disposition d’une nouvelle séquence du virus Chikungunya par l’équipe du CHU de La Réunion

Dernière mise à jour le 02 mai 2025

L’essentiel

  • La souche du virus du Chikungunya, réapparue à La Réunion en 2024, a fait l’objet d’un séquençage complet.
  • Le CHU de La Réunion a déposé sur GenBank (PV035814) la séquence codante complète de la souche isolée en début d’épidémie.
  • La souche virale sera prochainement disponible via la collection EVA dans le cadre du projet EVA-GLOBAL.

À la suite de la grande épidémie de 2005–2006, qui avait touché 38 % de la population réunionnaise, la circulation du CHIKV était restée indétectée pendant plusieurs années. En 2024, le CHIKV a réémergé et provoque actuellement une nouvelle épidémie sur l’île.

Étienne Frumence et Marie-Christine Jaffar-Bandjee, du Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion, — désigné Centre National de Référence associé pour les Arbovirus et les Virus respiratoires pour la période 2023-2027 — ont mis en ligne la séquence codante complète du virus Chikungunya (CHIKV).

Cette séquence, obtenue à partir de l’un des premiers cas confirmés en 2024, est désormais accessible dans la base de données GenBank sous le numéro d’accession PV035814.

Publication de la séquence codante complète du virus CHIKV provenant de l’île de La Réunion en 2024 (GenBank : PV035814)

Le virus Chikungunya intégré dans la collection génomique EVA (European Virus Archive)

Par ailleurs, la collection européenne de virus (EVA) mettra prochainement à disposition la souche CHIKV isolée en 2025.

Cette initiative s’inscrit dans le cadre du projet EVA-GLOBAL, dont la mission est de collecter, amplifier, caractériser, standardiser, authentifier et distribuer des virus et produits dérivés à destination de la communauté scientifique mondiale. Les collections issues des biobanques participantes sont centralisées dans un catalogue en ligne.