Winning projects and candidates

Haiti a traversé plusieurs périodes historiques troubles en lien avec une instabilité politique et des évènements climatiques majeurs comme le tremblement de terre en 2010. Les discriminations liés à l'orientation sexuelle y sont également répandues. Dans ce contexte, un nombre important d'hommes a quitté Haïti pour s'installer en Guyane française. Ils représentnt ainsi une des plus grandes communautés issues de l'immigration en Guyane.

Le projet PARCOURS D’HAÏTI (2021–2023), soutenu par l’ANRS, Sidaction et l’ICM, a permis de documenter les vulnérabilités sexuelles de la population haïtienne migrante en Guyane, notamment chez les femmes. Les premiers résultats issus de l’analyse des données transversales et biographiques du projet PARCOURS D’HAÏTI montrent que les violences sexuelles sont également fréquemment rapportés par les hommes. Parmi l’ensemble des hommes haitiens répondants (n=687), 10 (1,5%) ont rapporté être entré dans la sexualité par un rapport forcé et 40 (6%) l’avoir accepté sans l’avoir souhaité. De plus, 59 (soit 9 %) ont déclaré avoir été exposés à des violences sexuelles au cours de la vie. Ces rapports sexuels forcés sont le plus souvent survenus dans le pays d’origine (71%) et dans une moindre mesure en Guyane (37%). Les HSH sont 23% (14/60) à rapporter avoir vécu des violences sexuelles au cours de leur vie contre 7% (45/603) parmi les autres hommes (p < 0,001). Les hommes vivant avec le VIH étaient également plus nombreux à déclarer avoir vécu des violences sexuelles (16% ; 17/109) que les autres hommes (8% ; 42/554) (p=0.007).

Dans la continuité de ces travaux, un nouveau volet de recherche (2025–2027), intitulé Santé sexuelle et violences sexuelles au cours du parcours de vie et de migration des hommes originaires d’Haïti en Guyane française, s’attache à explorer un angle encore très peu étudié : les violences sexuelles vécues par les hommes haïtiens, et leurs conséquences sur la santé sexuelle, la santé mentale et l’accès aux soins dans un contexte migratoire et de précarité. L’objectif principal est ainsi d’explorer l’impact des expériences de violences sexuelles vécues par les hommes originaires d’Haïti sur leurs parcours de soins, leur santé mentale et leur sexualité, dans un contexte de précarité et de mobilités transnationales. En complément des analyses actuellement menées à partir des données de l’enquête quantitative, une étude qualitative sera menée en Guyane et reposera sur des entretiens semi-directifs qui seront réalisés pour approfondir la compréhension des expériences vécues par les hommes originaires d’Haïti ayant subi ou été témoins de violences sexuelles. Des entretiens seront également menés avec les professionnels de santé et du secteur associatif. Une revue narrative de la littérature sur cette thématique sera réalisée. Des entretiens seront menés avec des experts de la situation en Haïti afin d’élaborer un cadre conceptuel explicatif des violences sexuelles subies et perpétuées en Haïti et leurs déterminants. 

Ce travail mettra en lumière les formes spécifiques que peut prendre la violence sexuelle envers les hommes, ainsi que les mécanismes d’invisibilisation, de banalisation ou de non-reconnaissance de ces violences, tant du côté des personnes concernées que des professionnel·les de santé. En ce sens, le projet contribuera à améliorer le repérage, à réduire les risques aggravant la santé mentale et sexuelle des personnes concernées, et à renforcer la formation et la sensibilisation des acteurs du soin.

Contexte et justification : Après la pandémie de la COVID-19, la tuberculose (TB) redevient la principale cause de décès due à un seul agent infectieux avec un nombre de personnes décédées de TB en 2023 estimé à 1,25 millions à travers le monde. Les migrants, réfugiés et personnes déplacées internes (PDIs) présentent une vulnérabilité accrue à la TB pour plusieurs raisons. D’une part, ils font face à des conditions de promiscuité qui augmentent le risque d’exposition au bacille de la TB. Les situations d’insécurité alimentaire de stress chronique auxquelles ils sont confrontés et l’interruption des soins du VIH pour les personnes infectées affectent leur immunité et augmentent le risque de développement de la TB maladie après exposition. D’autre part, l’accès limité aux services de santé peut entraîner un diagnostic plus tardif et des ruptures de traitement, ce qui accroît la probabilité de formes graves, de décès, et de récidives de la TB, et favorisent l’émergence de la résistance médicamenteuse. Le Burkina Faso est particulièrement touché par ce double défi du nombre croissants de PDIs et du fardeau de la TB. Le pays fait face à un défi sécuritaire depuis 2015 responsable de plus de 2 millions de PDIs à la date du 31/12/2023. Le Sahel, le Centre-Nord, le Nord, l’Est et la Boucle du Mouhoun sont les régions les plus affectées. Au vu des besoins en santé pressant des PDIs et de la complexité de leur situation caractérisée par l’intersection de différents facteurs de risque, il est nécessaire de développer des interventions innovantes prenant en compte l’ensemble des déterminants de santé, leur perspectives ainsi que celle des acteurs. Le présent contrat d’initiation vise à réaliser une analyse de situation en vue de proposer une intervention innovante permettant d’améliorer le dépistage et la prise en charge de la TB chez les PDIs au Burkina Faso.

Objectif : L’objectif général de ce contrat d’initiation est de développer une analyse de situation permettant de mieux comprendre les besoins, barrières et atouts dans le dépistage précoce et la prise en charge de la TB chez les PDI au Burkina Faso, en vue de co-construire une intervention pour renforcer cette prise en charge.

Méthodologie : Il s’agira d’une étude transversale descriptive multidisciplinaire associant analyse documentaire, épidémiologique et recherche qualitative, qui se déroulera au Burkina Faso.

Population d’étude : L’étude qualitative se fera auprès des acteurs de la lutte contre la TB et auprès de PDIs atteintes de TB. L’analyse quantitative portera sur des données extraites du système d’information sanitaire (DHIS2) du Burkina Faso, des rapports d’activités du PNT et des ONG, mais aussi des rapports d’enquêtes.

Analyse des données : Pour les données qualitatives, les entretiens individuels semi-structurés seront intégralement transcrits et analysées à l’aide du logiciel QDA Miner. Les données quantitatives feront l’objet d’analyses descriptives (fréquences, proportions, taux) de série chronologique sur plusieurs années à l’aide du logiciel R.

Calendrier prévisionnel : L’étude est prévue se dérouler sur 12 mois.

Résultats attendus : A la fin de cette étude, il est attendu une proposition de piste d’intervention pour améliorer le dépistage et la prise en charge de la TB chez les PDIs.

Les traitements actuels permettent rarement de guérir les patients chroniquement infectés par HDV. De nouveaux agents ciblant directement la réplication de HDV pourraient donc permettre d’améliorer l’arsenal thérapeutique actuel. L’objectif du projet est d’apporter la preuve de concept que l’utilisation d’oligonucléotides antisens (ASO) dirigés contre les ARNs HDV seraient efficaces pour cibler l’infection HDV et de décortiquer précisément leurs mécanismes d’action. Nous avons synthétisé 112 ASOs ciblant HDV et les avons criblés pour leur effet antiviral dans des cellules HuH7-NTCP différenciées. Dix-huit candidats ASOs ont permis une diminution de plus de 80% du nombres de cellules infectées par HDV sans toxicité avec une dose de 1 µM. Parmi eux, 6 ont été sélectionnés pour confirmation de leur effet antiviral avec différentes doses. Les EC50 obtenues ont atteint le nanomolaire.

Objectif #1: Comprendre le mode d’action direct des ASOs anti-HDV. Nous déterminerons si les ASOs anti-HDV induisent une dégradation des ARNs HDV par des expériences de stabilité des ARNs combinés à des RT-ddPCR spécifiques. Si c’est le cas, nous déterminerons si la RNAse H est impliquée dans le processus par des expériences de pertes de fonction. Nous utiliserons également des digestions avec la RNAse R et des fractionnements cytoplasm/noyau pour comprendre si les ASOs anti-HDV peuvent agir sur les ARN HDV en conformation bâtonnet ou s’ils agissent uniquement sur les multimères linéaires nucléaires formés pendant l’amplification en cercle roulant d’HDV. Nous étudierons des mécanismes alternatifs possible d’inhibition de HDV par les ASOs anti-HDV. En fonction de la séquence qu’ils ciblent, les ASOs pourrait inhiber la synthèse des ARN HDV, son activité ribozyme, sa ligation ou l’association des antigènes viraux à HDV-G ou HDV-AG par encombrement stérique par exemple. Toutes ces hypothèses seront testées par analyses des ARN naissants, électrophorèse native et immunoprécipitation ARN.

Objectif #2: Déterminer si les ASOs anti-HDV ont aussi un mécanisme antiviral indirect. En raison de leurs propriétés physiques, les ASOs peuvent aussi stimuler les récepteurs de l’immunité innée et donc présenter un mode d’action antiviral secondaire via l’activation de réponses innées. En utilisant des cellules rapportrices, des cellules sanguines humaines ainsi que des hépatocytes immunocompétents, nous évaluerons les propriétés immunostimulatrices des ASO santi-HDV. Si nous en mettons en évidence, nous déterminerons si celles-ci participent à l’effet antiviral des ASOs anti-HDV en utilisant des milieux conditionnés pour traiter des cellules dHepaRG infectées par HDV.

Objectif #3: Détermination d’un possible effet synergique/additive des ASOs anti-HDV et anti-HBV in vitro. Comme la sécrétion des particules HDV dépend de la synthèse d’HBsAg, des ASOs ciblant les ARN HBV devrait en théorie limiter la propagation d’HDV. Nous testerons cette hypothèse, encore inexplorée avec un ASOs HBV dans le cas de co-infection HBV/HDV. De plus, nous déterminerons si la combinaison d’ASOs anti-HBV et anti-HDV augmente l’effet antiviral sur HDV.

Objectif #4: Validation in vivo de l’efficacité d’un ASOs anti-HDV pour bloquer l’infection HDV et détermination d’un effet synergique/additif avec un ASOs anti-HBV. Tout d’abord, nous testerons l’effet d’un candidat ASOs anti-HDV en combinaison ou non avec du Bepirovirsen dans des souris humanisées pour le foie infectées par HBV et HDV. Enfin, si des propriétés immunostimulatrices ont été mise en évidence pour les ASOs anti-HDV, nous validerons notre nouvelle approche thérapeutique dans un modèle de souris immunocompétentes (souris exprimant une version humanisée chimérique de NTCP infectées par HDV et des AAV-HBV) pour évaluer la contribution de l’effet indirect des ASOs anti-HDV dans l’effet antiviral global.

Les données générées permettront d’aller vers le développement de stratégies utilisant des ASOs pour traiter l’infection HDV chronique.

Alors que depuis près de vingt ans, la lutte contre le VIH/sida a été réorganisée à l’échelle globale autour des « populations clés », le public des hommes qui n’en font pas partie reste une population peu prise en compte tant par les recherches que les actions de lutte contre l’épidémie en Afrique subsaharienne. Pourtant la littérature établit un constat sans ambigüité : dans cette région, les femmes sont plus touchées par le VIH/sida mais les hommes (hors « populations clés ») ont plus de retard dans le recours aux services de santé liées au VIH/sida, en particulier concernant le dépistage et l’accès aux traitements.

Face à ce retard, ce projet de recherche socio-anthropologique a pour objectif d’analyser les liens qui existent entre la construction des normes de la masculinité et les comportements de santé, dans trois pays d’Afrique de l’Ouest : la Côte d’Ivoire, le Nigeria et le Sénégal. Il propose une analyse conjointe de l’expérience intime et sociale des hommes face au VIH/sida et de la place qui leur est conférée dans les dispositifs de lutte contre l’épidémie. Il vise ainsi à pallier un manque dans la littérature récente en sciences sociales sur les hommes et le VIH/sida en Afrique de l’Ouest, en comparant trois pays et en tenant compte du contexte actuel d’essor de la prévention biomédicale.

Les objectifs spécifiques sont d’analyser : 1/ Les conceptions et pratiques masculines liées au VIH/sida, aux risques et à la prévention. 2/ Les conceptions et pratiques masculines liées aux thérapeutiques et aux soins. 3/ Les conceptions et pratiques masculines en matière de conjugalité, de sexualité et de santé reproductive. 4/ L’« échange économico-sexuel » du point de vue masculin. 5/ La place des hommes et des masculinités dans la lutte contre le VIH/sida.

L’enquête sera menée principalement auprès d’hommes, mais aussi de femmes qui pourront livrer leurs perspectives sur les masculinités. La méthodologie de l’étude comprendra des entretiens biographiques et semi-directifs, des observations ethnographiques, des analyses documentaires. Nous prévoyons de réaliser dans chaque pays des entretiens avec cinquante hommes et vingt femmes, auxquels s’ajoutera une vingtaine d’entretiens avec des acteurs de la lutte contre le VIH/sida.

L’ambition de ce projet est d’apporter tant des connaissances qui permettent de répondre à des enjeux de santé publique, en aidant à mieux comprendre les raisons du retard des hommes, que des analyses plus fondamentales des logiques de production du genre au travers des comportements de santé ou sexuels.

Contexte : L’hépatite Delta est la forme la plus sévère des hépatites virales, accélérant la progression des complications hépatiques chez les personnes déjà atteintes d’hépatite B. En Afrique subsaharienne, environ 25 % des 64,7 millions de personnes vivant avec l’hépatite B (pvVHB) chronique sont également infectées par le virus de l’hépatite D (VHD). À ce jour, aucune cohorte publiée ne décrit l’histoire naturelle de l’infection par le VHD en Afrique. Les données disponibles restent limitées à de petites études nationales, insuffisantes pour refléter la diversité de l’épidémiologie, des génotypes et des capacités diagnostiques du continent

Objectifs : Le projet HEPSA-D vise à évaluer la faisabilité de la mise en place d’une cohorte multicentrique permettant de refléter la diversité régionale, de générer des données fiables sur l’histoire naturelle de l’infection par le VHD et d’orienter les stratégies de diagnostic et de suivi en Afrique subsaharienne.

Méthodologie : Environ 7 000 personnes vivant avec le VHB (pvVHB) ont été dépistées pour le VHD dans les quatre pays participants. Nous prévoyons de tester environ 2 500 pvVHB supplémentaires au Sénégal et à Madagascar. La cohorte finale comprendra 250 participants co-infectés VHB-VHD (~50 par site), suivis sur deux ans selon un protocole harmonisé incluant examen clinique, évaluation de la fibrose, surveillance échographique du carcinome hépatocellulaire, et analyses virologiques (charge virale et génotypage). La faisabilité sera évaluée selon la capacité des sites à recruter et retenir les participants et la complétude des mesures clés. Les échantillons biologiques seront centralisés pour analyse dans un laboratoire de référence (CNR Delta) avec transfert de compétences vers les sites africains. Une étude cas-témoins (500 témoins mono-infecté B) imbriquée permettra d’identifier les déterminants de la co-infection.

Considérations éthiques : L’OMS recommande le dépistage systématique du VHD chez les pvVHB, et ce projet renforce cette pratique dans les sites participants. Les équipes disposent des autorisations éthiques pour la collecte et l’analyse de données anonymisées. Ainsi, des amendements aux protocoles seront soumis aux comités éthiques locaux pour couvrir les activités spécifiques de ce projet. Les inclusions se feront sur consentement éclairé, avec respect strict de l’anonymat et de la confidentialité.

Résultats attendus : La mise en place d’une cohorte multicentrique de 250 personnes co-infectées VHB-VHD dans quatre pays permettra de générer des données sur la prévalence et la distribution des génotypes de VHD. Les résultats cliniques préliminaires (cirrhose, CHC, mortalité) refléteront le fardeau local. Nous prévoyons une suppression de l’ADN du VHB chez ≥80 % des participants sous TDF et un renforcement durable des capacités diagnostiques de l’hépatite D au niveau des pays participants.

Conclusion : Ce projet permettra de confirmer la faisabilité d’une cohorte multicentrique sur l’hépatite Delta en Afrique et de renforcer les capacités locales de dépistage, de suivi et de recherche. Il posera les bases d’études prospectives de plus grande ampleur pour la compréhension de l’histoire naturelle de l’hépatite D en contexte africain.

Durée de l’étude : 3 ans

L’Organisation mondiale de la Santé (OMS) a classé Mycobacterium tuberculosis, l’agent responsable de la tuberculose, parmi les pathogènes prioritaires en terme de danger sanitaire. Si de nouvelles stratégies de lutte contre la tuberculose paraissent indispensable, l’histoire révèle une cohabitation plurimillénaire entre l’agent pathogène et l’être humain, qui a su discriminer les manifestations cliniques associées aux mycobactéries dès l’Antiquité. La réévaluation de ces connaissances, soutenue par les outils analytiques et biologiques modernes, pourrait tout à fait contribuer à enrichir ce panel de stratégies innovants.

Fruit de millénaires d’observations, d’expérimentations et d’optimisations thérapeutiques à travers le monde, cet ensemble de savoirs issus de cultures, de pratiques et d’environnements variés constitue en effet aujourd’hui un riche vivier ethnopharmacologique. Ce patrimoine médical, longtemps transmis et affiné, suscite un regain d’intérêt en tant que source potentielle d’alternatives thérapeutiques complémentaires ou de composés bioactifs innovants, contre Mycobacterium tuberculosis. Ce projet repose sur un Réseau Thématique (IRGAP, https://atpmf.unistra.fr/) en pleine émergence, sur une méthodologie historico-déductive mise récemment en place et des premières pistes de préparations anti-tuberculeuses étudiées. Ces études préliminaires permettent de proposer un programme, divisé en 3 WP.

Objectifs et méthodes. Nous proposons d’établir la preuve de concept de l’existence de pistes originales/intéressantes de lutte contre la tuberculose à travers une démarche historico-déductive, et de consolider une suite d’analyses pour caractériser l'effet d'une préparation ancienne pour soigner la tuberculose. Il s’agira ainsi d’identifier différentes préparations issues de corpus gréco-romains et médiévaux arabes (WP1), de développer un outil informatique regroupant ces informations, et permettant des analyses à façon de ces corpus (WP2). Enfin il s’agira de tester sur un exemple de préparation, les méthodes adéquate pour les reproduire, les étudier et identifier des molécules d’intérêt (WP3). Ceci permettra une première évaluation de la faisabilité d’un tel projet à l’aune de la science moderne.

Echéancier. Le projet sur douze mois propose dans un premier temps de rassembler l’ensemble des corpus, manuscrits d’intérêt centrés sur quelques auteurs de la période gréco-romaine et médiévale, de définir les symptômes les plus pertinents tout en mettant en place des outils d’analyses informatiques via une interface Mediawiki, et des outils de culture et d’étude de la bactérie Mycobacterium tuberculosis – la version déclassée P2- dans l’ensemble des laboratoires impliqués qui proposent des laboratoires type L2. Dans un deuxième temps, les étudiants impliqués dans le projet mettront à profit ces environnements pour identifier des préparations d’intérêt, les analyser à travers les outils informatiques mis en place et sur un exemple de préparation déjà à l’étude, d’identifier des molécules actives.

Résultats attendus. Nous comptons augmenter le répertoire de préparation identifiés dans des manuscrits anciens à au minimum une cinquantaine d’ingrédients et/ou préparations. Dans une approche similaire sur les collyres, nous avons réuni une collection de près de 200 collyres et > 100 ingrédients fréquemment utilisés (WP1). La base de données sera également alimentée de ces nombreuses préparations et permettront les premières analyses sur des questions ‘tuberculose’(WP2). Par ailleurs, au vu des résultats préliminaires sur une première préparation à l’étude, l’identification de différentes molécules inhibant M. tuberculosis est tout à fait envisageable (WP3).

Perspectives. Nous souhaitons ouvrir par la suite cette approche à d’autres sources, relatives à d’autres périodes, plus récentes ou issues d’autres traditions, ainsi qu’aux pratiques traditionnelles actuelles, qui sont les héritières des connaissances anciennes. L’ensemble de ces données permettra de constituer une base de donnés importante, d’où nous pourrons identifier les préparations les plus pertinentes à étudier.

RETRANSMEM s’inscrit dans le prolongement d’une enquête sur la mémoire de la lutte contre le VIH/sida à Marseille ayant donné lieu au repérage et à la constitution d’un corpus de données, riche dans sa diversité et complexe par leur dissémination et la variété de leurs régimes d’encadrement.

L’objectif de cette recherche est d’analyser les usages et pratiques des acteurs et actrices impliqués dans le cycle de vie des données liées à cette mémoire, les distances observées entre le droit dans les livres et le droit dans les actes quant aux catégories (données pour la recherche/mémoire pour la communauté, archives/objet, etc.), et quant aux processus qui interviennent tout au long de la chaîne patrimoniale, de l'accès à la réutilisation en passant par la conservation, le traitement et la diffusion. 

RETRANSMEM propose de piloter une réflexion interdisciplinaire sur les enjeux juridiques et éthiques, archivistiques, politiques et sociaux que soulèvent d’une part les données produites dans le cadre de recherches qualitatives en SHS dans le champ de la santé publique et d’autre part les données patrimoniales conservées au sein de différents dispositifs de conservation du passé (musées, centres d’archives publics ou privés). Le projet est organisé autour de trois axes : 
       
(1) un état des lieux des projets récents liés aux enjeux de mémoires épidémiques, avec une attention portée à leurs politiques d’archivage des données ;      
(2) une analyse des dispositifs de conservation patrimoniaux et associatifs et la mise en œuvre du traitement des entretiens enregistrés issus de l’enquête ;   
(3) l’élaboration collective de dispositifs de partage interopérables pour ces données disséminées, dans le respect des cadres juridiques et des attentes exprimées par les premiers concernés.

L'infection par le virus de l'hépatite D (VHD), un défi majeur de santé publique à l'échelle mondiale, ne survient qu'en présence du virus de l'hépatite B (VHB) et entraîne une aggravation significative des issues cliniques, notamment une progression accélérée de la fibrose et un risque accru de carcinome hépatocellulaire (CHC). Malgré la gravité de la co-infection VHB/VHD, les mécanismes moléculaires sous-jacents restent mal compris. Cette étude vise à élucider l'interaction entre le VHB et le VHD en utilisant des approches transcriptomiques avancées et des analyses spatiales de résections hépatiques provenant d'une cohorte mongole atteinte d'hépatite delta chronique (CHD).

En exploitant la transcriptomique spatiale, l’immunofluorescence et le séquençage de l'ARN « bulk » et « single cell » (scRNA-Seq), nous étudierons comment la localisation et le statut infectieux des hépatocytes influencent la progression de la maladie. Plus précisément, nous analyserons des échantillons appariés de tissus tumoraux et non tumoraux de 25 patients atteints de CHC lié au VHB et 25 patients atteints de CHC lié à la CHD afin de :

1. Caractériser la distribution spatiale des hépatocytes infectés par le VHB et le VHD dans les tissus tumoraux et non tumoraux adjacents.
2. Évaluer comment les populations d'hépatocytes infectés modulent les interactions avec le microenvironnement hépatique, l'infiltration immunitaire et les profils métaboliques à travers différents stades de fibrose et d'inflammation.

La Mongolie, qui présente le taux de mortalité par cancer du foie le plus élevé au monde ainsi qu'une prévalence endémique du VHD, constitue un cadre unique pour cette recherche. Les études transcriptomiques existantes ont identifié des sous-classes distinctes de CHC ; cependant, les analyses en masse ne capturent pas la complexité cellulaire ni la dynamique des infections. Des découvertes récentes indiquent que le VHB et le VHD présentent une ségrégation spatiale au sein des foies infectés, influençant ainsi les réponses inflammatoires locales et l'infiltration des cellules immunitaires. En intégrant une résolution unicellulaire et une cartographie spatiale, cette étude apportera un éclairage inédit sur la manière dont le VHD et le VHB contribuent différemment à la pathogenèse du CHC.

Cette recherche approfondira notre compréhension mécanistique du CHC associé au VHB et au VHD en identifiant les principales voies moléculaires impliquées dans la progression tumorale et la modulation immunitaire. Les résultats obtenus favoriseront le développement de stratégies d'oncologie de précision et d'interventions thérapeutiques ciblées pour les patients co-infectés par le VHB/VHD, répondant ainsi à un besoin clinique critique en hépatologie et en traitement du cancer du foie.