Projets et candidats lauréats

L’intestin est un compartiment clé pour la réplication du VIH-1, dès les stades précoces de l’infection, entraînant une déplétion profonde des lymphocytes T CD4+ dans la muqueuse intestinale, notamment les cellules productrices d’IL-17 (Th17, Th1Th17) qui jouent un rôle central dans l’homéostasie muqueuse.

Dans l’étude ANRS EP44, nous avons observé un défaut de reconstitution des lymphocytes T CD4+ dans la muqueuse intestinale sous traitement antirétroviral, en particulier des Th17 et Th1Th17, notamment du fait d’altérations du recrutement des lymphocytes T CD4+ du sang vers le compartiment intestinal.

La caractérisation virologique réalisée chez les individus de l’étude ANRS EP44 a révélé la persistance d’une fraction augmentée de T CD4+ hébergeant de l’ADN VIH-1 par rapport aux T CD4+ sanguins, la persistance d’une production virale résiduelle, et une compartimentation des populations virales dans l’intestin chez plus de 75% des individus étudiés.

Le projet proposé a pour objectif de mieux caractériser les cellules cibles du VIH-1 dans la muqueuse intestinale, notamment en fonction du tropisme d’utilisation des corécepteurs CCR5 et CXCR4. Nous avons développé un modèle d’histocultures de tissu intestinal humain permettant d’étudier l’infection des différentes sous-populations de T CD4+ dans le micro-environnement tissulaire muqueux. Nos résultats préliminaires montrent que les virus utilisant CCR5 infecteraient préférentiellement les T CD4+ CCR6+, en particulier les Th1Th17 et Th17, alors que les virus utilisant exclusivement CXCR4 cibleraient préférentiellement les T CD4+ CCR6-. Nous chercherons à mieux caractériser les sous-populations de T CD4+ ciblées par les virus utilisant CCR5, notamment les Th17, Th1Th17, Th22 ainsi que les sous-populations de Treg CCR6+ vs. CCR6-, et à comparer les cinétiques d’infection entre ces sous-populations. Nous chercherons également à préciser les sous-populations ciblées préférentiellement par les virus utilisant CXCR4, et à mieux comprendre les facteurs de susceptibilités à l’infection entre ces sous-populations T CD4+ en fonction du tropisme viral.

La caractérisation des cellules cibles du VIH-1 dans la muqueuse intestinale, et les différences de susceptibilités selon le tropisme viral pour CCR5 ou CXCR4 pourraient permettre de mieux comprendre le rôle de ce compartiment dans la sélection des virus utilisant CCR5 observée aux stades précoces de l’infection. Ce projet pourrait également avoir des implications concernant la persistance du VIH-1 sous traitement antirétroviral.

L’Afrique de l’Ouest est fortement touchée par l’hépatite B, avec plus de 6 % de la population adulte infectée, alors que moins de 10 % des personnes nécessitant un traitement y ont actuellement accès. L’atteinte de l’objectif de l’OMS d’élimination de l’hépatite B d’ici 2030 requiert un accès au traitement pour au moins 80% des personnes vivant avec le VHB (PVVHB) éligibles.

SIMBADE+ vise à déployer et à évaluer un modèle décentralisé de prise en charge du VHB dans des centres de santé secondaires en Côte d’Ivoire, combinant une initiation simplifiée du traitement antiviral à un accompagnement communautaire. L’étude s’appuie sur le cadre RE-AIM pour évaluer la faisabilité, l’adoption, la rétention et l’impact opérationnel de cette approche. Une analyse médico-économique intégrée estimera les coûts et bénéfices à court et long terme, incluant la réduction des complications hépatiques et la protection financière des patients.

Le projet sera mis en œuvre dans quatre centres de santé secondaires, avec six mois de recrutement et douze mois de suivi, et inclura la formation d’agents de santé communautaires. Les indicateurs principaux porteront sur la proportion de PVVHB initiant un traitement, la rétention à 12 mois et la tolérance du traitement. L’initiation thérapeutique reposera sur un critère simplifié, centré sur une réplication virale ≥2 000 UI/mL, afin de faciliter et élargir l’accès au traitement.

Les résultats attendus fourniront des données opérationnelles essentielles pour guider les politiques publiques, identifier les leviers et obstacles à une mise à l’échelle, soutenir l’élargissement et, le cas échéant, la gratuité du traitement antiviral des PVVHB. Cette approche pourrait contribuer à transformer durablement la prise en charge de l’hépatite B adulte en Afrique de l’Ouest.

Contexte :

Les adolescents (10-19 ans) ont des besoins en santé spécifique, qui, s’ils ne sont pas correctement couverts, pourraient avoir un impact négatif sur leur santé à l’âge adulte. C’est particulièrement le cas de leurs besoins en Santé Sexuelle et Reproductive (SSR). La SSR est caractérisée par une diversité de défis à relever, telles que la prévention des grossesses précoces et des infections sexuellement transmissibles (ISTs) incluant le VIH, et les violences basées sur le genre (VBG), avec des questions spécifiques d’acceptabilité, d’accessibilité et d’adaptabilité des messages de promotion, des outils de prévention, et des services de soins SSR. Les adolescents vivant avec le VIH (AVVIH) sont particulièrement vulnérables aux enjeux de SSR et sous-dotés en outils améliorant l’information et l’accès aux outils et aux services SSR adaptés. En novembre 2024, le séminaire VIVRADO2 (Contrat d’initiation ANRS 0568), a rassemblé à Abidjan une cinquantaine d'experts pluridisciplinaires pour réfléchir à des solutions innovantes pour améliorer la SSR des AVVIH. Ces réflexions ont abouti au projet de recherche interventionnelle participative CONNECT.

Objectifs du projet CONNECT :

1/ Mettre en œuvre et évaluer une plateforme de coordination, par et pour les acteurs clés de la promotion de la SSR des adolescents en Côte d’Ivoire, permettant de renforcer les capacités des professionnels, identifier et référencer efficacement les services SSR adaptés aux AVVIH

2/ Développer et tester une application mobile, par et pour les AVVIH, afin d’améliorer le niveau de connaissances des AVVIH et les référencer efficacement aux services appropriés de SSR.

Méthodes :

Ce projet utilisera des méthodes mixtes, de recherche quantitative, qualitative, et de la science de la mise en œuvre, avec un schéma d’étude quasi-expérimental de type série chronologique, afin d’évaluer l’impact et le processus de mise en œuvre de chaque composante (plateforme et application) et leur articulation. La mise en œuvre de la plateforme de coordination commencera par une analyse des initiatives existantes, suivie d'un atelier de lancement avec les acteurs identifiés puis d’activités communes, telles que lister les services de SSR adaptés aux AVVIH en Côte d’Ivoire pour nourrir le contenu de l’application mobile. L'application mobile sera co-construite avec les pairs-éducateurs et testée par 300 AVVIH de 4 centres partenaires à Abidjan et Bouaké pendant un an. Son appropriation et son impact sur les connaissances et l’utilisation des outils et des services de SSR seront évalués via des questionnaires quantitatifs ainsi que des focus groupes et entretiens individuels semi-directifs.

Résultats attendus et perspectives :

Le projet CONNECT impliquera un engagement fort des parties prenantes tout au long du processus de recherche afin de concevoir des outils de promotion de la SSR, pérennes et transférables. Ce projet générera de nouvelles connaissances scientifiques sur la recherche interventionnelle en SSR pour les AVVIH, avec des retombées sociétales immédiates en Côte d’Ivoire, telles que :

• La mise en place d’une plateforme de coordination dédiée à la SSR, source de recommandations d’actions de Santé Publique pour promouvoir la SSR des adolescents
• Un prototype d’outil numérique en santé, validé et fiable, répondant aux besoins complets en SSR des AVVIH, permettant un déploiement à plus large échelle.
• Une documentation précise du processus et des facteurs contextuels de mise en œuvre
• Une meilleure connaissance et utilisation des outils et services de SSR par les AVVIH, permettant sur le long-terme de réduire les risques d’acquisitions d’ISTs, et de grossesses non désirées
• Un renforcement des capacités et une évolution des pratiques cliniques des professionnels de santé impliqués dans la prise en charge des AVVIH
• Un renforcement des partenariats avec les acteurs de la société civile, incluant les jeunes.

Ce projet aura ainsi des retombées scientifiques (publications), économiques (outil numérique), cliniques (plateforme de coordination) et sociétales (transfert de connaissances, recommandations politiques).

Les traitements actuels permettent rarement de guérir les patients chroniquement infectés par HDV. De nouveaux agents ciblant directement la réplication de HDV pourraient donc permettre d’améliorer l’arsenal thérapeutique actuel. L’objectif du projet est d’apporter la preuve de concept que l’utilisation d’oligonucléotides antisens (ASO) dirigés contre les ARNs HDV seraient efficaces pour cibler l’infection HDV et de décortiquer précisément leurs mécanismes d’action. Nous avons synthétisé 112 ASOs ciblant HDV et les avons criblés pour leur effet antiviral dans des cellules HuH7-NTCP différenciées. Dix-huit candidats ASOs ont permis une diminution de plus de 80% du nombres de cellules infectées par HDV sans toxicité avec une dose de 1 µM. Parmi eux, 6 ont été sélectionnés pour confirmation de leur effet antiviral avec différentes doses. Les EC50 obtenues ont atteint le nanomolaire.

Objectif #1: Comprendre le mode d’action direct des ASOs anti-HDV. Nous déterminerons si les ASOs anti-HDV induisent une dégradation des ARNs HDV par des expériences de stabilité des ARNs combinés à des RT-ddPCR spécifiques. Si c’est le cas, nous déterminerons si la RNAse H est impliquée dans le processus par des expériences de pertes de fonction. Nous utiliserons également des digestions avec la RNAse R et des fractionnements cytoplasm/noyau pour comprendre si les ASOs anti-HDV peuvent agir sur les ARN HDV en conformation bâtonnet ou s’ils agissent uniquement sur les multimères linéaires nucléaires formés pendant l’amplification en cercle roulant d’HDV. Nous étudierons des mécanismes alternatifs possible d’inhibition de HDV par les ASOs anti-HDV. En fonction de la séquence qu’ils ciblent, les ASOs pourrait inhiber la synthèse des ARN HDV, son activité ribozyme, sa ligation ou l’association des antigènes viraux à HDV-G ou HDV-AG par encombrement stérique par exemple. Toutes ces hypothèses seront testées par analyses des ARN naissants, électrophorèse native et immunoprécipitation ARN.

Objectif #2: Déterminer si les ASOs anti-HDV ont aussi un mécanisme antiviral indirect. En raison de leurs propriétés physiques, les ASOs peuvent aussi stimuler les récepteurs de l’immunité innée et donc présenter un mode d’action antiviral secondaire via l’activation de réponses innées. En utilisant des cellules rapportrices, des cellules sanguines humaines ainsi que des hépatocytes immunocompétents, nous évaluerons les propriétés immunostimulatrices des ASO santi-HDV. Si nous en mettons en évidence, nous déterminerons si celles-ci participent à l’effet antiviral des ASOs anti-HDV en utilisant des milieux conditionnés pour traiter des cellules dHepaRG infectées par HDV.

Objectif #3: Détermination d’un possible effet synergique/additive des ASOs anti-HDV et anti-HBV in vitro. Comme la sécrétion des particules HDV dépend de la synthèse d’HBsAg, des ASOs ciblant les ARN HBV devrait en théorie limiter la propagation d’HDV. Nous testerons cette hypothèse, encore inexplorée avec un ASOs HBV dans le cas de co-infection HBV/HDV. De plus, nous déterminerons si la combinaison d’ASOs anti-HBV et anti-HDV augmente l’effet antiviral sur HDV.

Objectif #4: Validation in vivo de l’efficacité d’un ASOs anti-HDV pour bloquer l’infection HDV et détermination d’un effet synergique/additif avec un ASOs anti-HBV. Tout d’abord, nous testerons l’effet d’un candidat ASOs anti-HDV en combinaison ou non avec du Bepirovirsen dans des souris humanisées pour le foie infectées par HBV et HDV. Enfin, si des propriétés immunostimulatrices ont été mise en évidence pour les ASOs anti-HDV, nous validerons notre nouvelle approche thérapeutique dans un modèle de souris immunocompétentes (souris exprimant une version humanisée chimérique de NTCP infectées par HDV et des AAV-HBV) pour évaluer la contribution de l’effet indirect des ASOs anti-HDV dans l’effet antiviral global.

Les données générées permettront d’aller vers le développement de stratégies utilisant des ASOs pour traiter l’infection HDV chronique.

L’infection par le virus de l’hépatite B est la cause majeure de cirrhoses et de cancers primaires du foie responsables d’environ 800000 morts par an dans le Monde. Les traitements actuels reposent sur l’administration tout au long de la vie de composés antiviraux aux limitations reconnues. Un changement thérapeutique majeur est en cours dans le domaine du VHB avec le développement de nouvelles thérapies visant à la perte de l’antigène HBsAg (guérison fonctionnelle). Néanmoins, d’importantes questions demeurent quant à la meilleure façon d’administrer ces thérapies qui seront combinées avec les traitements antiviraux actuels. Cela justifie un effort concerté de Recherche taclant des questions clés relatives au virus lui-même ainsi qu’à la réponse immunitaire de l’hôte afin de surmonter les obstacles à une guérison fonctionnelle.

            Ce projet vise à une évaluation détaillée de nouveaux marqueurs viraux combinée à une analyse en profondeur des réponses immunitaires globale et spécifique au virus. Le compartiment périphérique sera étudié chez tous les patients et, lorsque cela est possible, des échantillons de foie seront interrogés. Nous identifierons ainsi des signatures virologiques et/ou immunologiques facilitant la prédiction du contrôle du virus et donc, la perte de HBsAg.

            Cette étude sera la première dans son genre à utiliser les dernières techniques, comme l’aspiration à l’aiguille fine (FNA) du foie, pour accroître notre compréhension des événements immunitaires et du réservoir viral au niveau du site infectieux. Cette recherche est primordiale pour casser les barrières à une guérison fonctionnelle and révélera définitivement le meilleur moyen d’administrer ces nouvelles thérapies anti-VHB.        

Les usagers de drogues (UD) constituent une population particulièrement à risque vis-à-vis de la transmission du VIH et des hépatites virales (VHC, VHB) Comme le VIH, le VHC se transmet essentiellement par le partage de seringues chez les UD. Néanmoins, le VHC se transmet plus facilement que le VIH, car il est plus résistant à la dessication, la prévalence du VHC est plus élevée chez les UD et il se transmet également par le biais du partage du petit matériel permettant l’injection tel que la cuiller/récipient, l’eau ou le filtre/coton. Au sein de la population des UD, la prévalence de l’hépatite C est encore aujourd’hui très élevée dans la majorité des pays pour lesquels des données de surveillance sont disponibles. L’hépatite C constitue donc un problème de santé majeur chez les UD et certaines populations comme les UD migrants sont particulièrement exposés. En France, les données de prévalence du VIH et du VHC chez les UD ont longtemps reposé sur des données déclaratives et porté sur des échantillons non aléatoires. L’enquête ANRS-Coquelicot constitue la seule enquête française réalisée à partir d’un échantillon aléatoire d’UD à l’aide d’un plan de sondage et du recueil de prélèvements biologiques, au niveau national. La mise en œuvre de cette méthodologie a permis d’améliorer les estimations de la séroprévalence du VIH et du VHC dans la population des UD pris en charge dans les dispositifs spécialisés.

 Les objectifs de l’étude sont les suivants :

• Estimer la séroprévalence du VIH, VHC et VHB chez les UD et l’incidence du VIH et du VHC.
• Capter une partie des UD habituellement non inclus dans les études en raison de leur non maitrise de la langue française, afin de pouvoir décrire les pratiques, les profils et l’état de santé des UD nés à l’étranger.
• Construire la cascade de prise en charge du VIH et du VHC pour la population des UD, à partir des données de dépistage, prise en charge, accès au traitement, guérison (pour le VHC) et charge virale indétectable (pour le VIH)
• Mieux connaître la perception, l’accès et l’observance vis-à-vis des nouveaux traitements de l’hépatite C chez les UD.
• Mieux connaître l’accès aux mesures de réduction des risques, identifier les éventuelles difficultés d’accès et les nouveaux besoins.
• Mettre en œuvre une approche biographique, afin d’identifier les moments les plus à risque pour l’entrée dans la consommation/dépendance et l’exposition aux risques VIH/VHC/VHB.
• Identifier les troubles de santé mentale auxquels est exposée la population des UD dans le but d’améliorer la connaissance des comorbidités psychiatriques, leur implication dans l’exposition au risque de transmission du VIH, VHC et VHB.  

Méthodologie : L’enquête ANRS-Coquelicot est une enquête épidémiologique transversale multicentrique et multisites, réalisée chez des UD ayant sniffé ou injecté au moins une fois dans leur vie. Une stratégie d’échantillonnage sera mise en œuvre afin d’accéder à une population d’UD représentative de la diversité des UD. Pour calculer un poids de sondage correct, la méthode généralisée du partage des poids (MGPP) sera utilisée. Un questionnaire socio-comportemental sera administré par un enquêteur et il sera proposé aux UD de réaliser un auto-prélèvement de sang au doigt sur papier buvard. Pour l’édition 2019, les UD migrants seront inclus dans l’enquête.

Retombées attendues : actualisation des connaissances en matière de comportements à risques, affinement des estimations de prévalence du VIH, VHC et VHB et d’incidence du VIH et du VHC chez les UD, accès aux traitements permettant d’ajuster les actions de prévention et de disposer d’indicateurs pour évaluer leur impact.