Winning projects and candidates

La variole simienne est causée par le Monkeypox virus et il est actuellement la cause d’une émergence épidémique inhabituelle dans des pays où ce virus n’est pas endémique. Actuellement plus de 3200 cas ont été recensés majoritairement, mais pas exclusivement, chez des hommes ayant des relations sexuelles avec des hommes n’ayant pas de lien direct avec des personnes de retour de zone endémique. La maladie est bégnine, mais fait l’objet d’une attention particulière des autorités de santé. La propagation du virus se fait essentiellement par contact direct avec les lésions cutanées ou les muqueuses de personnes malades, par contact avec des fluides biologiques ainsi que par les gouttelettes exhalées, les éternuements ou les postillons. La contamination peut aussi survenir au contact de l’environnement des personnes malades, avec le linge de lit ou de bain, les vêtements et la vaisselle. Afin d’améliorer le contrôle de la circulation du virus, il est proposé dans ce projet d’évaluer la stabilité du Monkeypox virus sur différentes surfaces ou matières (inox, verre, plastique, tissu) dans différentes conditions climatiques, de 10 à 35 °C et de 30 à 75 % d’humidité relative. L’évaluation de la stabilité environnementale sera réalisée par quantification au cours du temps du nombre de particules virale infectieuses par plages de lyse et par évaluation de l’ADN résiduel par qPCR.

Il est également proposé d’évaluer différentes méthodes de décontamination représentant différents concepts d’emploi, brouillard de peroxyde d’hydrogène, application d’une mousse contenant de l’hypochlorite de sodium, pulvérisation d’acide peracétique et irradiation lumineuse avec des UVc.

Cette étude permettra donc d’augmenter la connaissance sur le Monkeypox virus dans des domaines où les données publiques sont rares.

L'incidence mondiale des maladies causées par des arbovirus, notamment ceux transmis par les moustiques Aedes aegypti et Aedes albopictus, a considérablement augmenté, alimentée par le changement climatique, l'urbanisation et les voyages internationaux. Ces vecteurs ont historiquement propagé des maladies dévastatrices telles que la fièvre jaune, la dengue et le Zika. Les stratégies de contrôle reposant sur les insecticides sont devenues moins efficaces en raison de la résistance et des impacts environnementaux, nécessitant des approches alternatives.

Les moustiques montrent une tolérance remarquable aux infections virales, une aptitude critique pour la transmission des arbovirus. Cette tolérance, contrairement à la résistance (élimination du virus), permet aux moustiques d'héberger et de propager des virus sans succomber à la maladie. Réduire la tolérance virale des moustiques pourrait écourter le cycle de vie des arbovirus, empêchant ainsi la transmission. Le projet ArboRetro vise à exploiter ce mécanisme pour rendre les moustiques intolérants aux arbovirus, entravant ainsi leur rôle en tant que vecteurs.

Nos travaux précédents ont montré que les rétrotransposons, un type d’élément transposable possédant une transcriptase inverse, peuvent produire des molécules d’ADN d’origine virale qui améliorent la réponse antivirale des mouches drosophiles. Chez les moustiques, nous avons observé que l'inhibition pharmacologique de la transcriptase inverse provoque la mort des insectes infectés, indiquant que les rétrotransposons sont également impliqués dans la tolérance virale. Le projet ArboRetro vise à exploiter cette diminution de tolérance virale pour empêcher les moustiques de transmettre efficacement les virus. Le projet repose sur une collaboration synergique intégrant l'immunité antivirale (laboratoire de Maria-Carla Saleh), la biologie des rétrotransposons (laboratoire de Gael Cristofari) et la biologie des moustiques (laboratoire de Louis Lambrechts).

ArboRetro utilisera des technologies avancées, y compris l'édition de gènes et le séquençage longue lecture, pour inactiver génétiquement des rétrotransposons spécifiques et évaluer leurs effets à long terme sur la viabilité des moustiques et la transmission des virus. Le projet émet l'hypothèse que certains rétrotransposons sont essentiels pour la tolérance virale chez les moustiques. Les objectifs incluent :

1. Identifier et inactiver génétiquement ces rétrotransposons.
2. Évaluer comment l'inactivation des rétrotransposons affecte la transmission.
3. Évaluer la prévalence de la tolérance virale dépendante de la transcriptase inverse dans les populations naturelles de moustiques.

En atteignant ces objectifs, ArboRetro ouvrira la voie à une stratégie durable et efficace pour contrôler les arbovirus transmis par les moustiques, réduisant ainsi leur impact sur la santé mondiale.

Le virus du SARS-CoV-2 a été décrit pour la première fois dans la région du Hubei en Chine en 2019. Il est l’agent étiologique de la coronavirus disease (COVID), dont le virus se développe dans les épithéliums pulmonaires avant de se propager au reste de l’organisme. Les patients présentent un tableau clinique complexe et hétérogène, allant des formes asymptomatiques aux atteintes respiratoires sévères nécessitant une aide ventilatoire – pouvant aller jusqu’à la mort du patient. Les formes graves touchent majoritairement les patients atteints de comorbidités, et la majorité des patients guérissent (plus de 98 % au dernier recensement de l’OMS). Cependant, il arrive dans de nombreux cas une persistance voire une apparition de symptômes après la phase aigue de la COVID, y compris des mois après. Parmi la liste des séquelles rapportées, on retrouve dans un quart à plus de la moitié des patients des troubles neuromusculaires, notamment des myalgies et de la fatigue musculaire. Au sein de la communauté scientifique et médicale, plusieurs hypothèses sont proposées, dont la forte production inflammatoire de cytokines, ou encore l’effondrement local du système vasculaire chez ces patients. Notre hypothèse est que ces symptômes pourraient être liés à une infection directe des virus dans les cellules musculaires. Cette hypothèse est soutenue par les données de transcriptomiques et protéomiques montrant que les fibres du muscle squelettique expriment le récepteur nécessaire à la pénétration cellulaire du virus, le récepteur angiotension converting enzyme 2 (ACE2). Nous proposons d’infecter des cellules musculaires humaines différenciées en myotubes avec différentes souches de coronavirus, incluant des souches cliniques. Tout en vérifiant que l’infection ait lieu (RT-qPCR en cinétique, rapporteur fluorescent de la présence de particules virales), nous évaluerons son effet sur les caractéristiques cellulaires (cytosquelette, quantité et positionnement des différents organites).

Dans un second temps, nous étudierons cette infection in vivo sur un modèle murin. Nous avons généré au laboratoire une lignée de souris humanisée conditionnelle exprimant le récepteur humain ACE2 (hACE2), sous le contrôle du promoteur murin mACE2, permettant une expression limitée aux organes ayant naturellement du mACE2 chez la souris. Cet allèle conditionnel est floxé, permettant ainsi l’expression de hACE2 uniquement dans les organes ciblés, et à temps choisi. Nous croiserons notre lignée avec une autre exprimant la CRE dans les cellules musculaires, sous promoteur inductible au tamoxifène HSACreERT2 ; la lignée obtenue nous permettra d’étudier une infection directement et uniquement dans le muscle à l’âge adulte.

Grâce à ce modèle, nous évaluerons dans une étude pilote la présence du virus et l’éventuelle réplication virale au sein du muscle après une inoculation par injection intra-musculaire, tout en surveillant les différents paramètres cliniques des animaux. Cette étude participera notamment à la description des temps nécessaires à mimer une phase aiguë de la COVID et à l’établissement de COVID Long. Nous décrirons ensuite les symptômes musculaires observés, en étudiant la locomotion spontanée, la force ainsi que les capacités musculaires des animaux (vitesse et endurance). Nous définirons également l’hétérogénéité de la réponse musculaire, les modifications et réorganisations du muscle en réponse à l’infection, notamment en évaluant sa structure, mais aussi la présence d’inflammation, de nécrose, de régénération et l’organisation vasculaire. D’un point de vue moléculaire nous évaluerons l’organisation des domaine nucléaires par séquençage de noyaux unique.

Ces différentes approches fourniront une vision globale du point de vue cellulaire, moléculaire et fonctionnel des effets à long terme de l’infection du tissu musculaire par le SARS-CoV-2. Notre étude permettra une meilleure compréhension de la pathophysiologie de la COVID, et permettront l’identification de pistes pour limiter leur apparition, adapter les prises en charge des patients et mettre au point des traitements ciblés sur ces formes longues.

Les infections virales pendant la grossesse augmentent le risque de troubles neurodéveloppementaux (TND) comme l'autisme et la schizophrénie à long terme. Avec l’émergence de nouveaux virus, la recherche sur les TND liés aux infections maternelles évolue constamment. Concernant le SARS-CoV-2, les enfants nés de mères infectées n’ont pas encore atteint l’âge du diagnostic de TND. Cependant, le COVID-19, via la transmission verticale mère-enfant ou les réponses immunitaires maternelles (notamment la tempête de cytokines impliquant la microglie et les astrocytes), pourrait influencer l’épidémiologie des troubles psychiatriques. Bien que certaines études aient analysé l’impact de l’exposition prénatale au SARS-CoV-2 sur des altérations neurocomportementales de type autistique chez la souris, elles restent limitées.

NeuroDevCOVID adopte une approche multidisciplinaire combinant modèles murins, organoïdes cérébraux dérivés d’iPSC, séquençage ARN, bioinformatique et données cliniques. Ses objectifs sont :

1. Développer un modèle murin MIA (activation immunitaire maternelle) pour analyser la pathogenèse via séquençage ARN et tests comportementaux.
2. Explorer la propagation du SARS-CoV-2 dans le cerveau et le rôle des tunneling nanotubes (TNTs) dans le transfert viral entre cellules gliales et neurones.
3. Étudier les interactions glie-neurone dans des organoïdes cérébraux humains exposés au virus, en se focalisant sur les réponses cytokiniques et la fonction neuronale.
4. Comparer les résultats obtenus avec les données neurodéveloppementales d’enfants nés de mères infectées.

Nous développerons un modèle murin d’activation immunitaire maternelle (MIA) pour étudier les mécanismes pathologiques encore inconnus, en mettant l’accent sur la microglie, acteur clé du développement cérébral. Nous explorerons ensuite le rôle des tunneling nanotubes (TNTs) comme voie d’invasion cérébrale du SARS-CoV-2, en analysant leur implication dans la transmission virale entre la microglie et les neurones fœtaux et leurs effets sur le neurodéveloppement à long terme. Nous utiliserons aussi des organoïdes cérébraux dérivés d’iPSC pour étudier les impacts du SARS-CoV-2 sur le cerveau humain. Nous examinerons comment les interactions glie-neurone influencent l’infection et les effets neurodéveloppementaux de l’exposition prénatale au virus. Enfin, nous suivrons le développement neurocognitif des enfants nés de mères infectées pour intégrer une dimension clinique à notre étude.

Ce projet repose sur une collaboration internationale :

• La France (Équipe A), biologist fontamental du trafic membranaire, est leader dans l’étude des Tunneling nanotubes (TNTs) et de la propagation virale, apportant des connaissances essentielles sur le neurotropisme du SARS-CoV-2.
• Le Brésil (Équipes B & D) est spécialisé dans l’utilisation d’iPSC dérivées de patients, les organoïdes cérébraux et les études de cohorte longitudinale, avec le suivi de plus de 550 enfants de 3 mois à 3 ans pour évaluer leurs trajectoires neurodéveloppementales.
• La Grèce (Équipe C) apporte son expertise sur la microglie et l’inflammation neurodéveloppementale, essentielle pour comprendre les risques de TND liés à l’activation immunitaire maternelle.

NeuroDevCOVID vise à identifier de nouveaux mécanismes de communication intercellulaire impliqués dans les déficits cognitifs des patients atteints de TND liés à l’infection maternelle par le SARS-CoV-2. Ce projet pourrait avoir une importance clinique en révélant des cibles thérapeutiques potentielles. À l’échelle mondiale, il s’inscrit dans la recherche sur les effets neurologiques post-COVID et associe des modèles innovants (souris, organoïdes cérébraux, iPSC) à des données humaines pour une large application des résultats. Il ouvre aussi la voie à l’évaluation des risques des futures pandémies virales et de la transmission materno-fœtale, dont les effets peuvent apparaître précocement ou plus tard sous forme de troubles comportementaux. Enfin, sa dimension internationale favorisera de nouvelles collaborations pour mieux répondre aux défis sanitaires liés aux maladies infectieuses émergentes.

Au cours des dernières décennies, le monde a dû faire face à de nouvelles émergences d'arbovirus, notamment le chikungunya en 2005-2006, 2013-2014 et à nouveau en 2024-2025, le Zika en 2013 et la fièvre jaune (FJ) en 2016. Le virus de la fièvre jaune (YFV), principalement transmis par le moustique anthropophile Aedes aegypti, est historiquement endémique en Afrique subsaharienne et en Amérique du Sud. Malgré la disponibilité du vaccin 17D depuis 1931, 200000 cas et 20 à 30000 décès sont encore signalés chaque année, dont 90% en Afrique. En janvier 2016, une épidémie de FJ s'est déclarée en Angola, avec plus de 3000 cas et des centaines de décès. Le YFV s'est propagé vers les pays voisins et des cas importés ont également été signalés en Chine sans initier une transmission locale. Aujourd'hui, la FJ est toujours absente de la région Asie-Pacifique, malgré l'intensification des échanges commerciaux entre l'Afrique et l'Asie. Nous avons déjà démontré que les moustiques Ae. aegypti urbains d'Asie étaient capables de transmettre expérimentalement le YFV et, dans une moindre mesure, les moustiques Aedes albopictus ruraux et Aedes malayensis forestiers. Par conséquent, ces trois espèces de moustiques ne semblent pas constituer un frein à l'émergence de la FJ sur le continent asiatique. Dans le cadre de ce projet, nous explorons l'hypothèse selon laquelle la transmission épidémique repose sur des « spillovers » à partir d'un cycle selvatique, comme cela s'est produit en Afrique subsaharienne et Amérique du Sud. En considérant la question sous l'angle du vecteur, le projet comporte quatre objectifs spécifiques : (i) dresser un inventaire des moustiques dans trois régions du Vietnam (nord, centre, sud) en considérant trois écosystèmes (urbain, rural, forestier) et préciser les préférences trophiques des moustiques, (ii) reproduire expérimentalement un scénario d’introduction de YFV en transmettant un YFV africain successivement à trois espèces différentes (Ae. aegypti, Ae. albopictus et Ae. malayensis), identifier les mutations adaptatives du virus à chaque étape et évaluer les effets sur la compétence vectorielle, (iii) vérifier si la bactérie Wolbachia, qui infecte naturellement Ae. albopictus pourrait empêcher la transmission du YFV en bloquant la réplication virale et donc en agissant comme une barrière contre l'établissement d'un cycle sylvatique, et (iv) déterminer si nous pouvons lever le frein imposé par Ae. albopictus par des infections répétées d'Ae. albopictus avec le YFV, conduisant à la sélection de variants viraux qui échappent aux effets « négatifs » de Wolbachia sur la réplication virale. Ces travaux permettront de mieux comprendre les facteurs susceptibles de conduire à l'établissement d'un cycle selvatique, condition préalable à la propagation du YFV et aux infections humaines au Vietnam et plus largement, en Asie.

Une part importante des patients du COVID-19 conserve des symptômes plus de 3 mois après l’infection initiale par le SARS-CoV-2. Ces symptômes persistants ou réémergents sont variés, avec une prédominance d’asthénie, d’altérations cognitives, et de dyspnée. La persistance de ces symptômes invalidants définit le syndrome de COVID Long, qui est maintenant considéré comme un réel problème de santé publique. Or, l’étiologie du COVID Long demeure inconnue. Nous testerons l’hypothèse qu’une réponse T antivirale inefficace sous-tend le COVID Long. Le rationnel est qu’une immunité T sous-optimale pourrait faciliter la persistance virale, et que le virus résiduel pourrait à son tour induire un dommage localisé dans les tissus et y causer une inflammation persistante.

L’étude comprendra une analyse approfondie des réponses T spécifiques du SARS-CoV-2, des marqueurs inflammatoires circulants, et de la charge virale résiduelle chez les participants de la cohorte COVID Long PERSICOR. Les patients ont déjà été recrutés par l’équipe clinique de D. Salmon-Ceron (Equipe B). Les analyses principales porteront sur un groupe de patients avec COVID long séropositifs (n=25) comparés à des convalescents avec un COVID résolu (n=25). Une analyse exploratoire sera également menée sur des patients avec COVID long séronégatifs (n=25), les données préliminaires montrant que ces patients ont parfois des réponses T antivirales faibles mais détectables. Un 4ème groupe de volontaires non-infectés (n=15) a également été inclus pour déterminer le niveau de réponses T préexistantes liées à une réactivité croisée avec les coronavirus du rhume.

Nous comparerons tout d’abord l’amplitude et l’état de différentiation des réponses T, en stimulant les PBMC avec des pools de peptides correspondant à 5 protéines du SARS-CoV2 et en analysant la productions de cytokines intracellulaires sur un cytomètre spectral (n=37 paramètres). Nous déterminerons en particulier si les réponses T folliculaires helper sont déficientes, ce qui pourrait expliquer une maturation insuffisante de la réponse anticorps.

Dans le second objectif, nous générerons des lignées T CD4+ primaires spécifiques d’épitopes immunodominants du SARS-CoV-2, car ce test sensible permet de révéler des réponses faibles, et pourrait aider ainsi à documenter l’infection dans le groupe de patients séronégatifs. La sensibilité à l’antigène des cellules T CD4+ spécifiques sera analysée, pour tester la possibilité d’une altération qualitative plus que quantitative de la réponse antivirale. Pour évaluer l’efficacité de la réponse T au niveau moléculaire, nous séquencerons les récepteurs T (TCRs) spécifiques du peptide le plus immunodominant, et déterminerons si l’avidité fonctionnelle des TCRs dominants est diminuée dans le COVID Long.

Dans le troisième objectif, nous évaluerons les marqueurs de l’inflammation résiduelle, principalement par une analyse protéomique des sérums de patients, ce qui pourrait mener à l’identification de nouvelles signatures protéiques associées au COVID Long. La charge virale sera évaluée sur les sérums et les prélèvements nasopharyngés à l’aide d’une technique sensible de PCR digitale en gouttelettes (ddPCR) mise en œuvre par l’équipe d’H. Péré (Equipe C). Une analyse intégrée de ces différents paramètres aidera à déterminer si des réponses T inefficaces corrèlent avec une inflammation résiduelle et une persistance virale. La comparaison d’échantillons obtenus avant et 3 mois après la vaccination pour les réponses T, l’inflammation, les paramètres viraux, et les symptômes sera informative sur l’effet bénéfique ou délétère de la vaccination dans le COVID Long, ce qui demeure une question d’actualité.

L’étude PERSICOT clarifiera la nature de la réponse antivirale T dans le COVID Long, qui reste peu connue. Si l’hypothèse d’une réponse T inefficace associée à une inflammation persistante est confirmée, ces données aideront à orienter la prise en charge du COVID Long, en fournissant un rationnel pour booster les réponses T spécifiques du SARS-CoV-2 par la vaccination ou l’immunostimulation.

 La pandémie de SRAS-CoV-2 étant en recul, les arbovirus, notamment ceux transmis par les moustiques, reviennent dans le haut de la liste des préoccupations mondiales de Santé publique. Le virus de la dengue reste une cause majeure d’hospitalisations et de décès dans les zones tropicales. Les « clusters » de cas de dengue et de chikungunya sont devenus courants dans le sud de l’Europe en été, et apparaissent de façon récurrente en Floride et au Texas. Le virus Zika est sporadiquement signalé en Afrique et en Asie, et le reste du monde présente un contexte également favorable à l’émergence d’une nouvelle vague épidémique telle que connue il y a sept ans. Ainsi, il est essentiel de renforcer notre attention sur les potentiels signes d’alerte, notamment en identifiant des sites sentinelles où une modification du profil habituel de transmission des arbovirus pourrait être aisément détectée. De plus, afin d’évaluer le risque d’expansion d’épidémie de l’échelle locale au niveau régional puis mondial, il est indispensable d’identifier les facteurs qui gouvernent la dynamique de transmission des arbovirus dans les territoires présentant un potentiel élevé de diffusion vers d’autres pays. Par ailleurs, dans un contexte post-COVID-19 où la population est plus réticente à faire confiance aux politiques de Santé publique, il est indispensable d’être en capacité de démontrer les bénéfices de la mise en place, ou les répercussions de l’absence de mesures, dans la lutte contre les épidémies. Le projet REASON sera réalisé dans les îles du Pacifique et plus particulièrement en Polynésie française et à Fidji. Ces territoires répondent pleinement aux critères de sites sentinelles, ils présentent un potentiel élevé de diffusion et ont un contexte favorable au déroulement d’études pilotes. En s’appuyant sur les données disponibles et celles générées par le renforcement de la surveillance de laboratoire, le projet prévoit la réalisation d’analyses phylogénétiques des souches virales. Ce travail contribuera à identifier les principales voies de diffusion des arbovirus dans le Pacifique. Les analyses épidémiologiques permettront d’établir les profils de transmission à l’échelle locale. Afin de déterminer l’impact des épidémies passées et le risque à venir, des études de séroprévalence seront réalisées chez les enfants et les adultes. Les tests utilisés détecteront de façon spécifique les anticorps contre les différents arbovirus et contre les différents sérotypes de dengue. Les modèles mathématiques précédemment utilisés pour expliquer, d’une part, la persistance de la dengue en Polynésie française et, d’autre part, la dynamique des épidémies de Flavivirus à Fiji, ont richement contribué à démontrer l’impact de la baisse du taux d’immunité sur la dynamique de transmission virale. La pandémie de COVID-19 ayant interrompue le schéma historique d’introduction et de diffusion régionale, ce projet prévoit de combiner dans des modèles mathématiques (Bayesian inference) les données de surveillance, de génomique virale, de sérologie et de climat, afin d’identifier les facteurs qui gouvernent la survenue des infections à arbovirus dans l’ère post-COVID-19. En outre, les modèles mathématiques récemment utilisés dans le cadre de la gestion de la crise COVID-19 pour évaluer le bénéfice de la mise en place de la vaccination et des rappels sur la réduction du nombre d’hospitalisation et de décès, seront transposés au contexte des arbovirus.

Alors que la pandémie de COVID-19 en Afrique Sub-Saharienne connaît une diffusion virale relativement faible, nous demandons le financement de 2 années supplémentaires pour maintenir le dispositif CO3ELSER financé par l’ANRS en 2020 (projet ECTZ147735). Dans un contexte épidémiologique forcément incertain, notre projet combine des objectifs scientifiques et opérationnels. Sur un plan scientifique, il s’agit d’analyser les réactions des populations en situation de crise sanitaire COVID-19. Sur un plan opérationnel, notre projet comporte un dispositif longitudinal pour suivre la dynamique des réactions du public à la pandémie de COVID-19. A l’occasion de ce nouveau financement, nous voudrions poursuivre ces objectifs et également, mettre d’avantage l’accent sur les enjeux d’hésitation vaccinale.

Notre projet repose sur une enquête longitudinale en population, menée par téléphone portable dans une zone rurale du Sénégal, le bassin de Niakhar en pays Sereer. Ce bassin est doté du plus ancien système de veille sanitaire et démographique d’Afrique, ce qui constitue un avantage certain au vu de nos objectifs d’analyse de l’impact de la COVID-19 sur les conditions de vie. De plus, l’analyse des perceptions des risques, croyances et pratiques préventives à l’égard du risque épidémique est particulièrement adaptée en pays Sereer au vu des résistances à la vaccination de la petite enfance. En plus que de poursuivre le recueil de données avec trois vagues d’enquête supplémentaires auprès de 600 chefs de ménage et de 2 adultes du ménage (questionnaire de 10-15mn), cette extension de notre projet nous permettra d’une part, d’étudier l’hésitation vaccinale par analyse qualitative et intégration des résultats sous forme d’items qualitatifs dans les questionnaires et, d’autre part d’en analyser l’évolution dans le temps. Pour conclure, financer notre projet pendant 2 ans de plus permettrait de disposer d’une série temporelle unique sur un plan international.

L'émergence et la réémergence des arbovirus, virus transmis par les moustiques, ont connu une intensification ces dernières années, entraînant d'importants problèmes de santé publique et des coûts qui affectent les sociétés. L'Amérique latine a été particulièrement touchée, avec une augmentation marquée de la circulation des arbovirus. Parmi les arbovirus, la dengue, qui est endémique dans cette région du monde, a connu une augmentation spectaculaire du nombre de cas, avec une multiplication par dix entre 2000 et 2019. Malgré les progrès réalisés dans la recherche, aucun traitement efficace contre la dengue n'est actuellement disponible. Des vaccins vivants atténués sont en cours d'homologation, mais leur disponibilité pour les communautés et leur efficacité sont encore incertaines. Dans le cadre de cette étude, nous proposons une approche méthodologique consistant à suivre de près deux cohortes de patients  : la cohorte 1, qui a reçu le Dengvaxia (vaccin tétravalent contre la dengue), et la cohorte 2, qui n'a jamais été vaccinée. Cette approche méthodique permettra d'atteindre les objectifs spécifiques suivants : i) l'isolement et le séquençage des souches de dengue infectantes, permettant ainsi de cartographier les souches circulantes en Colombie durant la période de l'étude ; ii) la caractérisation fonctionnelle de la réponse de production d'anticorps à l'infection par la dengue. En effet en isolant les cellules B, il sera possible de caractériser, in vitro en BSL-3, le spectre d'activité des anticorps produits contre des souches de dengue réplicatives.  iii) Avec les résultats de l'étape précédente des anticorps ayant une forte activité pan-sérotypique seront sélectionnés et combinés dans un cocktail thérapeutique. Ces anticorps possèdent le potentiel de devenir des candidats thérapeutiques pour la prévention ou le traitement de la dengue, un domaine dans lequel il existe un besoin important de nouvelles options thérapeutiques. Outre son importance pour le développement de candidats thérapeutiques, ce projet représente une avancée majeure dans le domaine de la recherche sur la dengue, tant pour le présent que pour les stratégies de vaccination futures. La réponse humaine à long terme aux vaccins tétravalents et/ou à l'infection représente un corpus de connaissances qui sera utile à l'ensemble de la communauté scientifique, et plus particulièrement aux régions dans lesquelles des vaccins pourraient être déployés, comme par exemple l'Amérique latine et les Antilles.