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La tuberculose (TB) est l’une des infections opportunistes les plus fréquentes chez les patients VIH+ dans les pays à ressources limités. En Afrique et en Asie, la TB est aussi la principale cause de mortalité dans cette population. Le diagnostic de TB pulmonaire généralement repose sur la clinique, la radio et la détection de Mycobacterium tuberculosis (Mtb; BAAR) dans les prélèvements respiratoires notamment les crachats. La détection de BAAR dans les crachats est la méthode la plus utilisée pour diagnostiquer la TB pulmonaire et pour monitorer la réponse au traitement. Toutefois l’analyse des crachats est peu sensible et une forte proportion de TB est BAAR-. Bien que les tests de PCR-BK soient plus sensibles, de nombreux cas restent non confirmés. Le traitement anti-TB empirique (forte suspicion clinique de TB sans confirmation microbiologique) est un choix fréquent pour les cliniciens particulièrement chez les patients VIH+ sévèrement immunodéprimés. Ainsi d’autres outils sont nécessaires pour aider au diagnostic de la TB mais aussi pour évaluer la réponse au traitement chez les patients traités de façon empirique afin que les cliniciens puissent décider de continuer ou non le traitement anti-TB.

Les monocytes/macrophages sont des cellules immunitaires innées jouant un rôle important dans la pathogénèse de la TB. Les monocytes activés relarguent des formes solubles de récepteurs tels que CD14, CD163 et l’IL-1 récepteur antagoniste IL-1Ra, inhibiteur compétitif de la cytokine inflammatoire IL-1.

Dans une étude pilote chez des patients Cambodgiens inclus dans l’essai CAMELIA, nous avons montré que les concentrations plasmatiques d’IL-1Ra diminuent de façon spectaculaire après deux mois de traitements antituberculeux. L’objectif de cette étude preuve de concept est de démontrer que les concentrations d’IL-1Ra diminuent de façon significative dans les deux semaines qui suivent l’initiation du traitement anti-TB chez des adultes avec une TB documentée. Nous faisons l’hypothèse qu’en réponse à une diminution rapide de la charge mycobactérienne, les monocytes seront moins activés et que les concentrations plasmatiques de ces biomarqueurs vont décroître précocément après l’initiation d’un traitement efficace. 100 adultes avec une TB documentée seront inclus dans deux sites ANRS Cambodge (n=50) et Côte d’Ivoire (n=50). Nous mesureront les concentrations d’IL-1Ra avant traitement (BL), aux semaines 1 (S1), S2, S4, et S8. Deux autres marqueurs seront mesurés, l’IP-10 suggéré comme un possible biomarqueur prédictif de réponse au traitement anti-TB et sCD163 pour lequel nous avons montré une diminution modérée mais significative.

Population de l’étude : Adultes VIH+, naïfs d’ARV (n=60), adultes VIH- (n=40), tous avec une TB confirmée (BAAR+ et/ou Xpert MTB/RIF+). Le suivi clinique permettra de diagnostiquer des évènements: infections intercurrentes, IRIS et le devenir de la tuberculose. Des échantillons sanguins seront collectés à J0, S1, S2, S4 et S8 après le début du traitement anti-TB. Dans chaque pays le traitement anti-TB et les ARV seront administrés selon les recommandations nationales.

Objectif principal : évolution de la concentration d’IL-1Ra entre BL et S2

Objectifs secondaires :

• Evolution de la concentration d’IL-1Ra entre BL, S1, S2 et S8
• Evolution de la concentration de sCD163 et IP-10 entre BL, S1, S2, S4 et S8
• Impact de la survenue d’évènements sur l’évolution des biomarqueurs: TB-IRIS, guérison ou non de la tuberculose, souche de Mtb résistante.

Si nous démontrons que la diminution de la concentration d’IL-1Ra survient précocement après le début du traitement anti-TB, idéalement à S2 ou encore à S4, suivre ce biomarqueur pourrait être d’un intérêt majeur dans le futur, pour aider les cliniciens à décider d’arrêter ou non un traitement anti-TB empirique. Identifier des biomarqueurs précoces de réponse au traitement serait particulièrement intéressant pour les patients chez lesquels le diagnostic de TB reste difficile par ex tuberculoses pulmonaires BAAR- ou tuberculoses extrapulmonaires/disséminées chez des patients VIH+ très immunodéprimés.

Ce projet vise à élaborer, de manière participative, une proposition d’étude démonstrative pour l’offre de services de prévention combinée (PC) du VIH pour les travailleuses du sexe cisgenres (TSC), au Brésil et en France. Il sera mené en collaboration entre des groupes de recherche basés dans ces deux pays, qui accumulent des expériences réussies et complémentaires d’études sur ce sujet et qui mènent des collaborations scientifiques depuis 2020. La coopération articulera les perspectives de l’intersectionnalité et de la recherche communautaire afin de répondre aux besoins de terrain identifiés tant dans l’expérience des équipes que dans la littérature scientifique et, ainsi, pourra contribuer à l’élaboration de réponses plus adaptées aux besoins TSC face à l’épidémie de VIH, sur le plan éthique, politique, socioculturel et sanitaire. Le projet s’appuiera sur la littérature scientifique, ainsi que sur les demandes et positionnements de groupes d’experts composés de chercheurs, de TSC et de managers des programmes de contrôle du VIH/SIDA et qui seront formés dans quatre villes participantes à ce projet : Brasilia, São Paulo, Salvador et Lyon. À cette fin, les activités suivantes seront réalisées : scope review sur la prévention du VIH et le travail du sexe ; cartographie des initiatives communautaires et gouvernementales de prévention pour les TSC existantes au Brésil et en France ; mobilisation et réunion des forums d’experts à Lyon et à Brasília. Le principal résultat attendu est l’élaboration d’une proposition d’étude de démonstration basé sur l’approche intersectionnelle et la recherche communautaire, pour offrir des services de PC du VIH aux TSC, qui sera soumis aux organismes de financement des deux pays à la fin de ce contrat d’initiation. De plus, le projet contribuera à l’élargissement de la coopération entre les groupes d’experts du Brésil et de la France, dans une perspective de science citoyenne, ainsi qu’au développement d’une approche articulant l’intersectionnalité et la recherche communautaire qui permet une compréhension plus sophistiquée du phénomène multidimensionnel de la prévention du VIH chez les TSC. Les résultats pourront également fournir des subventions technico-scientifiques pour la politique publique de lutte contre le VIH au Brésil et en France, notamment en matière de prévention du VIH pour les TSC.

Contexte : 

Les populations clés identifiées dans le cadre de la lutte contre le VIH (i.e., les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes (HSH), les usagers-ères de drogues injectables (UDIs), les travailleurs-ses du sexe (TS) et leurs client-e-s ainsi que les femmes transgenre (FT)) peuvent également être plus vulnérables au SARS-CoV-2. Ceci s’explique par des conditions économiques et sociales qui rendent difficile l’adoption des gestes de protection et par un état de santé préalable potentiellement dégradé. Ces populations font aussi face à un risque VIH accru du fait des conséquences de la crise sanitaire Covid-19 sur l’accès et la continuité des soins. Les conséquences de la crise sanitaire Covid-19 sur la prévention et la prise en charge du VIH affectent également les acteurs-rices de la santé communautaire (ASC). D’une part, par leur exposition au virus dans le cadre du maintien de leur activité et d’autre part, par les besoins d’adapter leurs pratiques professionnelles au contexte. Les populations clés et les personnes vivant avec le VIH (PVVIH) sont marginalisées dans la région MENA, souvent invisibilisées dans les données Covid au niveau national et régional. Malgré le fait que la Covid-19 était la 4e cause de décès dans la région à la fin de 2020, peu d’études se sont intéressées aux populations vulnérables et les ASC et aux conséquences psychosociales de la crise sanitaire sur ces personnes.

Objectifs : 

Cette étude s’organise autour de 2 objectifs principaux : 

1. Etudier l’impact de la crise sanitaire Covid-19 sur les populations vulnérables au VIH, ou vivant avec (PVVIH), ainsi que sur les ASC ;
2. Identifier les innovations ou adaptations clés des services VIH.

Méthodes : 

Cette recherche est une étude multi-pays, transversale et communautaire utilisant une méthodologie qualitative. Elle inclut des fiches pays/analyse de contexte, des fiches structures et des entretiens auprès des populations vulnérables au VIH, des PVVIH et des ASC. Les pays concernés par l’étude sont le Maroc, l’Algérie, la Tunisie, la Mauritanie et le Liban. Le recueil de données par entretiens individuels sera réalisé via différentes canaux : en face à face, au téléphone ou en visioconférence, en fonction de la faisabilité dû au contexte sanitaire. Des analyses locales et multi-pays populationnelles seront réalisées afin d’identifier les conséquences de la crise Covid-19 sur ces populations ainsi que leurs vécus et besoins, en termes d’accès aux soins et d’exposition au risque VIH notamment. 

Résultats attendus : 

Cette recherche contribuera à évaluer les conséquences de la crise sanitaire Covid-19 sur les populations clés, les PVVIH, les ASC ainsi que sur les activités des associations de lutte contre le VIH/Sida. Les résultats permettront également de valoriser scientifiquement le vécu et l’impact d’une crise sanitaire sur des populations vulnérables, qui sont encore peu, voire pas, représentées dans la littérature scientifique. EPIC-MENA permettra de valoriser les réponses communautaires en capitalisant les adaptations/innovations mises en place pendant cette crise sanitaire pour répondre au mieux aux besoins des populations clés. 

Les inquiétudes liées à l’émergence de la pratique du chemsex, définie comme le fait de consommer des drogues dans l’intention d’avoir des pratiques sexuelles chez les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes (HSH), appellent aujourd’hui à mieux comprendre ce phénomène. Les données existantes et florissantes sur ce sujet permettent une compréhension de la pratique au prisme du risque et des complications sanitaires. Afin d’enrichir ces connaissances, nous souhaitons documenter cette pratique sur un temps suffisamment long pour en comprendre les déterminants, les nuances et les dynamiques aussi bien dans les parcours que dans les conséquences associées, ceci pour développer des réponses adéquates.

L’objectif de ce projet est donc d’étudier les parcours des HSH (et des personnes trans) ayant des pratiques de chemsex afin de définir les déterminants individuels et structurels des pratiques considérées comme problématiques, pouvant susciter une demande d’aide ou d’accompagnement.

La méthodologie de ce projet repose sur une approche communautaire et participative et mobilisera des méthodes mixtes. Le volet quantitatif sera composé d’une cohorte ouverte pendant 36 mois (avec prolongement) de 1678 HSH ayant une pratique de chemsex suivis en ligne à travers des questionnaires trimestriels qui documenteront les données sociodémographiques, l’histoire liée à la sexualité, les pratiques sexuelles, la consommation de drogues, l’entourage, la santé somatique/mentale, les parcours et accès aux soins et à la prévention. Afin d’étudier les déterminants des trajectoires problématiques, des méthodes statistiques adaptées seront utilisées (group-based trajectory models, modèles de transitions de Markov, latent transition analysis). Le volet qualitatif ciblera 25 à 36 HSH, constitués de sous-populations plus difficiles à atteindre via la cohorte (HSH nés à l’étranger, HSH de plus de 60 ans, ceux de moins de 25 ans, personnes trans, HSH ayant pratiqué le chemsex il y a plus de 2 ans). Pour les questions transversales aux deux volets, une triangulation des données est prévue, notamment afin de mieux comprendre les enjeux biographiques autour des points de ruptures et modifications des pratiques qui seront observées dans le volet quantitatif.

Les résultats nous informerons sur la diversité et l’évolution des pratiques du chemsex, les motivations, les effets positifs et les complications. Ils permettront d’identifier les freins et leviers à l’adoption de pratiques de réduction des risques et à l’accès aux soins et à l’accompagnement des personnes qui pratiquent le chemsex. Ainsi, ils participeront à adapter des interventions aux différentes pratiques et populations.

Les hommes ayant des relations sexuelles avec les hommes (HSH) utilisant la prophylaxie pré-exposition (PrEP) pour la prévention de l’infection par le VIH constituent une population à risque élevé d'infections anales à papillomavirus humains à haut risque oncogène (HPV-HR), avec une prévalence rapportée jusqu'à 82% et une incidence de 72,3/1000 personnes-mois. Des données récentes suggèrent que le risque de lésions malpighiennes intra-épithéliales de haut grade (HSIL) anales serait comparable entre les HSH utilisateurs de PrEP et les HSH vivant avec le VIH, ces derniers étant pourtant les seuls à bénéficier de recommandations de dépistage du cancer anal. Par ailleurs, des données convergentes suggèrent un rôle synergique des co-infections bactériennes, notamment à Chlamydia trachomatis (CT) et Neisseria gonorrhoeae (NG), dans la persistance des HPV-HR et la progression vers des lésions de haut grade, mécanisme jamais étudié longitudinalement au niveau anal.

IPaC-HPV est une étude ancillaire de l'essai multicentrique randomisé ANRS 174 DoxyVAC (design factoriel 2×2 évaluant la prophylaxie post-exposition par doxycycline [doxy-PEP] et le vaccin méningococcique B [4CMenB]). Parmi les 556 participants inclus, 501 HSH séronégatifs pour le VIH sous PrEP, avec au moins 12 mois de suivi et deux prélèvements anaux disponibles, seront inclus (suivi médian 22 mois, IQR 18-24, prélèvements trimestriels). L'objectif principal est d'estimer la prévalence, l'incidence cumulative et la persistance des infections HPV-HR anales dans cette cohorte. Les objectifs secondaires évaluent l'impact de la vaccination HPV, de la doxy-PEP et du vaccin 4CMenB sur la dynamique des infections HPV-HR, ainsi que l'association longitudinale entre co-infections à CT et/ou NG et persistance virale. Le typage HPV-HR sera réalisé par PCR sur écouvillons anaux archivés (kit Allplex™ HPV HR Detection, Seegene). Les analyses comprendront des modèles de régression de Poisson pour l'incidence des infections HPV-HR, des courbes de Kaplan-Meier et des modèles de Cox dépendants du temps pour la persistance.

Cette étude est la première à documenter avec une résolution trimestrielle sur 2 ans la dynamique des infections anales à HPV-HR chez les HSH sous PrEP. Elle fournira les premières données sur l'efficacité vaccinale anti-HPV dans ce groupe à haut risque et explorera, via le design randomisé de DoxyVAC, le rôle causal des co-infections bactériennes dans la persistance virale. Ces résultats permettront d'adapter directement les recommandations de dépistage du cancer anal pour cette population actuellement non ciblée. 

Contexte : Le taux d’incidence mondial du cancer anal au sein de la population générale est relativement faible (0,35 pour 100 000 personnes-années chez les hommes et 0,57 chez les femmes). Toutefois, chez les Hommes ayant des rapports Sexuels avec des Hommes (HSH) vivant avec le VIH le risque de cancer de l’anus est multiplié par 85 et il est presque 8 fois plus élevé chez les femmes vivant avec le VIH. Le cancer anal est lié dans 90% des cas à une infection HPV, infection sexuellement transmissible. Les HSH et les Travailleuses du Sexe (TS) sont plus à risque d’exposition à l’HPV haut risque (HPV-HR) et d’autant plus si ils et elles vivent avec le VIH. Les populations clés vivant avec le VIH doivent donc faire face à la stigmatisation liée à leurs pratiques sexuelles ainsi qu'à leur statut VIH et sont également surexposées au risque de cancer anal dont la prévention (prévention de la santé anale) est également taboue. Des barrières multifactorielles entravent l’accès à la santé anale, au niveau des patient-e-s (manque de connaissances sur le cancer anal, réticence de se soumettre à un examen ano-génital) et au niveau des professionnel-le-s de santé (difficultés de discuter des pratiques sexuelles, manque d’expérience dans le domaine des examens proctologiques).

Objectifs : Ce projet de recherche communautaire est construit autour d’une offre de santé anale en cours de développement au sein des 8 cliniques de santé sexuelle communautaire (CSS) de l’ALCS (association de lutte contre le Sida) au Maroc. Il a pour but de contribuer à l’amélioration de l’offre de santé anale communautaire en évaluant son acceptabilité et en l’adaptant aux besoins des Hommes ayant des rapports Sexuels avec des Hommes (HSH) et des Travailleuses du Sexe (TS) séropositif-ive-s ou séronégatif-ive-s au VIH. Ce projet a également pour but d’inclure le dépistage HPV dans l’offre en cours de déploiement.

Méthodes : Ce projet repose sur des méthodes mixtes. Les méthodes qualitatives permettront de mieux comprendre les motivations du (non) recours à une offre de santé anale parmi les HSH et les TS des CSS de l’ALCS indépendamment de leur séropositivité au VIH ainsi que le regard porté par les médecins et les agents de santé communautaire (ASC) sur une telle offre de santé. Les méthodes qualitatives permettront d’identifier la dimension sociale des comportements et attitudes envers la santé anale et le dépistage HPV. Le croisement des regards et des vécus des différent-e-s acteur-rice-s impliqué-e-s (bénéficiaires, médecins, ASC) permettra d’avoir une vision plus fine et globale des différents enjeux qui doivent être pris en compte afin d’adapter au mieux l’offre de santé anale aux besoins des personnes concernées dans un cadre communautaire. Suite à l’étude qualitative, un volet clinique incluant une consultation de proctologie et un dépistage anal du HPV (par auto-prélèvement anal [APA]) puis un volet quantitatif, compléteront le projet. L’ensemble du dispositif permettra d’évaluer l’acceptabilité de la consultation de santé anale et du dépistage HPV par APA en milieu communautaire. Les questionnaires permettront également d’identifier les barrières d’accès aux soins de santé anale et l’impact de différents facteurs (sociodémographiques, stigmatisation etc). 

Résultats attendus : Les résultats contribueront à améliorer la prise en charge de la santé anale et de l’infection HPV au Maroc. Cette étude permettra d’étudier l’acceptabilité de la consultation anale et de l’APA dans un pays du Sud ainsi que l’apport de la contribution communautaire à la prise en charge de la santé anale et au dépistage de l’infection HPV. Ce projet fournira des données sur l’infection HPV anale chez les HSH et les TS séropositifs-ives au VIH dans un pays qui n’en dispose pas à l’heure actuelle. Enfin, ce projet sera également une opportunité pour accélérer la mise en place d’un circuit d’orientation et de prise en charge adaptée aux besoins des HSH et des TS, entre les CSS de l’ALCS et les systèmes de soins privés et publics du Maroc.

La régulation de l’expression génique et de ses conséquences phénotypiques, telles que la survie et la prolifération cellulaires, repose étroitement sur l’organisation tridimensionnelle (3D) du génome. Les rétrovirus HTLV-1 et HIV-1 assurent leur persistance à long terme dans l’organisme par l’intégration de leur génome (provirus) dans l’ADN des cellules hôtes, combinée à l’expansion clonale des cellules infectées. Toutefois, les mécanismes précis impliqués dans ce mode de persistance provirale, en particulier le rôle des interactions chromatiniennes 3D entre le provirus et le génome hôte, restent encore mal compris. Dans ce contexte, nous avons récemment développé une approche innovante, COSMIQ-4C (Clone-specific Multi-contact Quantitative 4C), permettant d’analyser simultanément la structure 3D des interactions provirus-génome et la clonalité des cellules infectées par HTLV-1. Ce projet d’initiation vise à adapter cette technologie à l’étude des cellules infectées par HIV-1 et à en améliorer la sensibilité pour permettre l’analyse d’échantillons à faible charge provirale, tant pour HTLV-1 que pour HIV-1. Les résultats attendus fourniront une preuve de concept essentielle pour l’application de COSMIQ-4C à des échantillons cliniques, dans le but de mieux caractériser les réservoirs viraux persistants et d’identifier de nouvelles pistes pour leur contrôle ou leur élimination.