Chaque projet est mené par un consortium interdisciplinaire, constitué de 4 à 20 équipes possédant des expertises complémentaires et menées par un coordinateur. Les équipes complètes sont détaillées dans l’annexe 2.
VOLET 1 – Accélérer l’acquisition de connaissances sur les maladies infectieuses émergentes
3D-LUNGO – Coordinateur : CHAKRABARTI Lisa (Institut Pasteur)
Le projet 3D-LUNGO a pour objectif de fournir des modèles tissulaires en 3D, à partir de l’étude de la susceptibilité des muqueuses nasales ou bronchiques et des alvéoles pulmonaires aux virus respiratoires, pour tester rapidement et de façon collaborative les lésions que pourraient induire des pathogènes respiratoires nouvellement apparus.
Montant d’aide France 2030 : 1 476 112 M€
DEBS-Plague – Coordinateur : SEBBANE Florent (Institut Pasteur de Lille/Inserm)
Le projet DEBS-Plague vise à comprendre les dynamiques de circulation de la peste et à identifier les écosystèmes français favorables ou non à son implantation et adoptera pour se faire une approche interdisciplinaire (alliant sciences historiques, archéologiques, biologiques, mathématiques et d’ingénierie). L’objectif est de limiter, voire prévenir les éventuelles émergences de peste, mais aussi de développer un système modèle applicable à d’autres maladies infectieuses zoonotiques.
Montant d’aide France 2030 : 2 737 534 M€
SISP&EAU – Coordinateur : BOELLE Pierre-Yves (Institut Pierre Louis d’Epidemiologie et de Santé Publique, Sorbonne Université/Inserm)
Le projet SISP&EAU a pour objectif de construire et de valider un modèle de surveillance des virus respiratoires en France intégrant les cas cliniques et les eaux usées. Il mettra en place la détection et le suivi des souches virales causant des infections respiratoires pour caractériser la dynamique de circulation des virus en population générale. Il pérennisera les outils technologiques, mathématiques et informatiques développés pour la surveillance épidémiologique durant la pandémie COVID-19.
Montant d’aide France 2030 : 2 170 040 M€
CAZIKANO – Coordinateur : DESPRES Philippe (Université de la Réunion)
Le projet CAZIKANO concerne le virus Zika, à l’origine de graves malformations congénitales. Il vise à caractériser les facteurs favorisant la transmission du pathogène par les moustiques et la persistance virale chez l’individu. L’objectif est de proposer des stratégies anti-infectieuses innovantes basées sur l’action antivirale de composés extraits de plantes du territoire ultra-marin.
Montant d’aide France 2030 : 3 250 270 M€
Ft6SS-Méca – Coordinateur : HENRY Thomas (Centre International de Recherche en Infectiologie, Inserm Lyon)
Le projet Ft6SS-Meca étudiera la structure, les mécanismes moléculaires de sécrétion et la fonction des effecteurs du système de sécrétion (T6SS) de la bactérie Francisella tularensis (agent de la menace). Les résultats attendus pourraient conduire à identifier à long terme de nouveaux traitements ciblant spécifiquement ce système de sécrétion, facteur clé de virulence.
Montant d’aide France 2030 : 1 080 453 M€
COPAFLICT – Coordinateur : BAIZE Sylvain (Institut Pasteur)
Le projet COPAFLICT a pour objectif d’améliorer les connaissances fondamentales sur les fièvres hémorragiques virales et offrir de nouvelles perspectives pour leur diagnostic et leur traitement. Pour ce faire, il étudiera l’immunopathogénèse associée à virus de la fièvre Lassa (fièvre hémorragique foudroyante), pour identifier les voies immunitaires d’intérêt pour le développement de nouvelles stratégies thérapeutiques ciblant la réponse de l’hôte.
Montant d’aide France 2030 : 1 737 057 M€
LSDengue – Coordinateur : CABIÉ André (CHU de Martinique)
Le projet LSDengue a pour objectif d’identifier les facteurs déterminants des formes sévères de la dengue pour définir des biomarqueurs utilisables en clinique et adapter les soins aux patients. Il prévoit une étude d’une ampleur sans précédent de caractérisation complète (clinique, génétique, virologique et immunologique) de centaines de patients aux origines génétiques diverses, recrutés sur une grande partie de l’aire géographique d’incidence de la dengue grâce à un vaste réseau dans les DOM-TOM. Il s’agit d’anticiper la progression de l’infection vers une dengue grave, d’améliorer la prise en charge des patients et de réduire le risque de mortalité lié à la dengue. Ce réseau intercontinental pourrait fournir une base solide pour la préparation et le contrôle des virus émergents, en particulier les arbovirus et la dengue.
Montant d’aide France 2030 : 2 082 853 M€
VOLET 2 – Organiser et développer de nouveaux traitements, vaccins et autres moyens de prévention, de prévention, de diagnostic et de surveillance pour les maladies infectieuses émergentes
NIPAH-LISA – Coordinateur : LONGHI Sonia (Aix Marseille Université, CNRS)
Le projet NIPAH-LISA porte sur les infections aéroportées de virus de la famille des Paramyxovirinae hautement pathogènes (dont le virus Nipah) et vise à mettre au point un traitement antiviral multi-composants contre ces infections.
Montant d’aide France 2030 : 1 580 557 M€
VORTEX – Coordinateur : GAYMARD Alexandre (Hospices Civils de Lyon, HCL)
Le projet VORTEX a pour objectif de mettre au point une méthode de diagnostic non invasive sur la base des résultats de l’analyse de l’air expiré par les patients. Il vise à identifier des signatures de composés organiques volatils spécifiques d’un pathogène ou de la réponse immunitaire de patients afin d’améliorer la prise en charge et la surveillance des infections respiratoires émergentes.
Montant d’aide France 2030 : 2 418 646 M€
VOLET 3 – Permettre aux politiques publiques et à la société de faire face aux crises épidémiques
TICKRISK – Coordinateur : GILES-VERNICK Tamara (Institut Pasteur)
Le projet TICKRISK propose une étude anthropologique et de co-développer, avec les professionnels concernés (santé humaine, vétérinaires, éleveurs) de 4 pays (France, Espagne, Roumanie, Turquie) une préparation aux épidémies qui comporte un volet communication des risques aux populations. L’objectif est d’intégrer cette dimension à la préparation et à la réponse à un risque épidémique et, in fine, de l’améliorer.
Montant d’aide France 2030 : 1 594 059 M€
ACME – Coordinateur : MUELLER Judith (Institut Pasteur)
Le projet ACME étudiera les facteurs clés qui influencent l’acceptation et l’accessibilité physique et psychologique des mesures de lutte contre les épidémies, au premier rang desquels la vaccination. Il vise à promouvoir le développement et la mise en œuvre de contremesures efficaces, notamment par une communication et une organisation adaptées et inclusives. Une attention particulière sera portée sur le renforcement de la confiance en situation de crise. Ce projet doit permettre in fine d’améliorer l’efficacité des actions de santé publique plus largement.
Montant d’aide France 2030 : 1 526 992 M€
VOLET 1 – Accélérer l’acquisition de connaissances sur les maladies infectieuses émergentes
3D-LUNGO
Equipes : CHAKRABARTI Lisa (Institut Pasteur, Paris) ; GOUJON Caroline (Institut de Recherche en Infectiologie de Montpellier, CNRS Languedoc) ; TERRIER Olivier (Centre International de Recherche en Infectiologie, ENS Lyon et Université Claude Bernard Lyon 1) ; GOBAA Samy (Institut Pasteur, Paris) ; MENU Elisabeth (Centre de recherche immunologie de infections virales et des maladies auto-immunes, CEA) ; BOURDIN Arnaud (CHU Montpellier)
DEBS-Plague
Equipes : SEBBANE Florent (Centre d’Infection et d’Immunité de Lille, Institut Pasteur de Lille) ; PIZARRO-CERDA Javier (Institut Pasteur) ; ATKINSON Steve (Nottingham University, UK) ; TORTOSA Pablo (Université de La Réunion) ; LATTARD Virginie (VetAgro Sup Lyon) ; DOBIGNY Gauthier (Centre de biologie pour la gestion des populations, IRD) ; RAJERISON Minoarisoa (Institut Pasteur de Madagascar) ; GIROD Romain (Institut Pasteur de Madagascar) ; BOUSHIRA Emilie (Ecole vétérinaire de Toulouse, INRAE) ; NICOUD Marilyn (Université d’Avignon) ; SLAVIN Philip (Stirling University, UK) ; CASTEX Dominique (Université de Bordeaux) ; OUESLATI Tarek (Université de Lille) ; SPYROU Maria (Universität Tübingen, DE) ; CARIA Giovanni (Laboratoire d’Analyses des Sols, INRAE) ; MONDY Samuel (INRAE) ; MASSOL François (Centre d’Infection et d’Immunité de Lille – Institut Pasteur Lille) ; STENSETH Nils (Centre for Ecological and Evolutionary Synthesis, University of Oslo) ; MIGUET Serge (Laboratoire d’Informatique en Image et Systèmes d’information, INSA, Université Lyon 2) ; KASSI Samir (Laboratoire Interdisciplinaire de Physique, Université de Grenoble)
SISP&EAU
Equipes : BOELLE Pierre-Yves (Institut Pierre Louis d’Epidemiologie et de Santé Publique, Sorbonne Université) ; DARMON David (Risques, Epidemiologie, Territoires, Informations, Education et Santé, Université Cote d’Azur) ; ROHR Olivier (Laboratoire de dynamique des interactions hôtepathogène, Université de Strasbourg) ; MADAY Yvon (Laboratoire Jacques-Louis Lions, Sorbonne Université) ;THIBAULT Vincent (Laboratoire de Virologie, Hôpital de la PitiéSalpêtrière) ; GUERIN Jean-Luc (Interactions hôtes agents pathogènes, INRAE) ; DELEUZE Jean-Francois (Centre National français de Recherche en Génomique Humaine, CEA) ; BARBRY Pascal (Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire Physiologie génomique des eucaryotes, CNRS) ; SCHVOERER Evelyne (Stress Immunité et Pathogènes, Université de Lorraine – Faculté de Médecine) ; DUBOIS Michel (Groupe d’Etude des Méthodes de l’Analyse sociologique de la Sorbonne, CNRS) ; LINA Bruno (Institut des Agents Infectieux, Hospices civil de Lyon – Hôpital de la croix rousse) ; ROUSSET Dominique (Virologie CNR-LA virus des infections respiratoire et CNR-LA Arbovirus, Institut Pasteur de la Guyane) ; SIMON-LORIERE Etienne (Institut Pasteur)
CAZIKANO
Equipes : DESPRES Philippe (Université de la Réunion) ; LAMBRECHTS Louis (Institut Pasteur) ; JOUVENET Nolwenn (Institut Pasteur) ; MESMIN Bruno (Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire, CNRS Côte d’Azur) ; DEJUCQ-RAINSFORD Nathalie (Institut de recherche sur la santé, l’environnement et le travail, Inserm Nantes) ; ROUSSI Fanny (Institut de Chimie des Substances Naturelles, CNRS Côte d’Azur) ; ROUILLE Yves (Institut Pasteur de Lille) ; WATTERSON Daniel (The University of Queensland, AUS)
Ft6SS-Méca
Equipes : HENRY Thomas (Centre International de Recherche en Infectiologie, Inserm Lyon) ; TERRADOT Laurent (CNRS) ; FRONZES Remi (Institut Européen de Chimie et Biologie, Université de Bordeaux) ; BOISSET Sandrine (Centre National de Reference de la tularémie CHU Grenoble-Alpes)
COPAFLICT
Equipes : BAIZE Sylvain (Unité de Biologie des Infections Virales Emergentes, Institut Pasteur) ; LACHUER Joël (Structure Fédérative de Recherche Santé Lyon-Est, Université Lyon 1) ; DILLIES Marie-Agnès (Hub Bioinformatique et Biostatistique, Institut Pasteur) ; BELLANGER Laurent (Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic, CEA) ; JOLLY Nathalie (Centre de Recherche Translationnelle, Institut Pasteur)
LSDengue
Equipes : CABIÉ André (CHU de Martinique) ; NACHER Mathieu (Centre d’investigation clinique Antilles Guyane, Centre Hospitalier de Cayenne) ; DE LAMBALLERIE Xavier (Unité des virus émergents, Faculté de Médecine de Marseille) ; ROUSSET Dominique (Institut Pasteur de Guyane) ; DUPONT-ROUZEYROL Myrielle (Institut Pasteur de NouvelleCalédonie) ; MISSÉ Dorothée (IRD Montpellier) ; QUINTANA-MURCI Lluis (Unit Human Evolutionary Genetics, Institut Pasteur) ; MAVINGUI Patrick (Université de la Réunion) ; GÉRARDIN Patrick (CHU de La Réunion) ; JAFFAR-BANDJEE Marie-Christine (CHU de La Réunion) ; CÉSAIRE Raymond (CHU de Guadeloupe) ; ABEL Laurent (IHU Institut Imagine, Inserm Paris) ; FOLLENFANT Emilie (Service de médecine interne CHT Nouméa)
VOLET 2 – Organiser et développer de nouveaux traitements, vaccins et autres moyens de prévention, de prévention, de diagnostic et de surveillance pour les maladies infectieuses émergentes
NIPAH-LISA
Equipes : LONGHI Sonia (Aix Marseille Université, CNRS) ; SI-TAHAR Mustapha (Centre d’Etude des Pathologies Respiratoires, Université de Tours, Inserm) ; LOTTEAU Vincent (Inserm Lyon) ; VIDALAIN Pierre-Olivier et MATHIEU Cyrille (Centre International de Recherche en Infectiologie, Inserm, CNRS, ENS Lyon, Université Lyon 1) ; MESSAOUDI Samir (Laboratoire de Synthèse Organique, Ecole polytechnique, Palaiseau, CNRS) ; TSAPIS Nicolas (CNRS, Université Paris Saclay) ; HA-DUONG Tâp (CNRS, Université Paris Saclay) ; SAFRA Lou (Sciences Po, CNRS)
VORTEX
Equipes : GAYMARD Alexandre (Hospices Civils de Lyon, HCL) ; RIVA Matthieu (Institut de recherches sur la catalyse et l’environnement, Univesrité Lyon 1) ; SAUVINET Valérie (Centre de Recherche en Nutrition Humaine Rhône-Alpes, Hospices Civils de Lyon, HCL)) ; VERDON Julien (Ecologie et Biologie des Interactions, Université de Poitiers) ; BORGNAT Pierre (Laboratoire de Physique, ENS Lyon) ; TAIEB Emmanuel (Triangle. Action, discours, pensée politique et économique laboratoire de recherch, Sciences Po Lyon) ; JARRAUD Sophie (Hospices Civils de Lyon, HCL) ; BARDEL-DANJEAN Claire ((Hospices Civils de Lyon, HCL) ; TROUILLET-ASSAN Sophie (Hospices Civils de Lyon, HCL) ; GAYMARD Alexandre (Hospices Civils de Lyon, HCL)
VOLET 3 – Permettre aux politiques publiques et à la société de faire face aux crises épidémiques
TICKRISK
Equipes : GILES-VERNICK Tamara (Anthropology & Ecology of Disease Emergence, Institut Pasteur) ; MARI SAEZ Almudena (Université de Montpellier) ; MALVY Jean-Marie Deni (Université de Bordeaux) ; FREY-KLETT Pascale (Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation, et l’Environnement, INRAE) ; BOURMAUD Philippe (Institut français d’études anatoliennes) ; BONNET Sarah (Ecology and Emergence of Arthropod-borne Pathogens, Institut Pasteur)
ACME
Equipes : MUELLER Judith (Unité de l’épidémiologie des maladies émergentes, Institut Pasteur) ; DE LAMBALLERIE Xavier (Unité des virus émergents, Faculté de Médecine de Marseille) ; ALLA François (Unité hospitalière d’innovation en prévention/service de prévention, CHU de Bordeaux) ; HEYERDAHL Léonard (Unité Anthropologie et Ecologie de l’Emergence des Maladies, Institut Pasteur) ; BOTELHO-NEVERS Elisabeth (Centre International de Recherche en Infectiologie, Université Jean Monnet) ; RAUDE Jocelyn (Recherche sur les Services et le Management en santé, EHESP) ; VERGER Pierre (Observatoire Régional de Santé PACA) ; VENTELOU Bruno (Aix-Marseille Sciences Economiques, Environnement & santé, Aix-Marseille Université)