Winning projects and candidates

Nous avons récemment identifié Trim69, un membre peu connu de la famille de protéines à motif tripartite (Trim), comme un nouvel inhibiteur antiviral à large spectre qui agit en réorganisant le réseau de microtubules (MT) à des fins antivirales. De plus, nous avons montré que les caractéristiques saillantes de ce nouveau programme, que nous appelons recâblage des MT, représentent une facette jusqu’ici non appréciée des réponses interférons dans les cellules de la lignée myéloïde, dans lesquelles Trim69 exerce ses activités antivirales les plus puissantes.

Les microtubules représentent les principaux axes de transport à l’intérieur de la cellule et les virus ont une longue histoire documentée d’utilisation, voire d’altération des MT à des fins pro-virales. Dans le cas du VIH-1, les cores viraux utilisent les MT pour atteindre le noyau par l’intermédiaire du complexe moteur de la dynéine et, dans ce contexte plusieurs protéines associées aux microtubules (MAP) ont étés montrées comme ayant des effets pro-viraux.

Dans ce contexte, l’identification de Trim69 en tant que facteur de l’immunité inné agissant sur les principaux axes de transport de la cellule est très intéressante, car elle met en évidence la possibilité que la cellule puisse s’opposer à l’infection virale en modifiant son réseau de MT. Dans le cas du VIH-1, nous avons montré que l’inhibition du VIH-1 par Trim69 se produit après l’entrée dans la cellule, à l’étape de transcription inverse. Les données que nous avons accumulé depuis suggèrent fortement la possibilité que Trim69 interfère avec la migration dépendante de la dynéine des capsides viraux vers le noyau.

Avec ce projet, nous visons à identifier le mécanisme moléculaire par lequel Trim69 agit sur les MT et à définir précisément comment la migration des capsides viraux du VIH est affectée par Trim69 à travers la réorganisation des MT.

Bien que de nombreux facteurs cellulaires agissant sur le réseau de microtubules aient été décrits pour favoriser l’infection par le VIH, Trim69 représente pour l’instant le seul facteur de l’immunité inné agissant sur les MT à des fins antivirales. Nous pensons que nos résultats mettront en lumière l’importance du contrôle du réseau de microtubules et le révèleront comme un nouveau champ de bataille pour les interactions hôte-pathogène.

La tuberculose (TB) est une maladie respiratoire hautement contagieuse qui affecte des millions de vies chaque année, comme l'a rapporté l'Organisation mondiale de la santé en 2023. Trouver des approches innovantes pour lutter contre Mycobacterium tuberculosis (Mtb) est essentiel pour prévenir l'infection, la maladie et la transmission. Cependant, les réponses immunitaires spécifiques nécessaires pour prévenir la pathogenèse sévère de la TB ne sont pas entièrement élucidées. Il est de plus en plus reconnu que les phases initiales de l'infection jouent un rôle crucial dans le déterminisme du résultat final. Cependant, étudier ces événements précoces chez l'homme présente des défis, car ils se produisent profondément dans les poumons, et les premiers signes cliniques d'infection ne sont pas visibles.

Par conséquent, il est nécessaire de développer des modèles in vitro innovants qui reflètent avec précision les caractéristiques in vivo de l'infection à Mtb. Suite à l'inhalation, les bacilles tuberculeux colonisent finalement les macrophages, entraînant une réplication intracellulaire extensive. Notre projet vise à explorer si les bacilles pourraient potentiellement être transmis via une colonisation intermédiaire ou une adhérence aux cellules épithéliales pulmonaires. De plus, il n'est pas clair si la principale niche de réplication intracellulaire est les macrophages résidents, les monocytes recrutés, les cellules dendritiques ou les neutrophiles. Un modèle d'infection multicellulaire offre l'opportunité d'investiguer ces questions de manière opportune.

Le projet émane d'une collaboration entre deux équipes : l'équipe dirigée par Alexandre Grassart, spécialisée dans la technologie organ-on-a-chip (Ooc), et l'équipe dirigée par Priscille Brodin, avec près de 20 ans d'expérience dans les modèles cellulaires basés sur l'imagerie de l'infection à Mtb au Centre d'infection et d'immunité de l'Institut Pasteur de Lille. Notre projet vise à développer des plates-formes de puce pulmonaire personnalisées pour explorer comment les facteurs physiologiques influencent le comportement invasif de Mtb. Le projet est structuré en trois phases principales :

1. Conception et fabrication de dispositifs OoC immunocompétents mimant le tissu pulmonaire humain: la puce pulmonaire simulera l'interface alvéolo-capillaire intégrant une interface air-liquide et des macrophages cultivés dans l’épithélium. La faisabilité de cet objectif est prouvée par des résultats préliminaires obtenus par nos deux équipes reposant sur l’utilisation dun modèle « maison » similaire aux puces commerciales (EmulateTM) qui ont été récemment utilisé par nos collaborateurs McKinney et Thacker (Thacker et al., 2020 ; Mishra et al., 2023) au sein du consortium IMI2 ERA4TB. L’avantage de notre technologie OoC « maison » réside indéniablement dans son coût de fabrication (100 fois moins cher qu’une puce commerciale) et dans l’optimisation des capacités d’analyse par microscopie confocale à haute résolution.
2. Compréhension de la dynamique spatio-temporelle de l'infection à Mtb dans le poumon : Cette phase vise à déterminer les portes d’entrées cellulaires initiales de MTb au niveau d’alvéoles humaines biomimétiques par une analyse en temps réel de l'invasion à Mtb. Les questions clés incluent l'identification des premiers types cellulaires infectés par Mtb (cellules épithéliales type I , II , macrophages), les étapes dynamiques de la propagation de Mtb, de l’endiguement et de son élimination. Enfin, nous viserons à déterminer le rôle de la machinerie cellulaire hôte dans la colonisation épithéliale à Mtb.
3. Evaluation de la modélisation pathophysiologique des OoC par l’utilisation d'un panel de 10 isolats cliniques de Mtb isolés de patientes atteints de formes sévères de Mtb obtenus en collaboration avec le Professeur Dumitrescu et le Professeur Ader (Hospices Civils de Lyon ) pour les différentes caractéristiques décryptées ci-dessus.

Dans l'ensemble, ce projet abordera des questions biologiques fondamentales et apportera une nouvelle technologie pour améliorer le diagnostic de la TB.

Il est maintenant bien documenté que le VIH-1 a un impact non négligeable sur les fonctions neurologiques et cognitives – des syndromes appelés "troubles neurocognitifs associés au VIH" (HAND). Même à l'ère des thérapies antirétrovirales combinées (CART), environ la moitié des personnes vivant avec le VIH (PLWH) traitées souffrent d'altérations neurophysiologiques de diverses intensités. L'exposition seule de particules de VIH et/ou de composants (et pas seulement la réplication), entraine astrogliose et neurotoxicité. Bien que les CART soient nécessaires pour réduire la gravité des altérations induites par le VIH sur le fonctionnement cérébral, des traitements complémentaires visant à atténuer les symptômes neurologiques doivent être trouvés. Ainsi, des modèles robustes pour étudier les HAND sont nécessaires pour découvrir de nouvelles stratégies thérapeutiques visant à traiter les conséquences de l'exposition du cerveau au VIH. Cependant, mesurer l'impact de l'infection cérébrale in vitro est une tâche complexe, car elle nécessite de modéliser les principales caractéristiques du système nerveux central (SNC), notamment son architecture tridimensionnelle hautement ordonnée, sa composition multicellulaire et son réseau neuronal entrelacé.

Nous proposons ici de rechercher des moyens de lutter contre les altérations du SNC associées au VIH en identifiant de nouvelles voies moléculaires spécifiques à certains types cellulaires affectés. Nous proposons d'utiliser un modèle cérébral 3D d'organoïdes corticaux infiltrés par des monocytes (MICO) pour effectuer un séquençage d'ARN sur cellule unique après exposition au VIH afin d'identifier et de valider les voies altérées par le VIH dans les différents types cellulaires infectés et non infectés du cerveau. Les interactions inter-cellulaires nous permettent d'évaluer le fonctionnement cérébral dans toute sa complexité en mettant l'accent à la fois sur les effets directs du virus sur des cellules spécifiques et sur les effets indirects qui surviennent par le biais des interactions cellulaires dans le tissu. Nous proposons d'identifier des composés qui peuvent être utilisés pour restaurer un fonctionnement cérébral normal en agissant sur les voies perturbées et/ou leurs acteurs moléculaires. Ensuite, nous évaluerons l'action des composés identifiés sur les MICO ainsi que sur des cultures organotypiques d'explants cérébraux post-mortem d'adultes (OPAB), qui sont l'un des modèles les plus proches d'un cerveau humain adulte. L'évaluation des cellules neurales saines par rapport à celles dysfonctionnelles dans nos modèles sera réalisée en utilisant des essais biologiques classiques ainsi qu'une analyse basée sur des enregistrements de potentiels de champ local et de la microscopie confocale 3D traité par intelligence artificielle. Cela nous permettra de calculer de manière non-biaisée un grand nombre de données et d'obtenir un outil prédictif pour cartographier et isoler de manière fiable les principales caractéristiques associées au cerveau humain exposé au VIH. Ces approches combinées devraient permettre d'identifier les voies altérées dans le SNC par le VIH, ce qui pourrait ouvrir la voie au développement futur de nouvelles thérapies réduisant les symptômes des HAND, et donc améliorer la qualité de vie des PLWH.

CONTEXTE. La génération actuelle de jeunes (18-30 ans) arrive à un âge où la façon dont la sexualité est perçue et vécue change profondément. Des recherches ont montré que les jeunes connaissent des changements d'orientation sexuelle au cours du temps (aussi appelés fluidité sexuelle), notamment des changements d'attirances, d'identités et/ou de comportements sexuels. De nouvelles données démontrent aussi que la fluidité sexuelle est un déterminant essentiel des inégalités en matière de santé sexuelle, de santé mentale, de consommation de substances et de maladies chroniques. De plus, des études suggèrent que des facteurs contextuels (par exemple, les normes de genre, le climat politique) peuvent influencer les expériences de fluidité sexuelle, mettant en avant le besoin de mener des études comparatives entre pays pour mieux appréhender le rôle de ces facteurs. Des approches de recherche innovantes sont ainsi nécessaires pour comprendre comment évolue la sexualité des jeunes dans le contexte actuel. Pour combler ces lacunes, notre objectif est de développer une nouvelle étude de cohorte longitudinale sur la fluidité sexuelle chez les jeunes au Canada, en France et au Royaume-Uni (RU).

OBJECTIFS. Afin de concevoir cette étude de cohorte, nous devons mener une étude pilote dans chaque pays pour répondre aux objectifs suivants :

1. Réaliser une revue de la portée pour identifier et recenser les mesures, méthodes et cadres conceptuels utilisés pour mesurer la fluidité sexuelle.
2. Mener des entretiens pour documenter les tendances actuelles et émergentes sur la manière dont les jeunes perçoivent, expriment et vivent leur fluidité sexuelle au Canada, en France et au RU.
3. Établir des partenariats avec des acteurs communautaires et des chercheurs locaux et internationaux afin de développer une nouvelle étude de cohorte longitudinale sur la fluidité sexuelle des jeunes au Canada, en France et au RU.

MÉTHODES. Pour répondre à ces objectifs, trois études pilotes partageant des objectifs similaires seront menées au Canada, en France et au RU afin de générer des données sur la fluidité sexuelle des jeunes adaptées au contexte. La présente proposition à l'ANRS|MIE soutiendra l'étude pilote en France. Une revue de la portée permettra d'inventorier les mesures existantes pour évaluer la fluidité sexuelle (Objectif 1). Dans chaque pays, nous mènerons des entretiens individuels avec un groupe varié de 10 informateurs clés locaux, y compris des jeunes et des acteurs de santé communautaires (par exemple, pairs-éducateurs, conseillers) pour décrire les tendances actuelles et émergentes en ce qui concerne la façon dont les jeunes perçoivent, expriment et vivent la fluidité sexuelle (Objectif 2). Pour atteindre l'objectif 3, nous inviterons des informateurs clés et des chercheurs locaux (n=15) à participer à un atelier consultatif pour discuter des résultats des objectifs 1 et 2. À la fin de cette étude pilote, nous organiserons une réunion de planification internationale avec les trois équipes.

FAISABILITÉ ET CALENDRIER. Notre équipe comprend des chercheurs seniors et en début de carrière issus de diverses disciplines (épidémiologie sociale, démographie, santé publique, psychologie), offrant un environnement interdisciplinaire qui rend chacun des objectifs proposés réalisable dans le délai de 12 mois. La revue sera menée entre octobre 2024 et juin 2025. Les entretiens auront lieu en début 2025 et l'analyse sera conduite entre avril et juillet 2025. Les ateliers locaux et la réunion internationale seront menés en juin et septembre 2025. Ce financement soutiendra les activités de recherche en France. Les activités au Canada et au RU seront soutenues par des financements canadiens et du RU.

RÉSULTATS ATTENDUS. Cette étude pilote permettra d'identifier les mesures et les méthodes adaptées pour évaluer au mieux la diversité et la complexité des modèles et des trajectoires de fluidité sexuelle chez les jeunes. Cette étude offrira la possibilité d'établir des partenariats avec des leaders communautaires et des chercheurs locaux et internationaux qui faciliteront le développement de notre futur programme de recherche sur la fluidité sexuelle.

La tuberculose, qui reste un problème majeur de santé publique, résulte majoritairement d’une infection par la bactérie Mycobacterium tuberculosis (Mtb), pathogène hautement adapté à l’homme et strictement limité à celui-ci. L'hypothèse actuelle suggère que Mtb a émergé et évolué à partir d'un pool ancestral de souches mycobactériennes disposant d'un réservoir environnemental et partageant des caractéristiques communes avec les souches de Mycobacterium canettii. Des cas de tuberculose humaine causée par M. canettii ont été détectés, mais ils sont rares et limités à la Corne de l’Afrique. Chez la souris, un défaut de persistance a été observé pour M. canettii comparativement à Mtb. En outre, un défaut de réplication a été mis en évidence in vitro dans différents types de macrophages murins et humains. Les mécanismes responsables de ces différences n’ont pas été élucidés et le devenir intracellulaire de M. canettii reste peu étudié.

L’objectif de ce projet est de caractériser les interactions entre M. canettii et les macrophages alvéolaires qui jouent un rôle clé lors d’une infection pulmonaire. Pour cela, nous utiliserons un modèle cellulaire de macrophages alvéolaires murins appelé cellules MPI (pour Max Planck Institute). Ces cellules présentent un phénotype et des fonctionnalités très proches des macrophages alvéolaires primaires lorsqu’elles sont cultivées en présence de GM-CSF. Au cours de ce projet, nous étudierons le devenir intracellulaire de la souche M. canettii STB-K, la plus éloignée génétiquement de Mtb, dans les MPI et nous le comparerons à celui de la souche contrôle de Mtb H37Rv.

La première partie de ce projet sera consacrée à caractériser les paramètres clés de la survie intracellulaire tels que l’internalisation, la réplication, et la maturation du phagosome pour la souche STB-K, comparativement à H37Rv, dans les cellules MPI. Pour cela nous disposons au laboratoire des souches STB-K et H37Rv exprimant constitutivement la GFP (Green Fluorescent Protein). (M1 à M4).

L’autophagie étant impliquée dans la clairance de Mtb, nous étudierons l’impact de cette voie de dégradation sur le devenir intracellulaire de STB-K, comparativement à H37Rv. Nous analyserons la co-localisation des bactéries avec LC3, marqueur clé des vésicules d’autophagie, par microscopie confocale de type STED. Cette technologie de pointe permet d’obtenir une résolution proche de celle de la microscopie électronique. Afin de distinguer la voie canonique d’autophagie de la voie non canonique (LC3 associated Phagocytosis ou LAP), nous analyserons également la co-localisation des bactéries avec des marqueurs spécifiques de la LAP tels que Rubicon et NOX2 (M4 à M7). 

La caractérisation des voies de l’autophagie et l’identification des acteurs impliqués dans le devenir intracellulaire de STB-K seront réalisées par une analyse transcriptomique (RNAseq) et protéique (WBlot) à partir de cellules infectées par STB-K, comparativement à H37Rv (M4 à M12). De plus, nous évaluerons l’impact de chacune de ces voies sur la clairance bactérienne en transfectant les MPIs avec des siRNAs spécifiques préalablement à l’infection (M7 à M10).

Nous étudierons également à l’aide de siRNA le rôle de l’E3 ubiquitine ligase Smurf1 dans l’adressage de STB-K vers les voies de l’autophagie, des études antérieures ayant établi un lien entre Smurf1 et l’adressage de Mtb à ces mêmes voies (M11-M12).

Enfin nous évaluerons la réponse immunitaire innée induite par STB-K par analyse transcriptomique et par dosage cytokinique (M10 à M12).

Cette étude permettra (i) de caractériser le devenir intracellulaire de M. canettii dans des macrophages alvéolaires ainsi que la réponse immunitaire innée induite par l’infection, en prenant comme modèle d’étude la souche STB-K, et (ii) de déterminer l’impact des voies d’autophagie sur la clairance de la bactérie.

Les maladies hépatiques virales chroniques représentent un problème de santé publique majeure.  L'infection chronique par le virus de l'hépatite C (VHC) est un facteur de risque majeur pour le développement de la fibrose, de la cirrhose et du carcinome hépatocellulaire (CHC), la quatrième cause de mortalité liée au cancer dans le monde. Jusqu'à 85-95% des cancers du foie se développent dans le cadre d'une maladie fibrotique. Cependant, il n'existe toujours pas de thérapie approuvée pour la fibrose et les options thérapeutiques actuelles pour le CHC sont encore très insatisfaisantes. De plus, il n'existe pas de stratégie thérapeutique pour prévenir le développement du CHC chez les patients à risque ou la récidive du CHC après une intervention.

Il est estimé que 57 millions de personnes vivent avec une infection chronique par le VHC dans le monde et que 300 000 décès liés au VHC surviennent chaque année. La disponibilité d'antiviraux à action directe (AAD) a révolutionné les thérapies anti-VHC. Néanmoins, la suppression ou le contrôle viral n'élimine pas le risque de CHC chez les patients présentant une fibrose avancée. L’infection par le VHC est associée à des schémas transcriptionnels pro-oncogènes, à des modifications épigénétiques et à une perturbation des réponses immunitaires qui peuvent persister même après une cure d'AAD. Par conséquent, cibler les mécanismes oncogéniques associés au virus peut être une stratégie intéressante pour prévenir le CHC.

La chimioprévention du CHC est apparue comme une nouvelle stratégie prometteuse. Cependant, aucune thérapie de ce type n'a été mise en place à ce jour en raison de la difficulté à valider expérimentalement les cibles candidates. En 2008, une signature pronostique hépatique (PLS) de 186 gènes a été identifiée chez des patients fibrotiques infectés par le VHC comme une signature prédisant la progression de la maladie et le risque de CHC. Récemment, nous avons établi un système cellulaire unique qui reproduit la PLS (cPLS). Il est basé sur l’utilisation de cellules hépatocytaires infectées par le VHC qui reproduisent les dérégulations transcriptomiques observées chez les patients évoluant vers un CHC. Nos études précédentes ont montré que l'inversion de la cPLS de mauvais pronostic en cPLS de bon pronostic par des molécules candidates se traduit par un effet sur la progression de la fibrose et sur l'hépatocarcinogenèse in vivo. Le modèle cPLS offre donc des possibilités uniques de découvrir des composés pour la chimioprévention du CHC induit par le VHC.

Notre principal objectif était d'utiliser ce système cPLS pour la découverte de médicaments chimiopréventifs. Pour atteindre cet objectif, nous avons effectué un criblage de 52 composés approuvés par la FDA et sélectionnés bio-informatiquement dans le système cPLS. Parmi les 52 composés, nous avons identifié 11 composés candidats qui révertent la cPLS indépendamment de la charge virale. De manière intéressante, plusieurs composés agissent sur la signalisation calcique, un processus crucial régulant le métabolisme hépatique, la prolifération cellulaire et l'inflammation. Pour mieux comprendre le potentiel de la signalisation calcique pour la chimioprévention du CHC, nous allons maintenant étudier le mécanisme d'action moléculaire des principaux composés identifiés en utilisant des systèmes cellulaires et des modèles ex vivo dérivés de patients. Notre programme est basé sur (i) la confirmation que les composés sélectionnés agissent sur la cPLS de mauvais pronostic induite par le VHC en modulant la signalisation calcique (ii) la confirmation de l'engagement de la cible et de la spécificité des composés en utilisant des études de perte et de gain de fonction et (iii) la validation de nos résultats dans des modèles ex vivo cliniquement pertinents dérivés de patients.

Ce programme permettra d’obtenir un ensemble de données solides pour une étude plus approfondie dans des modèles précliniques murins de fibrose et de CHC. L'identification de composés candidats pour la chimioprévention du CHC déjà approuvés par la FDA ouvrira la voie au développement de futures stratégies thérapeutiques et accélérera la traduction clinique.

Contexte : Le taux d’incidence mondial du cancer anal au sein de la population générale est relativement faible (0,35 pour 100 000 personnes-années chez les hommes et 0,57 chez les femmes). Toutefois, chez les Hommes ayant des rapports Sexuels avec des Hommes (HSH) vivant avec le VIH le risque de cancer de l’anus est multiplié par 85 et il est presque 8 fois plus élevé chez les femmes vivant avec le VIH. Le cancer anal est lié dans 90% des cas à une infection HPV, infection sexuellement transmissible. Les HSH et les Travailleuses du Sexe (TS) sont plus à risque d’exposition à l’HPV haut risque (HPV-HR) et d’autant plus si ils et elles vivent avec le VIH. Les populations clés vivant avec le VIH doivent donc faire face à la stigmatisation liée à leurs pratiques sexuelles ainsi qu'à leur statut VIH et sont également surexposées au risque de cancer anal dont la prévention (prévention de la santé anale) est également taboue. Des barrières multifactorielles entravent l’accès à la santé anale, au niveau des patient-e-s (manque de connaissances sur le cancer anal, réticence de se soumettre à un examen ano-génital) et au niveau des professionnel-le-s de santé (difficultés de discuter des pratiques sexuelles, manque d’expérience dans le domaine des examens proctologiques).

Objectifs : Ce projet de recherche communautaire est construit autour d’une offre de santé anale en cours de développement au sein des 8 cliniques de santé sexuelle communautaire (CSS) de l’ALCS (association de lutte contre le Sida) au Maroc. Il a pour but de contribuer à l’amélioration de l’offre de santé anale communautaire en évaluant son acceptabilité et en l’adaptant aux besoins des Hommes ayant des rapports Sexuels avec des Hommes (HSH) et des Travailleuses du Sexe (TS) séropositif-ive-s ou séronégatif-ive-s au VIH. Ce projet a également pour but d’inclure le dépistage HPV dans l’offre en cours de déploiement.

Méthodes : Ce projet repose sur des méthodes mixtes. Les méthodes qualitatives permettront de mieux comprendre les motivations du (non) recours à une offre de santé anale parmi les HSH et les TS des CSS de l’ALCS indépendamment de leur séropositivité au VIH ainsi que le regard porté par les médecins et les agents de santé communautaire (ASC) sur une telle offre de santé. Les méthodes qualitatives permettront d’identifier la dimension sociale des comportements et attitudes envers la santé anale et le dépistage HPV. Le croisement des regards et des vécus des différent-e-s acteur-rice-s impliqué-e-s (bénéficiaires, médecins, ASC) permettra d’avoir une vision plus fine et globale des différents enjeux qui doivent être pris en compte afin d’adapter au mieux l’offre de santé anale aux besoins des personnes concernées dans un cadre communautaire. Suite à l’étude qualitative, un volet clinique incluant une consultation de proctologie et un dépistage anal du HPV (par auto-prélèvement anal [APA]) puis un volet quantitatif, compléteront le projet. L’ensemble du dispositif permettra d’évaluer l’acceptabilité de la consultation de santé anale et du dépistage HPV par APA en milieu communautaire. Les questionnaires permettront également d’identifier les barrières d’accès aux soins de santé anale et l’impact de différents facteurs (sociodémographiques, stigmatisation etc). 

Résultats attendus : Les résultats contribueront à améliorer la prise en charge de la santé anale et de l’infection HPV au Maroc. Cette étude permettra d’étudier l’acceptabilité de la consultation anale et de l’APA dans un pays du Sud ainsi que l’apport de la contribution communautaire à la prise en charge de la santé anale et au dépistage de l’infection HPV. Ce projet fournira des données sur l’infection HPV anale chez les HSH et les TS séropositifs-ives au VIH dans un pays qui n’en dispose pas à l’heure actuelle. Enfin, ce projet sera également une opportunité pour accélérer la mise en place d’un circuit d’orientation et de prise en charge adaptée aux besoins des HSH et des TS, entre les CSS de l’ALCS et les systèmes de soins privés et publics du Maroc.

Contexte : En Afrique sub-saharienne (SSA), la mortalité liée à la cirrhose et au carcinome hépatocellulaire (CHC) est l’une des plus élevées au monde. Les patients sont diagnostiqués à un stade très avancé faute de programme de diagnostic précoce et de surveillance de la cirrhose.

But de l’étude : L’étude CIRCA a pour objectif d’évaluer la faisabilité d’une stratégie basée exclusivement sur des tests rapides pour le dépistage précoce et décentralisé de la cirrhose et du CHC en Gambie.

Objectifs : L’objectif principal de l’étude sera d’évaluer la cascade des soins dans une population adulte de plus de 30 ans se présentant dans des structures de santé primaires. Les objectifs secondaires seront l’évaluation de : i) l’adhérence au programme de dépistage du CHC ; ii) la prévalence de la cirrhose compensée, iv) des causes de la cirrhose (virales et non virales) ; ii) l’incidence du CHC et de la décompensation hépatique ; iii) la mortalité toute cause confondue et la mortalité hépatique.

Méthodes : étude interventionnelle pilote avec suivi longitudinal dans deux structures de santé primaires en Gambie. Population étudiée: adultes de plus de 30 ans, sans épisode infectieux aigu ou autre condition menaçant le pronostic vital immédiat. La stratégie proposée comprendra deux phases précédées d’une phase de formation et de validation d’un échographe portatif innovant: Phase 1: dépistage de la cirrhose parmi les patients consécutifs se présentant dans les deux structures de santé de l’étude. Phase 2: suivi regulier des patients cirrhotiques ainsi que programme de surveillance du CHC. Alors que le dépistage de la cirrhose sera proposé à tous les patients fréquentant les structures de santé de l'étude, le programme de surveillance du CHC sera mis en place chez les patients diagnostiqués avec une cirrhose. L'intervention proposée sera basée sur des outils diagnostiques décentralisés à partir d’un algorithme de diagnostic et de surveillance simplifié. Deux infirmiers gambiens seront formés à l’utilisation du Fibroscan. Deux cliniciens juniors gambiens effectueront des stages de formation à l’échographie abdominale dans un hôpital de référence en France et seront régulièrement supervisés par une équipe experte (hépatologue, radiologue interventionnel). Nous dépisterons 7500 patients, et 150 patients diagnostiqués avec une cirrhose seront inclus dans la cohorte.

Retombées attendues : Notre étude devrait démontrer la faisabilité d’un programme simplifié de dépistage précoce de la cirrhose et de surveillance du CHC en Afrique. En travaillant en étroite collaboration avec les structures de santé et les autorités de santé nationales, notre programme renforcera les capacités de prise en charge de la cirrhose et du CHC et sensibilisera les équipes locales à la prise en charge d’une maladie jusque là largement négligée en Afrique.

De nombreux facteurs cellulaires pouvant potentiellement interférer avec la progression des infections rétrovirales ont été identifiés chez les mammifères. L'expression de ces facteurs de restriction est souvent induite par l'interféron et constitue la première ligne de la réponse immunitaire innée de l’hôte. Parmi eux, le facteur de restriction spécifique d’espèce TRIM5alpha, est capable de bloquer les infections lentivirales via une interaction directe au niveau de la capside virale. Cependant les détails moléculaires de son action antivirale restent encore à explorer. Grâce à un crible génétique de perte de fonction, nous avons précédemment identifier de potentiels cofacteurs impliqués dans cette restriction et confirmé le rôle de 2 d’entre eux (PRELID3A et TRDMT1) comme partenaires fonctionnels dans cette restriction. PRELID3A, localisée dans l’espace inter-membranaire mitochondrial, fait partie des protéines à domaine PRELI, qui, lorsque qu’elle sont complexées à TRIAP1, participent au transport d’acide gras de la membrane externe vers la membrane interne. Par ARN interférence, nous avons pu montrer que certaines protéines de ce complexe étaient elles aussi impliquées dans la restriction virale médiée par TRIM5alpha. Ces résultats suggèrent une implication de ce complexe TRIAP1-PRELID et de la mitochondrie dans le contrôle de l’infection virale médiée par TRIM5alpha. TRDMT1 est une ARN méthyltransférase déjà impliquée dans la méthylation m5C des ARN du HIV-1 qui est relocalisée dans le cytoplasme lors de l’infection. Ainsi, nous étudierons également, l’importance de cette méthylation dans la restriction en présence ou non de TRIM5alpha.

Ce projet permettra d’apporter de réelles avancées dans le mécanisme d’action de ce facteur de restriction décrit depuis près de 20 ans.