Projets et candidats lauréats

En plus des lymphocytes T CD4+, les macrophages sont des cellules cibles essentielles du VIH-1 impliquées dans toutes les étapes de la pathogenèse du VIH-1 et dans l’établissement de réservoirs viraux persistants, représentant ainsi une source de rebond de la virémie après l’arrêt des traitements. Il est donc crucial de mieux comprendre comment les macrophages, en particulier les macrophages tissulaires qui sont fortement résistants à l’infection par du virus libre, peuvent être infectés par le VIH-1. Contrairement à l’infection par du virus libre, la transmission du virus intercellulaire représente le mode dominant d’infection in vivo. Nos équipes de l’IPBS, Toulouse (dirigées par C. Vérollet et R. Poincloux, et O. Neyrolles) ont récemment démontré que le VIH-1 peut être efficacement transféré in vitro 1/ entre les macrophages par des nanotubes membranaires et 2/ des lymphocytes T infectés vers les macrophages par un processus de fusion cellulaire hétérotypique. Ces deux processus conduisent à la formation de macrophages géants multinucléés hautement productrices de virus. En réponse à l’environnement local en cytokines et en fonction de leur localisation tissulaire, les macrophages présentent une grande hétérogénéité et ils peuvent être dérivés vers un large spectre de polarisation et de profils métaboliques. L’activation des macrophages étant un aspect clé de la pathogenèse du VIH-1, il est très intéressant d’étudier comment le profil d’activation des macrophages dicte leur capacité à être infectés par le VIH-1 par transfert interellulaire. Nous émettons l’hypothèse que l’environnement des macrophages module la manière dont ces cellules sont infectées par le transfert de virus à partir de macrophages infectés ou de lymphocytes T CD4+ infectés. Comme la tuberculose (TB) est une condition aggravante de la pathogenèse du VIH-1 et une cause de décès liés au SIDA, nous souhaitons mieux caractériser comment le microenvironnement associé à la TB pulmonaire augmente la susceptibilité des macrophages au VIH-1, conduisant à une synergie mortelle entre ces deux pathogènes. Ainsi, l’objectif général de ce projet est de comprendre comment les profils d’activation des macrophages modifient leur infection par le VIH-1 par transfert, en particulier pour les macrophages tissulaires et dans le contexte d’une co-infection avec Mycobacterium tuberculosis (Mtb), l’agent de la TB. L’objectif 1 consistera à étudier l’impact de la polarisation des macrophages sur le transfert du VIH-1 par fusion cellulaire en utilisant des modèles in vitro de macrophages dérivés de monocytes polarisés avec des cocktails de cytokines ainsi qu’un modèle de macrophages tissulaires (amygdales humaines). L’objectif 2 consistera à étudier les mécanismes moléculaires nécessaires au transfert viral et à la dissémination dans les macrophages dans différents contextes d’activation, en se concentrant sur l’implication du métabolisme des macrophages et sur le rôle de récepteurs cellulaires spécifiques impliqués dans le transfert du VIH-1 ou la fusion cellulaire. Enfin, l’objectif 3 examinera comment la TB module le transfert du VIH-1 vers les macrophages. Ici, nous aurons l’opportunité d’étendre notre étude aux macrophages alvéolaires humains qui sont la cible principale de Mtb et du VIH-1 dans le poumon.

Ce projet de recherche permettra d’acquérir de nouvelles connaissances fondamentales sur le rôle des macrophages dans la pathogenèse du VIH-1 en décryptant le(s) mécanisme(s) cellulaire(s) et moléculaire(s) qui contribuent à l’infection de ces cellules réservoirs, en particulier dans le contexte de la co-infection VIH/Mtb.

Justification : Le Burkina Faso fait partie des premiers pays touchés par l’épidémie de coronavirus en Afrique de l’Ouest et la population des soignants, des femmes enceintes ne sont pas épargnées. Les connaissances sont très limitées en Afrique où la population des femmes enceintes représente un groupe sentinelle utile dans la surveillance. Dans ce contexte, il existe une opportunité unique à mettre en œuvre et évaluer un dispositif de recherche opérationnelle dans une maternité permettant de renforcer la protection du personnel de santé en priorité, et d’évaluer une stratégie de dépistage en routine de l’infection à SARS-CoV-2 chez les professionnels de santé, puis chez les femmes parturientes.

Objectif global : Mettre en œuvre et évaluer une stratégie de routine de dépistage de l’infection par le SARS-CoV-2 avec triage des cas chez le personnel soignant et les femmes à l’accouchement à la maternité du CHU Yalgado Ouédraogo à Ouagadougou, Burkina Faso, avec suivi des couples mère-enfants jusqu’à six semaines. Cette intervention sur une période de six mois permettra et de constituer une cohorte exhaustive prospective avec suivi des couples mère-enfant jusqu’à six semaine de vie pour mesurer les indicateurs épidémiologiques (prévalence, incidence) de l’infection et son impact sur la santé mère-enfant (morbi-mortalité, issues de grossesses, transmission mère-enfant) à court-terme.

Site : maternité du CHU Yalgado Ouédraogo, Ouagadougou, Burkina Faso

Schéma d’étude : enquête transversale proposant un diagnostic du SARS-CoV-2 par rt-PCR à tous les professionnels de santé, puis aux femmes identifiées comme cas possibles à l’accouchement suivie d’étude de cohorte prospective observationnelle, exhaustive, identifiée à partir des femmes accouchant à la maternité du CHU Yalgado Ouédraogo et suivies avec leur(s) nourrisson(s) jusqu’à six semaines post-partum en fonction de leur exposition à l’infection par le SARS-Cov-2.

Critères d’inclusion : tout professionnel de santé travaillant à la maternité du CHU-YO lors de la mise en place de l’étude, et ayant signé un consentement éclairé ; toute femme accouchant à la maternité du CHU-YO du 1er juillet 2020 au 31 décembre 2020, ayant signé un consentement éclairé et résidant à Ouagadougou avec leur nouveau-né.

Critères d’évaluation

• Mesure de l’acceptabilité de l’offre de dépistage du SARS-CoV-2 à l’accouchement
• Mesure de la prévalence de l’infection active, et ancienne avec immunité acquise à l’accouchement
• Morbidité, mortalité maternelles et complications post-partum immédiates et à six semaines.
• Complications des issues de grossesse : faible poids de naissance, prématurité, microcéphalie, mortinatalité, malformations congénitales
• Mortalité néonatale précoce et tardive
• Estimation du taux de transmission mère-enfant du SARS-CoV-2 à l’accouchement et à six semaines de vie
• Mesure de l’incidence de l’immunité acquise au SARS-CoV-2 entre l’accouchement et à six semaines post-partum
• Mesure des connaissances, attitudes et pratiques, perceptions vis-à-vis de l’infection et ses conséquences, des mesures de prévention, et du dépistage.
• Mesure de l’acceptabilité de l’offre de dépistage du SARS-CoV-2 par RT-PCR par le personnel de la maternité et de pédiatrie et facteurs sociaux associés.
• Mesure des connaissances, attitudes et pratiques, perceptions vis-à-vis de l’infection et ses conséquences, des mesures de prévention, et du dépistage.

Taille : 200 professionnels de santé et 3150 femmes et leurs nouveau-nés à l’accouchement, dont 1225 cas possibles à dépister

Calendrier : Durée : 12 mois : Mise en place : 2 mois (mai-juin 2020), Recrutement : 6 mois (juillet-décembre 2020) ; Suivi : 2 mois (janvier-février 2020) ; Analyse : 2 mois (mars-avril 2020)

Retombées : améliorer les connaissances sur l’acceptabilité professionnelle et sociale du dépistage de l’infection par le SARS-CoV-2 routine aux soignants et aux parturientes, et l’impact de l’infection sur la santé mère-enfant à six semaines. Cette connaissance sera utile pour modéliser l’épidémie et guider les décisions de santé publique à l’échelle nationale et internationales au cours des prochains mois.

Objectif: Etudier l’impact de l’offre de soins, des conditions de vie du personnel soignant et de leur offre de travail sur l’activité des structures sanitaire dans les zones rurales de Niakhar et Bandafassi au Sénégal. Ces données seront mises en perspective avec les données du personnel soignant en milieu urbain à Dakar.

Contexte: La raréfaction des ressources financières internationales mettent à l’épreuve les structures de santé des pays en développement qui doivent répondre à l’augmentation de la demande tout en préservant la qualité des soins. Dans ce contexte, la pénurie de professionnels de santé est un défi majeur pour les autorités de nombreux pays Africains. L’organisation de leur force de travail est inadaptée car leur stratégie de production de professionnels de santé se base exclusivement sur la demande des soins, ce qui génère des disparités géographiques. En effet, les zones rurales manquent de personnel soignant qualifié alors qu’en ville, on observe un taux de chômage élevé parmi les médecins et les infirmier(è)s. Au Sénégal la densité médicale est 5 fois plus faible que celle de Dakar. Dans le domaine de la santé, les efforts du gouvernement Sénégalais à l’échelle nationale pourraient être compromis par la situation sanitaire précaire des zones rurales. Il est crucial de comprendre les facteurs déterminant l’offre de travail et les dynamiques des ressources humaines dans le milieu de la santé.

Méthode: Il s’agit d’une enquête dont la méthodologie est basée sur la réalisation d’une enquête qualitative et une enquête quantitative. Les deux enquêtes seront réalisées auprès du personnel soignant incluant les matrones des structures sanitaires des zones rurales de Niakhar et Bandafassi au Sénégal : cela représente 2 hôpitaux régionaux, 2 centres de santé, 9 postes de santé et 12 cases de santé. Pour l’enquête qualitative des entretiens individuels semi-dirigés seront réalisés auprès de 10 médecins ; et 5 groupes de discussion (2 dans chaque zone rurale et 1 à Dakar) auprès de professionnels de santé autres que les médecins (infirmier(è)s, aide-soignant(e)s, matrones, etc.). Pour l’enquête quantitative, des fiches standardisées seront utilisées, d’une part, pour collecter des informations concernant les caractéristiques des structures sanitaires concernées par les trois zones géographiques (e.g. aspects organisationnels et économiques, services disponibles, ressources physiques et humaines ; activité en général et concernant les maladies transmissibles, etc.). D’autre part, un questionnaire en face-à-face sera administré auprès d’environ 450 personnes  réalisant une activité directement en lien avec les services de santé (i.e. personnel soignant) afin de collecter des informations sur leurs conditions de vie et de travail. Les chefs des structures sanitaires seront contactées 6 mois après l’enquête afin d’identifier les membres du personnel soignant ayant réalisé une mobilité définitive.

Echénancier: Janvier 2019 – Juin 2019: Préparation du terrain d’enquête; Juillet 2019 – Février 2020 : collecte de données; Mars 2019 – Décembre 2020 : validation de la base de données, analyses et diffusion de résultats.

Résultats et retombées attendus : Les résultats de la recherche permettront, d’une part, de documenter l’offre de soins dans trois zones rurales du Sénégal exposées à des contextes sanitaires différents de par leur localisation géographique: Niakhar et Bandafassi. D’autre part, la recherche permettra d’identifier les déterminants de l’offre de travail du personnel soignant dans ces zones et son impact sur la prise en charge des maladies transmissibles considérées. Ce projet constitue une expérience pilote permettant l’identification des besoins non seulement en termes organisationnels, financiers, et des conditions de travail, mais aussi en termes de formation concernant la prévention et la prise en charge des maladies transmissibles, notamment vis-à-vis des populations clés et de la transmission de la mère à l’enfant. Il s’inscrit dans un programme de recherche dans lequel des interventions de formation pourraient être construites à partir des résultats obtenus et testées à plus grande échelle.