Le projet Panafpox

Panafpox : comprendre la mpox en Afrique centrale et de l’Ouest

Découvrez l’interview de Steve AHUKA MUNDEKE (INRB, Kinshasa, RDC) et de Martine PEETERS (IRD, Montpellier, France).

Quels sont les objectifs du projet Panafpox ?

Panafpox est un projet multidisciplinaire dont l’objectif principal est de fournir de nouvelles informations sur les virus de la mpox dans les pays africains (République démocratique du Congo (RDC), Cameroun, Bénin et Guinée) présentant une forte probabilité d’émergence ou de réémergence d’infections zoonotiques. Le but est d’évaluer le risque d’épidémie et de propagation à l’échelle mondiale.

Pour cela, le projet Panafpox se divise en trois objectifs spécifiques :

• Documenter en détail le réservoir animal du virus de la mpox ;
• Documenter l’étendue des infections asymptomatiques par le virus de la mpox chez l’Homme dans les pays endémiques ;
• Documenter la diversité génétique et l’évolution du virus de la mpox dans des échantillons humains pour comprendre si les différentes épidémies correspondent à des transmissions zoonotiques indépendantes ou à des chaînes de transmission interhumaine non-connues.

Quels sont les résultats obtenus ?

Voici un aperçu des premières données et résultats obtenus dans le cadre du projet selon les trois objectifs :

• Documentation du réservoir animal

Des échantillons de rongeurs et de chauves-souris sont prélevés en RDC, Cameroun et Guinée pour analyser la circulation du virus dans les laboratoires de l’INRB, CREMER et CERFIG, respectivement, où des techniques sérologiques et moléculaires ont été transférées. Les rongeurs sont considérés comme le réservoir le plus probable du virus de la mpox, et des tests PCR sont effectués pour confirmer cette hypothèse.

• Etudes des infections asymptomatiques chez l’Homme

Les infections humaines asymptomatiques à mpox semblent fréquentes dans les pays endémiques comme la RDC, où la charge de morbidité est la plus élevée. Alors que la déclaration des cas sur une base clinique peut surestimer le nombre d’infections, la confirmation en laboratoire par tests PCR uniquement sous-estime les taux réels à cause de la qualité variable des échantillons. En utilisant des tests d’anticorps spécifiques, une étude sur 463 patients en RDC a révélé un taux d’infection par mpox de 48,2 %, contre 33,9 % uniquement avec la PCR, identifiant ainsi 66 patients supplémentaires et 23 foyers supplémentaires (Kinganda-Lusamaki E et al, Pathogens 2023). Cela souligne l’importance des tests sérologiques pour compléter les diagnostics PCR et améliorer la surveillance.

Des enquêtes épidémiologiques montrent également que certains cas de mpox passent inaperçus, avec des infections précédentes non déclarées suggérant une propagation locale sous-estimée. Des études dans des régions endémiques comme la province de l’Équateur en RDC ont permis d’identifier des cas confirmés et leurs contacts, en analysant les lésions dermatologiques et les échantillons de sang pour détecter les anticorps. Ces analyses se poursuivent pour mieux comprendre les facteurs associés aux infections asymptomatiques.

• Evaluation de la diversité génétique et évolution du virus de la mpox

Le séquençage du génome entier des échantillons de virus de la mpox en RDC a permis d’identifier une diversité génétique importante au sein du clade 1, répartie entre les groupes 2, 3 et 4, avec des différences géographiques distinctes selon les provinces. Les échantillons du groupe 2 ont montré la plus grande diversité, certains étant étroitement liés à des séquences de rongeurs, suggérant des transmissions zoonotiques possibles. Les génomes des groupes 3 et 4 étaient principalement localisés dans les provinces de Tshopo, Sankuru et Maniema. Par ailleurs, l’analyse phylogénétique a mis en évidence une lignée distincte au sein du groupe 3.

Ce séquençage a également confirmé des cas de transmission sexuelle de la mpox en RDC. Ces résultats montrent l’importance du séquençage pour comprendre l’évolution et la diversité du virus de la mpox dans différents contextes géographiques et zoonotiques.

Publications scientifiques du projet

• First imported Cases of MPXV Clade Ib in Goma, Democratic Republic of the Congo: Implications for Global Surveillance and Transmission Dynamics

Daniel Mukadi-Bamuleka, Eddy Kinganda-Lusamaki, Noella Mulopo-Mukanya, Adrienne Amuri-Aziza, Áine O’Toole, Brigitte Modadra-Madakpa, Guy Mutombo Ndongala, Emmanuel Hasivirwe Vakaniaki, Sydney Merritt, Cris Kacita, Gaston Lubambo Maboko, Jean-Claude Makangara-Cigolo, Michel Ngimba, Emmanuel Lokilo, Elisabeth Pukuta-Simbu, Gradi Luakanda, Tavia Bodisa-Matamu, Zephanie Paluku Kalimuli, Prince Akil-Bandali, Sifa Kavira, Daan Jansen, Adèle Kavira Kamaliro, Emile Muhindo-Milonde, Jeriel Mufungizi, Yves Birindwa Hamisi, Hugo Kavunga, Olivier Tshiani, Sabin S. Nundu, Laurens Liesenborghs, Nicole A. Hoff, Jean Nachega, Robert Shongo, Ahidjo Ayouba, Genay Pilarowski, Alain Kakule Mangolopa, Amos Kiuka Ebondo, Nicola Low, Souradet Y. Shaw, Sam Wilkinson, Sofonias Kifle Tessema, Lorenzo Subissi, Eric Delaporte, Koen Vercauteren, Tony Wawina-Bokalanga, Anne W Rimoin, Martine Peeters, Nicholas Loman, Andrew Rambaut, Jean-Jacques Muyembe-Tamfum, Lisa E. Hensley, Jason Kindrachuk, Placide Mbala-Kingebeni, Steve Ahuka-Mundeke. medRxiv 2024.09.12.24313188; doi: https://doi.org/10.1101/2024.09.12.24313188

• Clade I Mpox virus genomic diversity in the Democratic Republic of the Congo, 2018 – 2024: Predominance of Zoonotic Transmission

Eddy Kinganda-Lusamaki, Adrienne Amuri-Aziza, Nicolas Fernandez, Jean-Claude Makangara-Cigolo, Catherine Pratt, Emmanuel Hasivirwe Vakaniaki, Nicole A. Hoff, Gradi Luakanda, Prince Akil-Bandali, Sabin Sabiti Nundu, Noella Mulopo-Mukanya, Michel Ngimba, Brigitte Modadra-Madakpa, Ruth Diavita, Princesse Paku, Elisabeth Pukuta-Simbu, Sydney Merritt, Áine O’Toole, Nicola Low, Antoine Nkuba-Ndaye, Hugo Kavunga-Membo, Robert Shongo, Laurens Liesenborghs, Tony Wawina-Bokalanga, Koen Vercauteren, Daniel Mukadi-Bamuleka, Lorenzo Subissi, Jean-Jacques Muyembe, Jason Kindrachuk, Ahidjo Ayouba, Andrew Rambaut, Eric Delaporte, Sofonias Tessema, Eric D’Ortenzio, Anne W. Rimoin, Lisa E. Hensley, Placide Mbala-Kingebeni, Martine Peeters, Steve Ahuka-Mundeke . Cell. 2024 Oct 24:S0092-8674(24)01199-1. doi: 10.1016/j.cell.2024.10.017. Online ahead of print.

Co-circulation of Clade Ia and Ib monkeypox virus in Kinshasa Province, Democratic Republic of the Congo, July – August 2024.

Tony Wawina-Bokalanga, Prince Akil-Bandali, Eddy Kinganda-Lusamaki, Emmanuel Lokilo, Daan Jansen, Adrienne Amuri-Aziza, Jean-Claude Makangara-Cigolo, Elisabeth Pukuta-Simbu, Rilia Ola-Mpumbe, Cris Kacita, Princesse Paku-Tshambu, Pedro-Henrique L.F. Dantas, Gradi Luakanda, Antoine Nkuba-Ndaye, Meris Matondo, Junior Bulabula, Emmanuel Hasivirwe Vakaniaki, Áine O’Toole, Tessa De Block, Christian Ngandu, Nicole A. Hoff, Nicola Low, Lorenzo Subissi, Sydney Merritt, Jean-Jacques Muyembe-Tamfum, Laurens Liesenborghs, Martine Peeters, Eric Delaporte, Jason Kindrachuk, Anne W. Rimoin, Steve Ahuka-Mundeke, Andrew Rambaut, Dieudonné Mwamba, Koen Vercauteren, Placide Mbala-Kingebeni. Euro Surveill. 2024 Sep;29(38):2400592. doi: 10.2807/1560-7917.ES.2024.29.38.2400592.

• Presumed Transmission of 2 Distinct Monkeypox Virus Variants from Central African Republic to Democratic Republic of the Congo.

Vakaniaki EH, Kinganda-Lusamaki E, Merritt S, Kasongo F, Malembi E, Lunyanga L, Linsuke S, Halbrook M, Kalthan E, Pukuta E, Aziza AA, Cigolo JCM, Lumembe R, Kabamba G, Anta Y, Bolunza P, Kanda I, Ngazobo R, Kalonji T, Nsio J, Matoka P, Mwamba D, Ngandu C, Shaw SY, Shongo R, Madinga J, Boum Y, Liesenborghs L, Delaporte E, Ayouba A, Low N, Mundeke SA, Hensley LE, Tamfum JM, Nakoune E, Peeters M, Hoff NA, Kindrachuk J, Rimoin AW, Mbala-Kingebeni P. Emerg Infect Dis . 2024 Oct;30(10):2128-2134. doi: 10.3201/eid3010.241118.

• Sustained human outbreak of a new MPXV clade I lineage in eastern Democratic Republic of the Congo.

Vakaniaki EH, Kacita C, Kinganda-Lusamaki E, O’Toole Á, Wawina-Bokalanga T, Mukadi-Bamuleka D, Amuri-Aziza A, Malyamungu-Bubala N, Mweshi-Kumbana F, Mutimbwa-Mambo L, Belesi-Siangoli F, Mujula Y, Parker E, Muswamba-Kayembe PC, Nundu SS, Lushima RS, Makangara-Cigolo JC, Mulopo-Mukanya N, Pukuta-Simbu E, Akil-Bandali P, Kavunga H, Abdramane O, Brosius I, Bangwen E, Vercauteren K, Sam-Agudu NA, Mills EJ, Tshiani-Mbaya O, Hoff NA, Rimoin AW, Hensley LE, Kindrachuk J, Baxter C, de Oliveira T, Ayouba A, Peeters M, Delaporte E, Ahuka-Mundeke S, Mohr EL, Sullivan NJ, Muyembe-Tamfum JJ, Nachega JB, Rambaut A, Liesenborghs L, Mbala-Kingebeni P. Nat Med . 2024 Oct;30(10):2791-2795. doi: 10.1038/s41591-024-03130-3.

• Co-Circulating Monkeypox and Swinepox Viruses, Democratic Republic of the Congo, 2022.

Kalonji T, Malembi E, Matela JP, Likafi T, Kinganda-Lusamaki E, Vakaniaki EH, Hoff NA, Aziza A, Muyembe F, Kabamba J, Cooreman T, Nguete B, Witte D, Ayouba A, Fernandez-Nuñez N, Roge S, Peeters M, Merritt S, Ahuka-Mundeke S, Delaporte E, Pukuta E, Mariën J, Bangwen E, Lakin S, Lewis C, Doty JB, Liesenborghs L, Hensley LE, McCollum A, Rimoin AW, Muyembe-Tamfum JJ, Shongo R, Kaba D, Mbala-Kingebeni P. Emerg Infect Dis. 2024 Apr;30(4):761-765. doi: 10.3201/eid3004.231413.

• Clade I-Associated Mpox Cases Associated with Sexual Contact, the Democratic Republic of the Congo.

Kibungu EM, Vakaniaki EH, Kinganda-Lusamaki E, Kalonji-Mukendi T, Pukuta E, Hoff NA, Bogoch II, Cevik M, Gonsalves GS, Hensley LE, Low N, Shaw SY, Schillberg E, Hunter M, Lunyanga L, Linsuke S, Madinga J, Peeters M, Cigolo JM, Ahuka-Mundeke S, Muyembe JJ, Rimoin AW, Kindrachuk J, Mbala-Kingebeni P, Lushima RS; International Mpox Research Consortium. Emerg Infect Dis. 2024 Jan;30(1):172-176. doi: 10.3201/eid3001.231164. Epub 2023 Nov 29.

• Use of Mpox Multiplex Serology in the Identification of Cases and Outbreak Investigations in the Democratic Republic of the Congo (DRC).

Kinganda-Lusamaki E, Baketana LK, Ndomba-Mukanya E, Bouillin J, Thaurignac G, Aziza AA, Luakanda-Ndelemo G, Nuñez NF, Kalonji-Mukendi T, Pukuta ES, Nkuba-Ndaye A, Lofiko EL, Kibungu EM, Lushima RS, Ayouba A, Mbala-Kingebeni P, Muyembe-Tamfum JJ, Delaporte E, Peeters M, Ahuka-Mundeke S. Pathogens. 2023 Jul 7;12(7):916. doi: 10.3390/pathogens12070916.