Projets et candidats lauréats

Au cours du cycle de réplication du Virus de l’Hépatite B (VHB), les particules virales infectieuses sont à ADN et enveloppées (particules de Dane). En dehors de ces particules virales sauvages, d’autres formes virales peuvent être retrouvées dans le sang ou dans des modèles expérimentaux d’expression du VHB. Parmi celles ci, des particules défectives à ADN tronqué (après épissage alternatif d’un transcrit viral), des nucléocapsides libres ou des vésicules d’exocytose contenant des fragments de génome viral (ARN ou ADN) ont été rapportées. Des récents travaux ont également mis en évidence l’existence de particules virale circulantes contenant un génome viral du VHB à ARN. Ces formes virales sont retrouvées dans le sang de porteurs chroniques du VHB mais également dans les modèles expérimentaux d’étude du VHB aussi bien in vitro et qu’in vivo.

Notre objectif est d’une part de caractériser la diversité des particules du VHB à ARN à ADN circulants dans le sang de patients infectés et d’autre part d’en évaluer l’impact sur nos modèles d’infection, in vitro.

Pour cette étude, nous avons bénéficié de l’accès à la cohorte nationale Hepather nous permettant d’obtenir un panel de 325 prélèvements sanguins de porteurs chroniques du VHB traités ou non et à différents stades de la maladie hépatique. La quantification des formes virales à ARN prégénomique ou épissé et à ADN sauvage ou défectif a été réalisée. Elle a permis d’établir une cartographie de la diversité du génome virale des formes circulantes sur les échantillons de cette cohorte. La corrélation éventuelle de cette diversité virologique avec les caractéristiques clinico-virologiques des patients inclus nécessite une investigation clinique plus poussée que nous réaliserons en collaboration avec le personnel d’Hepather. Cette diversité virologique importante nous a également conduit à explorer son impact sur l’infection et la réplication virale, in vitro. Des travaux préliminaires, réalisés à partir de prélèvements de patients inclus dans cette étude, ont mis en évidence un comportement virologique différent après infection virale qui pourrait résulter de cette diversité initiale de l’inoculum. Ces résultats devront être étayés par de nouvelles expériences d’infection in vitro, après inclusion de nouveaux patients de la cohorte Hepather présentant une charge virale élevée.

En conclusion, nos travaux de recherche pourraient contribuer à une meilleure compréhension du rôle des particules virales à ARN et plus généralement, de la diversité du génome des formes virologiques circulantes du VHB, sur l’infection et la réplication virale.

Objectifs : Ce projet s’inscrit dans le cadre de l’essai SMILE, une étude multicentrique ouverte de phase 2/3, randomisée, évaluant l’innocuité et l’effet antiviral d’un inhibiteur de l’intégrase le dolutegravir associé au darunavir/ritonavir (DRV/r) versus une trithérapie antirétrovirale classique ininterrompue. Trois cents enfants infectés par le VIH-1 et contrôlé d’un point de vue virologique depuis au moins 1 an (ARN du VIH-1 <50 c / mL) ont été inclus en Europe occidentale et orientale, Afrique du Sud, Thaïlande, Ouganda et d’Amérique latine. Les buts de ce volet complémentaire seront de décrire la pharmacocinétique du dolutegravir et du darunavir ainsi que leur forme libre (active) dans une large population d’enfants, afin de comprendre les facteurs à l’origine de la variabilité interindividuelle et de déterminer la posologie optimale pour chaque enfant. Nous vérifierons également si l’interaction décrite entre dolutegravir et darunavir ne modifie pas significativement les concentrations de ces composés. Nous tenterons de relier ces concentrations à la charge virale des enfants. Ces résultats seront importants pour le traitement des enfants, compte tenu de la place que prennent ces 2 molécules.

Situation du sujet : La pharmacocinétique du dolutégravir n’a été établie que dans 2 études (IMPACTP1093 et Odyssey), soit chez 10 et 26 enfants, ce qui ne permet pas d’évaluer et d’expliquer la variabilité interindividuelle. De plus, le darunavir est donné en une prise par jour chez des enfants de 6 à 12 ans suite à des simulations mais cette dose n’a jusqu’ici jamais été administrée à l’enfant dans un essai clinique. Aucune donnée concernant la forme libre, forme active de la molécule, n’a été rapportée ni pour le darunavir, ni pour le dolutegravir chez l’enfant. Une interaction pharmacocinétique a été montrée entre ces 2 molécules mais ne semble pas avoir d’impact clinique chez l’adulte.

Problématique : Nos hypothèses de travail sont que i) la variabilité interindividuelle des concentrations chez l’enfant peut être expliquée par des facteurs comme le poids, l’âge, la bilirubine, ii) la posologie optimale peut être déterminée en fonction de ces facteurs  ii) les variations de niveau de protéines plasmatiques de l’enfant modifient la fraction libre, active de médicament et celle-ci peut être relié à l’issu virologique du traitement iii) l’impact de l’interaction pharmacocinétique entre le darunavir et le dolutegravir peut être négligé.    

Méthode : Un ou 2 prélèvements de sang sont prévus aux semaines 4, 12 et 24 de traitement, les concentrations d’antirétroviraux de la forme totale et de la forme libre seront dosées par LC-MS/MS. Les données de concentrations seront analysées selon une approche de population. Le lien entre la détectabilité de la charge virale et les expositions (forme libre) à toutes les molécules prises par le patient sera étudié grâce à une régression logistique.  

Echéancier des travaux : Le rendu des analyses se fera d’ici septembre 2021.

Résultats attendus : Ce travail permettra de décrire la pharmacocinétique du dolutegravir et du darunavir ainsi que leur forme libre (active) chez 150 enfants, nous tenterons de relier ces concentrations à la charge virale des enfants. Nous déterminerons la posologie optimale de darunavir et de dolutegravir à administrer quel que soit l’âge, le poids de l’enfant.

L’infection par le VIH est associée à un pronostic thérapeutique plus défavorable chez les enfants atteints de tuberculose (TB). Les enfants malnutris ont également un risque élevé de progression de la TB et de résultats thérapeutiques sous-optimaux. Malgré les recommandations de l’Organisation mondiale de la santé (OMS) en 2010 d’augmenter les doses de médicaments antituberculeux chez les enfants et l’accessibilité des nouvelles associations à dose fixe (FDC) de médicaments de première ligne pour le traitement de la TB, des études récentes indiquent que les enfants présentant une malnutrition ou infectés par le VIH les enfants risquent d’être sous-dosés. Il est donc primordial de fournir de meilleurs algorithmes de dosage pour cette population vulnérable.

L’objectif principal de l’étude est d’évaluer l’effet de la malnutrition aiguë sévère sur les concentrations plasmatiques de rifampicine (R), d’isoniazide (H), de pyrazinamide (Z) et d’éthambutol (E) chez des enfants co-infectés TB/VIH. Les objectifs secondaires incluent: déterminer si les nouvelles posologies de l’OMS permettent d’atteindre des concentrations plasmatiques supérieures aux concentrations thérapeutiques cibles chez les enfants co-infectés TB/VIH  avec et sans malnutrition aiguë sévère (MAS, d’évaluer l’effet de l’infection à VIH et d’autre caractéristiques sur les paramètre pharmacocinétiques (PK), de relier la PK aux résultats du traitement antiTB (PK/PD), et de générer un algorithme de dosage optimal pour R, H, Z et E, aux enfants VIH+ avec ou sans MAS.

 Il s’agira d’une étude observationnelle de PK intensive de R, H, Z et E intégrée aux études diagnostiques TB-Speed ​​HIV et TB-Speed ​​SAM et réalisée entre 2 et 4 semaines de traitement antiTB dans 4 groupes d’enfants (n = 65 ans) âgés de 6 mois à 5 ans recevant une FLD: Groupe (Gr.) 1. 15 enfants VIH+ avec MAS; Gr2. 30 enfants VIH+ sans MAS; Gr3. 10 enfants VIH-négatif avec MAS ; Gr4. 10 enfants VIH-négatifs sans MAS. Les groupes 1, 2 et 3 seront inclus parmi les participants aux études TB-Speed ​​VIH et TB-Speed ​​SAM en Ouganda et en Zambie; le Gr. 4 sera recruté dans la cohorte de soins antiTB de routine en Zambie. Un consentement éclairé sera demandé aux parents ou au tuteur.

Tous les enfants inscrits recevront un traitement antituberculeux utilisant 2HRZ (E) / 4RH avec de nouvelles formulations pédiatriques utilisant des associations dispersibles à doses fixes aux doses recommandées par l’OMS: H 10 (7-15) mg/kg/jour / R 15 (10-20) / Z 35 (30-40) (MacLeods) + E 20 dispersible séparé (15-25). Une journée intensive de PK sera menée entre 2 et 4 semaines de traitement antiTB avec des échantillons de sang (volume = 1 ml) prélevés avant la dose (0), puis à intervalles de 1, 2, 4, 6 et 8 heures. Un échantillon de sang supplémentaire de 1 ml sera prélevé pour la pharmacogénétique de l’INH. Les échantillons de sang obtenus seront conserves dans un congélateur à -80 ° C jusqu’à leur expédition à l’hôpital de Bicêtre, au Kremlin-Bicêtre, en France. Les concentrations plasmatiques de médicaments seront déterminées à l’aide d’une LC / MS / MS de nouvelle génération permettant le dosage simultané des quatre médicaments antituberculeux dans du plasma stabilisé à l’acide ascorbique. Les analyses comprendront : estimations des paramètres pharmacocinétiques (Cmax, AUC), modélisation de la PK pour évaluer l’impact des covariables, dérivation d’algorithmes de dosage optimaux, modélisation PKPD, simulation d’expositions pharmacocinétiques.Le projet débutera en juillet 2019. Les inscriptions dureront d’octobre 2019 à septembre 2020. La finalisation de l’analyse statistique est prévue en juin 2021 pour une durée totale de l’étude de 24 mois.Cette étude innovante TB-PK apportera des données probantes sur l’impact de la malnutrition sur les médicaments pour le traitement de la tuberculose FLD et pourrait avoir un impact significatif sur la révision des directives posologiques pour les enfants atteints de MAS et / ou de VIH.

Introduction

Le traitement post-exposition (TPE) est un mode important de prévention de l’infection par le VIH. Il s’agit d’une trithérapie antirétrovirale administrée le plus tôt possible après l’exposition, au plus tard dans les 48 heures. C’est donc un traitement d’urgence ; or, son accessibilité est encore problématique en France. Seules 3 structures peuvent en effet le délivrer : les services hospitaliers d’infectiologie ; les services d’urgences des hôpitaux et des cliniques ; et les Cegidd. Or, les premiers sont d’accès complexe pour les particuliers ; services d’infectiologie et Cegidd n’accueillent les publics qu’en heures/jours ouvrables ; les Urgences sont plus difficiles d’accès que jamais, et il n’est jamais aisé d’y faire état d’un rapport sexuel à risque.

Ce constat sur la difficulté d’accès au TPE est en décalage avec la grande simplicité de l’association recommandée dans cette indication (evipléra : ténofovir disoproxil fumarate – emtricitabine – rilpivirine) :

• aucune contre-indication pour une prise sur quelques jours ;
• interactions médicamenteuses se résumant à une moindre absorption de la rilpivirine sous traitements anti-acidité gastrique ;
• aucune toxicité aiguë à redouter (en dehors d’une allergie, trop théorique pour être un obstacle), et des effets indésirables très limités.

De ce fait, ses possibilités de délivrance devraient être beaucoup plus larges.

But de l’expérimentation

Déterminer dans quelle mesure la délivrance initiale du TPE peut être réalisée par des personnes formées mais non soignantes (ni médecin, ni infirmier.e, ni pharmacien.ne).

Méthode 

Quatre territoires seront impliqués via leur Corevih (Arc Alpin ; agglomération de Tours ; territoire du Corevih Île-de-France Nord) ou l’association M sans Sida (agglomération de Montpellier).

Une collaboration sera nouée avec les associations d’accompagnement et de soutien des populations exposées au VIH (hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes, travailleurs.euses du sexe, personnes trans, migrant.e.s originaires de zones de prévalence du VIH >1%) dans les territoires concernés par l’expérimentation : une formation de leurs membres sera réalisée (sur le VIH, les indications de TPE et son suivi) ; elles seront dépositaires de starter kits comprenant 5 jours de TPE (5 comprimés d’eviplera) et des documents d’information sur le VIH et le TPE. Les membres formé.e.s de ces associations pourront ainsi, lorsqu’ils/elles seront contacté.e.s par une personne venant d’être victime d’une exposition sexuelle, évaluer l’indication de TPE, délivrer immédiatement un starter kit à cette personne si l’indication existe, et l’orienter quant aux modalités de suivi ultérieur en infectiologie hospitalière ou en Cegidd. Une telle délivrance sera plus simple qu’un recours aux guichets « classiques » de délivrance du TPE. En parallèle, dans les territoires où se déroulera l’essai, une information sera réalisée pour que ce circuit alternatif de TPE soit connu des populations concernées ; en cas d’appel de Sida-Info-Service pour un accident d’exposition, ce service signalera aussi ce circuit si la personne est présente dans l’un des territoires d’expérimentation.

En dehors de ce mode d’accès expérimental aux premiers jours de traitement, les personnes auront ensuite un circuit de TPE en tout point identique aux recommandations (trithérapie identique, consultation rapide [dans les 5 jours] en infectiologie/Cegidd pour réévaluation de l’indication de TPE, prescription du TPE pour un total de 28 jours, bilan initial, suivi sérologique, counselling, orientation vers la PrEP si indiquée). 

Un comité médical d’évaluation se réunira tous les 2 mois pour évaluer rétrospectivement pour chaque inclusion si un starter kit devait être donné. le critère de jugement principal sera la concordance entre d’une part l’attitude du / de la membre d’association et d’autre part l’attitude qu’il fallait avoir selon ce comité médical.

En parallèle, seront réalisées une analyse des perceptions des personnes incluses (brefs questionnaires, entretiens) et des membres associatifs.ves impliqué.e.s dans le dispositif (focus groups).

Le virus de l’hépatite C (VHC) est un problème de santé publique majeur, avec plus de 70 millions de personnes infectées dans le monde. Des antiviraux à action directe (AAD) hautement efficaces sont actuellement disponibles. Comme les AAD ne sont que curatifs, le développement d’un vaccin pourrait offrir des perspectives importantes pour prévenir et éradiquer la maladie. Pour cela, une connaissance plus approfondie de la structure des particules de VHC est nécessaire ; en effet, ces particules sont inhabituellement hétérogènes en termes de morphologie, de taille et de propriétés, et de plus le VHC présente une variabilité génétique élevée, avec de nombreux génotypes et sous-types. Enfin, le virus a développé des mécanismes très efficaces pour échapper à la réponse immunitaire, en particulier les anticorps neutralisants. Aussi, le développement d’un vaccin nécessite d’étudier plus avant la structure des virions, et plus précisément, comment l’association des virions avec les lipides neutres et les apolipoprotéines induisent la résistance à la neutralisation.

La plupart des mécanismes moléculaires du VHC ont été caractérisés en utilisant des particules peu ou pas lipidées, avec des virions produits à partir de cellules Huh-7.5 qui sécrètent des VLDL altérées. Néanmoins, des études récentes de notre laboratoire ont montré que le sérum humain est essentiel pour produire in vitro des particules VHCcc « matures », reflétant pleinement la composition des particules trouvées dans le sérum des patients, telles que le déplacement vers les très basses densités, dû à l’incorporation de lipides neutres, et l’association avec apoB. Ces caractéristiques biochimiques et biophysiques, qui peuvent également être reconstituées par une incubation de courte durée des particules avec du sérum humain ou, alternativement, avec des lipoprotéines purifiées combinées avec un composant sérique non lipidique, seront un atout clé pour (re)investiguer différentes questions qui restent non résolues dans le domaine.

Premièrement, le mécanisme de maturation des particules de HCV sera détaillé. En effet, nous avons mis en évidence qu’un déterminant du site d’assemblage des VHCcc peut «amorcer» les particules pour leur lipidation à un stade post-assemblage et post-sécrétion, probablement en impliquant des facteurs cellulaires spécifiques. En particulier, le rôle de facteurs de la voie du métabolisme des VLDL sera étudié. De plus, le rôle dans ce mécanisme de la région hypervariable (HVRI) de la glycoprotéine E2 sera clarifié. Enfin, la lipidomique des particules lipidées du VHC sera déterminée afin de caractériser plus avant la composition de ces particules.

Deuxièmement, l’influence de la maturation des particules sur l’entrée cellulaire sera caractérisée. En effet, l’utilisation des récepteurs impliqués lors de l’entrée virale et plus généralement la voie d’entrée, peuvent être modulées par les lipides et/ou les apolipoprotéines présentes sur ou dans les virions. Nous étudierons également la possibilité qu’une étape de délipidation, via une interaction avec des récepteurs de transfert de lipides tels que SR-BI, est nécessaire ou stimule le processus d’entrée cellulaire en démasquant les déterminants de la liaison de E2 à CD81, un récepteur majeur d’entrée dans la cellule.

Troisièmement, nous caractériserons comment la maturation permet aux particules du VHC d’être protégées contre les anticorps neutralisants et, plus particulièrement, les mécanismes impliquant le domaine HVRI de E2 ainsi que les principales étapes de l’entrée cellulaire. Nous examinerons enfin un panel d’anticorps monoclonaux ciblant différentes régions des glycoprotéines E1-E2 pour identifier anticorps et épitopes permettant la neutralisation des particules virales complètement lipidées.

Bien que les 20 dernières années aient permis une étude approfondie du VHC, le récent modèle de maturation du VHC par lipidation ex vivo développé dans notre laboratoire devrait contribuer à préciser de nombreux aspects fondamentaux du virus, en vue d’aider au développement rationalisé d’un vaccin pouvant induire des réponses immunitaires pleinement efficaces contre les particules matures.

Tout comme l’ADN ou les protéines, l’ARN est soumis à de nombreuses modifications chimiques, en particulier, les ARN viraux du VIH-1 contiennent les modifications m6A, m5C et 2′-O-Met. Même si une cartographie de ces modifications n’est pas établie de manière claire et précise, des modifications m6A et m5C sur l’ARNm du VIH-1 ont été préalablement identifiées au niveau du site de décalage du cadre de lecture entre Gag et Pol. Le VIH-1, comme beaucoup de rétrovirus, utilise un décalage du cadre de lecture programmé en -1, (-1 PRF) pour générer les protéines Gag et Gag-Pol, celui-ci est donc essentiel pour la réplication virale. Cependant, l’abondance des ribosomes sur l’ARNm est un facteur susceptible d’altérer l’efficacité du -1PRF. De manière générale, la distribution des ribosomes le long d’un ARNm, déterminée par la faible vitesse d’initiation par rapport à l’élongation, permet d’éviter les collisions. Néanmoins, des changements dans les vitesses d’initiation ou d’élongation peuvent altérer la fréquence de collisions, ce qui peut affecter de manière significative le frameshift programmé et donc l’expression de la polyprotéine Gag-pol. La modification m6A étant capable de ralentir ponctuellement le ribosome, il est possible que l’état de modification d’un ARNm soit un facteur de régulation de sa traduction.

Notre projet a pour but dans un premier temps de vérifier et caractériser la présence des modifications dans le génome du VIH en utilisant la technique de séquençage par nanopore qui permet de séquencer entièrement et de manière directe les molécules d’ARN. Afin de déduire la présence de sites portant des modifications, les molécules d’ARNm seront extraites de lymphocytes T CD4 + infectés par le VIH-1 et leur séquençage sera comparé à celui des mêmes molécules d’ARN mais transcrites in vitro et donc non modifiées. Dans un deuxième temps, afin de déterminer si les modifications de l’ARNm du VIH-1 peuvent jouer un rôle dans la vitesse de traduction et l’efficacité du frameshift, nous utiliserons la technique de ribosome profiling afin de comparer la densité des ribosomes et leur position sur les ARNm modifiés et non modifiés. Cela me permettra également de définir la phase de lecture de chaque ribosome en cours de traduction et son temps de résidence sur chaque codon. En complément nous utiliserons des systèmes rapporteurs afin de quantifier in vitro l’efficacité du décalage de cadre de lecture en -1 sur des ARNm modifiés et non modifiés. Afin d’aller plus loin dans la compréhension du rôle des modifications de l’ARNm sur la traduction, nous utiliserons une approche permettant l’étude de la traduction en molécule unique. Grâce à ce système, nous obtiendrons une quantification précise du déplacement du ribosome sur l’ARNm du VIH-1 avec ou sans modifications et en particulier au niveau du site de décalage du cadre de lecture en -1.

L’objectif de ce projet est donc d’étudier de manière complète le rôle des modifications de l’ARNm du VIH-1 dans l’expression des gènes viraux et dans la réplication du virus. Cela pourrait faire naître de nouvelles cibles thérapeutiques parmi les enzymes responsables de ces modifications capables d’impacter la pathogénicité du VIH-1.

Le virus de l’hépatite E (HEV) est responsable de plus de 20 millions d’infections et 70000 décès par an. Cette infection provoque des hépatites aiguës mais peut devenir chronique chez les patients immunodéprimés ou fulminante notamment chez les femmes enceintes. En raison de l’évolution vers la chronicité, sa transmission par transfusion sanguine, du nombre croissant de cas et des complications chez les patients souffrant d’une maladie hépatique préexistante, l’infection par le HEV est désormais considérée comme un problème émergent dans les pays industrialisés. L’immunité innée via la production d’interféron de type I (IFN-I) est essentielle pour le contrôle en phase aiguë et précoce des infections virales. Des données in vitro suggèrent que le HEV a probablement mis en place des mécanismes lui permettant d’inhiber la réponse antivirale de l’hôte. Cependant, notre connaissance est encore très partielle. Paradoxalement, les molécules induites par la réponse IFN-I sont détectées chez les patients infectés et les animaux expérimentalement infectés. Ceci implique donc l’existence des mécanismes alternatifs de détection des cellules infectées, pouvant contourner l’inhibition dans les cellules infectées. Dans le contexte d’autres infections virales, nous avons récemment découvert un mécanisme de reconnaissance des cellules infectées pas un type de cellules immunitaires spécialisées pour la production d’IFN-I, les cellules dendritiques plasmacytoïdes (pDCs). De manière intéressante, nos résultats préliminaires montrent que les pDCs détectent les cellules infectées par le HEV par contact cellulaire induisant la production d’une quantité massive d’IFN-I.

Ainsi, nous proposons un projet visant à définir la modulation de la réponse IFN-I par le HEV et en particulier par la protéine de capside ORF2. En effet, nous avons récemment démontré qu’au cours du cycle viral, le HEV produit distinctes formes de la protéine de capside ORF2, présentant des modifications co- et post-traductionnelles différentes. Ces formes ORF2 sont : i) la forme ORF2i (infectieuse) associée aux particules infectieuses et ii) les formes ORF2g (glycosylée) et ORF2c (clivée) qui ne sont pas associées à du matériel infectieux, mais produites massivement et sont les antigènes viraux majeurs présents dans le sérum des patients infectés par le HEV. Ces formes ORF2 ont des localisations subcellulaires distinctes : ORF2i est cytosolique ou nucléaire, alors que les formes ORF2g/c sont principalement réticulaires. De plus, nos résultats préliminaires suggèrent que la translocation nucléaire d’ORF2i inhibe l’expression de plusieurs gènes appartenant aux signalisations antivirales ou inflammatoires, en lien avec l’activateur transcriptionnel NF-kB. Ainsi, nous proposons que les différentes formes de l’ORF2 moduleraient distinctivement les réponses innées dans les cellules infectées ainsi que par les pDCs. Nous avons alors pour objectifs de définir :

-comment les différentes formes et localisations subcellulaires d’ORF2 influencent le profil d’expression des gènes dans les cellules infectées (Aim I).

-comment la réponse IFN-I par les pDC est activée et régulée par l’infection par le HEV (Aim II). Nous étudierons notamment comment les différentes formes d’ORF2 modulent les fonctions des pDC et quel est l’impact de la signalisation antivirale par les pDC sur la réplication du HEV et les réponses antivirales dans les cellules infectées.

La production, à partir d’un gène unique codant pour la capside virale, de multiples formes d’ORF2 ayant des localisations différentes est un aspect original et nouvellement découvert. Notre projet permettra d’identifier de nouveaux mécanismes de régulation de la réponse antivirale par le HEV. Dans une perspective plus large, notre projet permettra d’acquérir de nouvelles connaissances sur la biologie des pDC, notamment sur la modulation par des glycoprotéines virales. Les résultats obtenus serviront de cadre d’étude pour d’autres virus connus pour sécréter de larges quantités de glycoprotéines. Outre ces avancées en recherche fondamentale, nos travaux contribueront à définir de cibles pour le développement de traitements thérapeutiques.

Près de 38 millions de personnes dans le monde sont infectés par le virus de l’immunodéficience humaine (VIH). Face à cette pandémie, des traitements antirétroviraux existent, auxquels certains patients deviennent cependant résistants. Le but de notre projet est d’identifier des inhibiteurs d’une nouvelle cible thérapeutique, la capside du VIH-1 (p24VIH-1), avec un coût de production limité car le prix élevé des traitements est un frein à leur accès dans de nombreux pays.

Des expériences préliminaires nous ont permis d’identifier, parmi les composés à faible coût de synthèse de la chimiothèque de l’équipe partenaire, deux molécules capables d’inhiber la réplication du VIH-1 in cellulo. L’une de ces deux molécules, le composé 696, est apparue comme se fixant dans la zone de la capside du VIH-1 ciblée par le lenacapavir, le premier médicament anti-VIH-1 ciblant p24VIH-1 à avoir vu son usage thérapeutique autorisé par l’Agence Européenne du Médicament en août 2022.

En parallèle, un criblage virtuel assisté par un algorithme d’intelligence artificielle (IA) a permis d’identifier 84 molécules se fixant dans cette même zone et donc candidats inhibiteurs du VIH-1. Nous avons testé dix de ces 84 molécules in cellulo, ce qui nous a permis d’observer que deux d’entre elles présentent un potentiel inhibiteur intéressant.

Pour ce projet, nous allons terminer le criblage in cellulo des molécules identifiées par IA in silico. Nous allons également synthétiser des dérivés du composé 696 à faible coût de synthèse, visant à améliorer l’interaction avec p24VIH-1, qui seront ensuite criblés in cellulo. Tous les composés qui auront été identifiés comme inhibiteurs in cellulo seront alors évalués de façon plus approfondie, notamment par des études structurales, pour comprendre leur mécanisme moléculaire d’inhibition. Ceci permettra des optimisations des molécules tête de série qui permettent d’améliorer leur interaction avec p24-VIH1, en gardant comme objectif un coût minimal de synthèse. Tous ces dérivés seront alors synthétisés puis testés in cellulo de façon systématique.

Ainsi, ce projet permettra d’identifier des candidats inhibiteurs prometteurs et à faible coût de synthèse ciblant la capside du VIH-1.