Projets et candidats lauréats

Objectifs

Principal : Comparer l’efficacité d’une stratégie simplifiée de prestation de services combinant le dépistage et l’initiation du traitement sur place le jour même avec une surveillance minimale dans des services non spécialisés (stratégie ACCESS+) à celle d’une stratégie standard pour améliorer l’accès au traitement de l’hépatite C chez les adultes au Cameroun.

Secondaires : Comparer la cascade de soins de l’hépatite C entre les deux stratégies ; identifier les obstacles à la prise en charge de l’hépatite C, du dépistage rapide des anticorps (anti-VHC) à la guérison de l’infection ; comparer le ressenti des patients entre les deux stratégies ; évaluer le rapport coût-efficacité de la stratégie ACCESS+ ; identifier les obstacles à la mise en œuvre généralisée de la stratégie ACCESS+.

Contexte

La majorité des 58 millions de porteurs chroniques du VHC ignorent qu’ils sont infectés et ne sont pas traités, en particulier dans les pays à revenu faible ou intermédiaire. L’objectif de l’OMS d’éliminer l’hépatite C en tant que problème de santé publique à l’horizon de 2030 représente donc un défi considérable. L’OMS a déterminé des cibles de 90 % de patients diagnostiqués et, pour ceux ayant une infection chronique, de 80 % de patients traités (alors que ces proportions étaient, respectivement, de 20 % et 7 % en 2015). La disponibilité de traitements antiviraux à action directe courts et très efficaces et de tests de dépistage rapide ont contribué à la recommandation du traitement pour tous les porteurs chroniques du VHC. Toutefois, peu de progrès ont été réalisés dans les pays à revenu faible ou intermédiaire, et tout particulièrement en Afrique subsaharienne, où une stratégie de dépistage et de traitement adaptée au contexte local doit être définie.

Méthodes

Un essai en grappes contrôlé randomisé à deux bras parallèles sera réalisé dans des banques de sang et des services VIH (les grappes) des deux plus grandes villes du Cameroun (Yaoundé et Douala). Seront éligibles les personnes âgées de 21 ans ou plus, anti-VHC positives, vivant dans la zone d’étude. La stratégie ACCESS+ aura quatre composantes : (1) le dépistage des anticorps anti-VHC et de l’ARN du VHC sur place le jour même, (2) l’initiation du traitement de l’hépatite C sur place le jour même, (3) une surveillance clinique et biologique minimale et (4) une prise en charge par des médecins généralistes et des conseillers (agents de santé communautaires, infirmiers ou travailleurs sociaux) formés dans des services non spécialisés. A l’inverse, dans la stratégie standard, le processus pour le dépistage et l’initiation du traitement sera plus long et les participants dépistés anti-VHC positifs seront pris en charge par des gastroentérologues et auront un suivi plus rapproché. Des données biologiques et cliniques (cahiers d’observation spécifiques des patients), socioéconomiques (questionnaires standardisés) et qualitatives (entretiens et groupes de discussion) seront recueillies. Au total, 576 participants anti-VHC positifs (288 par bras) seront recrutés dans 16 établissements (8 banques de sang et 8 services VIH) après avoir testé environ 32000 donneurs de sang et 8400 patients vivant avec le VIH. La durée totale de l’essai sera de 36 mois.

Echéancier de l’essai

• Trimestres 1-2 : Préparation de la mise en œuvre de l’essai, demandes d’avis éthique et d’autorisation administrative, formation des équipes des sites.
• Trimestres 3-6 : Recrutement et suivi des participants.
• Trimestres 7-8 : Suivi des derniers participants.
• Trimestres 8-9 : Finalisation de la base de données.
• Trimestres 9-12 : Analyse des données et communication des résultats.

Résultats et retombées attendus

A terme, le projet devrait favoriser la mise en œuvre d’une stratégie de dépistage et de traitement appropriée pour le Cameroun et d’autres pays à revenu faible ou intermédiaire et, par conséquent, l’accès au traitement de l’hépatite C dans ce contexte.

Les cellules tueuses naturelles (NK) sont impliquées dans le contrôle de l’infection par le VIH-1. Les récentes découvertes sur la capacité des cellules NK à s’adapter et à se différencier en cellules mémoire à longue durée ont ajouté une complexité supplémentaire. Les cellules NK de type mémoire peuvent être générées par stimulation via des cytokines comme IL- 12/15/18. Dans l’ensemble, cela soulève la possibilité qu’il existe des capacités d’adaptation distinctes parmi les sous-populations de cellules NK en réponse aux infections virales et immunisations, un mécanisme qui pourrait être exploité pour promouvoir les réponses anti-VIH. Tout comme pour les cellules T, l’importance d’une meilleure compréhension des fonctions spécifiques aux tissus des cellules NK est de plus en plus importante. Nos études précédentes ont révélé un fort contrôle médié par les cellules NK de l’infection à SIVagm dans les tissus lymphoïdes secondaires (SLT) chez un hôte naturel, le singe vert africain (AGM). Nous avons montré que lors d’une infection chronique SIVagm, des cellules NK hautement différenciées au sein des SLT présentant un profil adaptatif associé à une activité cytotoxique accrue envers les cellules présentant de peptides derivés de SIV-ENV via le MHC-E. Un contrôle similaire était absent dans l’intestin de l’AGM infectée par SIVagm. Nous émettons l’hypothèse que les cellules NK adaptatives à forte capacité de suppression se différencient in situ au sein des SLT.

Ici, nous proposons de mieux comprendre comment les cellules NK acquièrent la capacité de contrôle du SIVagm dans les SLT. Nos objectifs spécifiques sont: 1) identifier le site anatomique de génération de cellules NK adaptatives lors de l’infection SIVagm; 2) comparer les données phénotypiques et moléculaires des cellules NK en primo-infection SIV dans les tissus entre infection SIVagm et SIVmac pour mieux comprendre le blocage de differentiation des cellules NK tissulaires lors d’une infection SIVmac; 3) déterminer les microenvironnements tissulaires inflammatoires respectifs et évaluer la relation potentielle avec les profils de cellules NK identifiés en focalisant sur les facteurs qui pourraient moduler le phenotype ou l’activité des cellules NK. Nous analyserons les tissus qui jouent un rôle majeur pour la réplication virale (SLT, muqueuse) et la différenciation potentielle des cellules NK (moelle osseuse, foie, SLT). Deux groupes d’AGM infectés par SIVagm seront sacrifiés aux jours 4 et 28 pi. Un groupe de macaques infectés par SIVmac sera sacrifié au jour 4pi. Des échantillons d’AGM et de macaques non infectés et chroniquement infectés sont déjà disponibles. Nous analyserons l’hétérogénéité, la différenciation et l’activité des cellules NK temporelles et spatiales sur un analyseur Symphony FACs (> 25 couleurs). En utilisant notre test ex vivo de l’activité des cellules NK restreintes au CMH-E, nous analyserons si l’activité des cellules NK adaptatives est présente uniquement dans les SLT ou également dans d’autres tissus lors d’une infection à SIVagm. Si nous détectons une différence quant à l’émergence de sous-populations cellulaires NK et/ou l’activité restreinte du CMH-E entre les tissus, nous déterminerons le profil transcriptomique à l’échelle du génome des sous-populations cellulaires NK identifiés en AGM par rapport aux macaques aux temps et tissus en question. Dans les mêmes tissus sélectionnés, nous effectuerons une analyse RNAseq sur des cellules totales pour définir les environnements inflammatoires respectifs en primo-infection. En combinant ces aspects, nous visons à obtenir un aperçu plus complet des cellules NK tissulaires et à mieux comprendre les processus biologiques favorisant ou bloquant la génération de cellules NK efficaces contre les cellules infectées par le VIH / SIV. À long terme, cela pourrait contribuer à fournir i) des biomarqueurs pour évaluer l’efficacité des cellules NK tissulaires chez les patients VIH, ii) de nouvelles cibles pour d’immuno-thérapies.

La mutation responsable de la dystrophie musculaire rare LGMD1F (limb girdle muscular dystrophy 1F) est une délétion d’un seul nucléotide dans le codon stop de la transportine 3 (TNPO3). Cette mutation conduit à une extension de la protéine en C-ter sur 15 acides aminés, produisant une protéine de fonction inconnue (TNPO3_mut) qui est co-exprimée avec la protéine TNPO3 sauvage (TNPO3_wt). TNPO3 a été impliquée dans le transport nucléaire de protéines riches en sérine / arginine, telles que les facteurs d’épissage alternatif, ainsi que dans l’infection par le VIH-1 en agissant sur la capside virale. Nos données préliminaires montrent que cette mutation génétique rare confère une protection contre le VIH-1 in vitro, faisant de cette mutation la deuxième anomalie génétique décrite jusqu’à présent qui confère une forte résistance à l’infection par le VIH-1. L’objectif du projet est d’approfondir notre compréhension de l’impact de TNPO3 sur le VIH-1 en se basant sur les patients LGMD1F. Premièrement, nous visons à comprendre le fonctionnement de cette forme mutante de TNPO3 et à évaluer son impact sur les fonctions cellulaires: examiner si TNPO3_mut a un effet dominant négatif sur TNPO3, la distribution cellulaire de TNPO3 et des facteurs d’épissage, la structure du cytosquelette et les modifications post-traductionnelles des microtubules dans les cellules de patient et en lignées cellulaires modèles de la maladie. Deuxièmement, en utilisant la mutation LGMD1F comme modèle, nous étudierons les mécanismes d’interférence sur l’infection par le VIH: identifier l’étape du cycle viral bloquée par TNPO3, examiner l’effet de la mutation sur le transport de la capside et l’induction de l’IFN, caractériser la localisation des provirus intégrés dans la topographie nucléaire et le paysage d’intégration dans les cellules TNPO3_mut. Si les objectifs du projet sont atteints, nous pourrons mieux comprendre les mécanismes impliqués dans l’inhibition de l’infection VIH par la TNPO3 défectueuse chez les patients LGMD1F. D’un point de vue technique et translationnel, notre projet développera des techniques innovantes (BRET, CRISPR / Cas9 FISH de provirus intégrés) qui pourraient ouvrir de nouvelles possibilités de recherche.

L’hépatite C chronique conduit au développement d’une stéatose, une accumulation anormale de gouttelettes lipidiques (GL) dans les hépatocytes, et à long terme une cirrhose et un carcinome hépatocellulaire (CHC). La diversité génétique du virus de l’hépatite C (VHC) est importante, avec 8 génotypes et ≥ 90 sous-types. Des études cliniques ont montré que les infections par le VHC de génotype 3 sont associées à une prévalence et une sévérité accrues de stéatose, ainsi qu’une progression plus rapide vers la fibrose. De plus, le VHC exploite le métabolisme lipidique de la cellule pour son cycle viral, notamment pour l’assemblage des particules lipovirales, une caractéristique qui contribue probablement aux désordres métaboliques associés à l’infection par le VHC (stéatose, insulino-résistance, diabète de type 2). Ces observations, ainsi que des modèles cellulaires d’expression transitoire ou de souris transgéniques suggèrent un possible rôle direct de la protéine de capside (ou core) du VHC dans la progression des atteintes hépatocytaires. Cependant, il reste à déterminer si les dérégulations observées ont également lieu dans des modèles pertinents d’infection et s’il existe des dérégulations exacerbées ou spécifiques selon l’origine génotypique de la protéine core.  

L’objectif général de ce projet est de mieux comprendre les mécanismes qui gouvernent le rôle de la protéine core dans la dérégulation de (i) la biosynthèse des GL, (ii) le métabolisme lipidique et glucidique hépatocytaire, et (iii) les signalisations reliées à la progression vers le CHC, et l’importance de la séquence de core.

Ce projet entre dans le cadre des objectifs de l’AC42. Les trois équipes impliquées, A. Martin (Institut Pasteur, Paris), P. Chouteau & P. Roingeard (INSERM U966, Tours), et E. Herker (Philipps University Marburg, Germany) ont obtenu de nombreux résultats préliminaires et possèdent une expertise reconnue et pertinente pour la réalisation des objectifs du projet.

Objectifs spécifiques et méthodes:

Nous utiliserons des virus recombinants intergénotypiques exprimant les protéines core de différents génotypes isolés de patients présentant une diversité de tableaux cliniques, afin de mener les études suivantes :

• Analyser comparativement l’effet de ces virus recombinants sur la biogenèse des GL dans des cellules Huh7.5 infectées, mais aussi dans des cultures de cellules Huh7.5 différentiées et maintenues en conditions hypoxiques, un système qui reproduit mieux les conditions de l’infection dans le microenvironnement du foie humain,
• Caractériser comparativement les profils de lipides et de protéines associés aux GL extraites de cellules infectées par les divers virus recombinants dont les séquences core ont été associées à des degrés variés de stéatose,
• Identifier les signalisations hépatocytaires et les régulations métaboliques qui seraient différentiellement affectées par les variants de core, en utilisant des cribles transcriptomiques à haut débit.

Résultats attendus:

Nous attendons de ces études qu’elles permettent d’identifier des fonctions biologiques ou des gènes spécifiquement dérégulés, ou encore des caractéristiques spécifiques de taille et de composition des GL selon des séquences de core exprimées par les virus. En croisant ces résultats avec ceux d’études interactomiques en cours (hors présent projet) et visant à identifier des partenaires hépatocytaires spécifiques de protéines core de certains génotypes / souches, nous espérons mieux comprendre les mécanismes de dérégulation hépatocytaire induits par core qui expliqueraient les évolutions pathologiques spécifiques. Globalement, ces travaux contribueront à établir une cartographie des risques permettant d’anticiper l’évolution des atteintes hépatocytaires chez les patients.

De plus, l’hépatite C chronique présentant des caractéristiques communes avec la stéatose hépatique non alcoolique (NAFLD), nos résultats renseigneront non seulement sur les mécanismes associés à la sévérité des infections à VHC de génotype 3, mais pourraient également éclairer les mécanismes associés à la NAFLD, une maladie dont la prépondérance s’accroit à l’échelle mondiale.

Hypothèses : Les usagers de drogues injectables (UDI) présentent un risque élevé de développer une tuberculose (TB), avec une prévalence estimée entre 1.6% et 5.8% à Hai Phong, Vietnam. L’hypothèse de cette étude est que ce risque ne peut être éliminé qu’en combinant plusieurs interventions visant à améliorer le diagnostic de la maladie et sa prise en charge. Ces interventions menées par des organisations communautaires et adaptées à la population marginalisée des UDI feront l’objet d’un essai pilote avant d’envisager une étude interventionnelle à large échelle. Elles comprennent : (i) un dépistage communautaire de masse de la TB par une enquête type RDS (Respondent-Driven Sampling) parmi les UDI; (ii) la détermination du meilleur algorithme de dépistage de la TB au niveau communautaire; (iii) le traitement de la TB latente par une dose hebdomadaire d’isoniazide/rifapentine pendant 12 semaines; et (iv) la recherche de cas-contacts menée par les pairs au sein du réseau d’UDI pour chaque cas diagnostiqué de TB.

Objectifs : L’objectif général est de piloter et d’évaluer des interventions communautaires ayant pour objectif de contrôler la TB chez les UDI au Vietnam.

Les objectifs spécifiques de l’étude sont :

1. Parmi les interventions pilotées :

– Évaluer la faisabilité et le rendement du dépistage de masse de la TB en utilisant une approche de type RDS à base communautaire ;

– Élaborer le meilleur algorithme de dépistage de la TB au niveau communautaire parmi les participants à la RDS ;

– Évaluer la faisabilité de détecter et dépister les ‘cas-contacts’ (autour d’un cas diagnostiqué de TB) par les pairs, en se concentrant sur les réseaux d’UDI ;

– Évaluer l’efficacité de l’orientation vers les soins, par les pairs, des UDI ayant une TB diagnostiquée lors de la RDS ;

– Évaluer l’acceptabilité, l’innocuité, l’adhérence et le coût d’un traitement d’une dose hebdomadaire d’isoniazide/rifapentine (3HP) pendant 12 semaines pour prévenir la TB chez les participants à la RDS ayant un test QuantiFERON positif ;

2. Estimer la prévalence de la tuberculose latente (TBL) chez les participants à la RDS 
3. Identifier les facteurs associés à la TB active et à la TBL chez les participants à la RDS.

Design de l’étude : Une enquête transversale auprès d’UDI recrutés par une méthode RDS, et une étude longitudinale pilote du traitement 3HP auprès d’un sous-échantillon de ces UDI, suivis pendant 3 mois.

Population de l’étude : 1000 UDI actifs seront recrutés via l’enquête RDS. Un échantillon de 320 UDI sélectionnés au hasard permettra d’estimer la prévalence de TB latente par un test QuantiFERON. Les UDI avec une TB latente seront éligibles à la sous-étude 3HP.

Déroulement de l’étude : L’enquête RDS se déroulera dans 2 sites communautaires. Pour chaque participant, un questionnaire sera réalisé par un pair concernant les facteurs de risque de TB et les tests de l’algorithme de dépistage seront réalisés : questions standards sur les symptômes liés à la TB, CRP, radiographie thoracique avec lecture automatisée par logiciel d’intelligence artificielle (CAD4TB) et Xpert® MTB/RIF sur un crachat. Les participants diagnostiqués avec une TB seront référés à l’hôpital TB de la ville pour traitement. Un test QuantiFERON sera réalisé sur l’échantillon sélectionné (N=320). Une séance de counselling sur la réduction des risques sera réalisée par un pair. Les participants à la sous-étude 3HP recevront le traitement dans l’hôpital TB de la ville et auront 3 visites de suivi. Les pairs organiseront la recherche de cas-contacts au sein du réseau des UDI pour tous les cas de TB diagnostiqués.

Faisabilité : L’expérience importante du groupe DRIVE, dans le domaine de la TB, en recherche communautaire chez les UDI au Vietnam et le soutien important du programme national TB, sont des atouts pour la faisabilité de ce projet.

Résultats attendus : Le principal résultat attendu sera de définir la combinaison d’interventions dont l’efficacité sera évaluée dans un futur projet avec passage à l’échelle, en vue d’éliminer la TB chez les UDI, jamais réalisée à ce jour, en prenant l’exemple de Hai Phong.

            Les personnes vivant avec le VIH (PVVIH) peuvent développer des pathologies inflammatoires et auto-immunes. Ces patients peuvent donc nécessiter l’utilisation de traitement immunosuppresseur (IS) dans les formes sévères. Il existe peu de données sur ces pathologies et leur évolution chez les PVVIH. Seules des données rétrospectives issues de case-reports ou de petites séries sont disponibles.  Pourtant l’association de l’infection par le VIH à ces pathologies soulève plusieurs questions d’ordre épidémiologique, thérapeutique et fondamental. En effet, la gravité, l’évolution de ces patients sur le plan du VIH et de la pathologie inflammatoire, la nécessité d’un traitement immunosuppresseur ainsi que son efficacité et sa tolérance sont peu connues. Un travail réalisé par l’équipe soumettant ce projet met en évidence une proportion de patient sous traitement étonnamment faible (23%), et au moins un épisode infectieux intercurrent pour 28 % des patients.

 Le but de ce projet est la mise en place d’une étude nationale de suivi des PVVIH porteurs de ce type de pathologies afin de colliger la prévalence de ces diagnostics, l’évolution des pathologies, la mise en place des traitements IS, la survenue de complications infectieuses et explorer les marqueurs d’activation inflammatoire et immunitaire.

La mise en place d’une telle étude nous parait nécessiter un projet préliminaire de faisabilité et d’une première description de ses patients suivis en France.

La difficulté majeure de ce projet est le recensement des cas qui de notre expérience est complexe. Nous proposons donc de rechercher dans l’ensemble des centres de suivi des patients VIH les patients atteints de maladies auto-immunes et inflammatoires par deux méthodes : la requête informatisée sur les antécédents et le recours aux médecins suivant les PVVIH.

Nous espérons pouvoir inclure entre 300 et 400 patients dans ce travail préliminaire et en réaliserons une analyse descriptive rétrospective sur les paramètres simples du VIH et du suivi de ces patients.

Le financement demandé permettra la réalisation du questionnaire et des procédures réglementaires, l’envoi et l’analyse des données et la réalisation de réunion de groupes de travail portant à développer les projets ancillaires.

Avec la chronicisation de l’infection à VIH, liée à l’augmentation de la survie depuis l’introduction des thérapies antirétrovirales combinées (cART) en 1997, les cancers sont devenus une cause majeure de morbidité  et de mortalité dans l’infection à VIH. Comparativement à la population générale, les personnes infectées par le VIH (PVVIH) ont un risque élevé de cancers classant SIDA (sarcome de Kaposi (SK), lymphome non Hodgkinien (LNH) et cancer du col de l’utérus) et de cancers non classant SIDA (poumon, maladie de Hodgkin, foie, canal anal, …). Les sur-risques diffèrent selon le type de cancer allant d’un risque multiplié par 3 pour le cancer du col à un risque multiplié par 300 pour le SK. A partir des données des PVVIH suivies dans la cohorte hospitalière française sur l’infection à VIH (FHDH ANRS CO4) et de celles de la population générale à travers le réseau français des registres de cancers en France (FRANCIM), ce projet étudiera les évolutions temporelles de l’incidence et du risque des cancers les plus fréquents chez les PVVIH entre 1997 et 2018. Alors que les combinaisons antirétrovirales puissantes sont disponibles depuis plus de 20 ans, qu’elles sont initiées de plus en plus tôt après le diagnostic d’infection et que la population infectée par le VIH vieillit, ce projet vise à étudier l’incidence des cancers classant et non classant SIDA les plus fréquents dans la population VIH en générale et dans celle des plus de 50 ans en particulier ainsi que le risque de second cancer qui encore très peu été étudié en les comparant aux risques observés en population générale. Le sur-risque de cancer chez les patients ayant restauré leur immunité sous traitement (ayant un taux de CD4 ≥500/mm3 depuis au moins 2 ans sous traitement) sera également analysé afin d’étudier mesurer l’effet de l’initiation précoce des traitements antirétroviraux sur le risque de cancer.