Trois ans après son lancement, le projet AFROSCREEN remplit tous ses objectifs.
Dernière mise à jour le 15 janvier 2025
Les acteurs du projet AFROSCREEN, financé à hauteur de 10 M€ par l’Agence française de développement (AFD), œuvrent depuis 2021 à la mise en place ou le renforcement de plateformes de séquençage et la constitution d’un réseau opérationnel de surveillance des pathogènes émergents en Afrique de l’Ouest, Centrale et à Madagascar. Fort de 25 partenaires dans 13 pays d’Afrique subsaharienne, AFROSCREEN permet d’améliorer la détection, la caractérisation et la surveillance génomique des agents pathogènes émergents pour la préparation et la réponse aux épidémies. Le projet AFROSCREEN, coordonné par l’ANRS Maladies infectieuses émergentes, agence autonome de l’Inserm, dans le cadre d’un consortium avec l’Institut Pasteur et l’Institut de recherche pour le développement (IRD), a été lancé en juillet 2021 pour riposter à l’épidémie de Covid-19.
Les résultats seront présentés lors du colloque régional AFROSCREEN les 29 et 30 mai 2024 à Dakar au Sénégal en présence de l’ensemble des partenaires scientifiques, techniques et financiers, ainsi que du CDC Afrique et de l’OMS.
Le séquençage génomique constitue aujourd’hui un outil de santé publique essentiel pour détecter et suivre les agents pathogènes infectieux à potentiel épidémique. Une meilleure compréhension du génome des pathogènes et de leur évolution génétique permet d’aiguiller la production de tests diagnostiques, de médicaments et de vaccins conduisant à un meilleur contrôle des épidémies à l’échelle locale comme au niveau international.
La pandémie de Covid-19 a mis en exergue les disparités entre les continents en termes de dispositifs de surveillance et de séquençage. Fin octobre 2021, sur les 4,6 millions de séquences partagées sur l’outil public et gratuit GISAID[1] au niveau mondial, seules 49 000 provenaient du continent africain, représentant moins de 1 % des cas de Covid-19 diagnostiqués sur ce continent.
Fort de ce constat, AFROSCREEN a été conçu pour améliorer les activités de préparation et de réponse au niveau régional, accompagner les décideurs dans la définition des priorités de santé publique de chacun des pays partenaires et produire des données pour alimenter l’effort international en santé publique.
[1] La plateforme en libre accès GISAID permet le partage rapide de données (séquences génétiques et données cliniques et épidémiologiques associées aux virus) des virus de la grippe et du SARS-CoV-2. www.gisaid.org
Les 29 et 30 mai 2024 a lieu à Dakar au Sénégal le « Colloque régional AFROSCREEN : un réseau de surveillance génomique des pathogènes émergents ». À cette occasion se réunissent partenaires, représentants du CDC Afrique et de l’OMS, autorités sanitaires des pays concernés et bailleurs de fonds internationaux. L’objectif de ce colloque est de faire le bilan des acquis scientifiques et techniques du projet et de discuter des perspectives futures permettant de capitaliser sur ce réseau.
Trois ans après son lancement, le projet AFROSCREEN a permis de :
Ce réseau est désormais mobilisable rapidement en cas d’émergence ou de réémergence de pathogènes à fort potentiel épidémique au-delà du SARS-CoV-2 : grippe, Mpox, dengue, Lassa, chikungunya, Marburg, etc.
Contact scientifique :
Responsable scientifique : Eric D’Ortenzio, eric.dortenzio@anrs.fr
Contacts presse :
ANRS Maladies infectieuses émergentes : presse@anrs.fr
Institut de recherche pour le développement : presse@ird.fr
Institut Pasteur : Aurélie Perthuison, Myriam Rebeyrotte, presse@pasteur.fr
Un réseau de surveillance génomique des pathogènes émergents
13 mai 2024